Avainero LAMP- ja PCR-testin välillä on, että LAMP suoritetaan vakiolämpötilassa (60-650C) DNA-kopioiden tuottamiseksi monistuksen kautta, kun taas PCR suoritetaan käyttämällä sarjaa lämpötilanmuutoksia DNA-kopioiden tuottamiseksi monistuksen kautta.
LAMP ja PCR ovat molemmat in vitro -monistustekniikoita, joita käytetään tuhansien DNA-kopioiden tuottamiseen. LAMP:ssa tuotetun DNA:n määrä on paljon suurempi kuin PCR-tekniikoilla, kuten RT-PCR:llä, tuotettu määrä. LAMP on uudempi tekniikka verrattuna PCR-tekniikkaan. Mutta se on teknisesti yksinkertaista ja koulutetun tutkijan helppoa suorittaa laboratorio-olosuhteissa. Tämä tekee siitä mahdollisesti hyödyllisen tekniikan COVID-19:n havaitsemiseen. RT-PCR on kuitenkin nykyinen vakiotesti COVID-19:lle. Vaikka nämä tekniikat ovatkin hyvin tuttuja DNA-monistuksen taustalla oleville tutkijoille ja kliinikoille, ne voivat silti olla suhteellisen tuntemattomia laajemmalle yhteisölle.
Mikä on LAMPUTESTI?
Silmukkavälitteinen isoterminen monistus (LAMP) COVID-19-määrityksissä alkaa keräämällä näytteitä nenästä tai kurkusta vanupuikolla. Näytteet voidaan kerätä myös muilla menetelmillä, kuten kovan yskimisen limalla. Kuten PCR-tekniikassa, kuten RT-PCR:ssä, näytteessä oleva virus-RNA muunnetaan ensin DNA:ksi, mikä mahdollistaa sen kopioimisen. LAMP-reaktio suoritetaan vakiolämpötilassa (60-650C).
LAMP-teknologiaa ja reagensseja sisältävän virus-DNA:n monistuminen voidaan havaita, kun reaktioseos muuttuu sameaksi "magnesiumpyrofosfaatin" tuotannon vuoksi. Tämä pilvisyys mahdollistaa tutkijoiden ja kliinikkojen helpon diagnosoinnin COVID-19:stä. Testitulosten tarkkuutta voidaan parantaa käyttämällä reaktioseoksessa erityisiä fluoresoivia tai väriä vaihtavia väriaineita. Nämä väriaineet ovat vuorovaikutuksessa virus-DNA:n kanssa, ja valon tai värinmuutoksen voimakkuus voidaan mitata, jotta saadaan viruksen RNA-molekyylien määrä suunnilleen sama kuin alun perin näytteessä.
Mikä on PCR-testi?
PCR on hyvin yleinen tieteellinen tekniikka, jota on käytetty laajasti tutkimuksessa ja lääketieteessä 20-30 vuoden ajan DNA:n havaitsemiseksi. PCR-testejä käytetään suoraan antigeenin havaitsemiseen havaitsemalla viruksen RNA. Yleensä viruksen RNA:ta on kehossa ennen vasta-aineiden havaitsemista tai taudin oireiden saamista. Siksi PCR-testi voi kertoa, onko jollakulla virus varhain. Tällä hetkellä PCR on vakiotesti COVID-19:n havaitsemiseksi. On olemassa erilaisia PCR-tekniikoita, kuten reaaliaikainen PCR, sisäkkäinen PCR, multipleksinen PCR, kuumakäynnistys-PCR ja pitkän kantaman PCR jne. PCR käyttää useita lämpötilamuutoksia tuottaakseen kopioita DNA:sta monistuksen kautta.
RT-PCR on PCR-tekniikan erikoisversio. Sitä käytetään, kun RNA:ta havaitaan. Sitä käytetään nyt COVID-19-testaukseen. RT-PCR on melko herkkä ja luotettava tekniikka. RT-PCR:ssä, kun näyte on kerätty, kemikaaleja käytetään poistamaan ei-toivottuja proteiineja, rasvoja ja muita molekyylejä, jolloin RNA jätetään taakse. Testisarjan entsyymit muuntavat ensin RNA:n DNA:ksi, joka sitten monistaa viruksen DNA:ta viruksen havaitsemiseksi. Fluoresoivia väriaineita käytetään tyypillisesti sitoutumaan monistettuun DNA:han ja tuottamaan valoa. Kone voi lukea tämän testituloksen saamiseksi.
Mitä yhtäläisyyksiä LAMP- ja PCR-testin välillä on?
- Ne ovat vahvistustekniikoita.
- Molemmat tuottavat kopioitua DNA:ta.
- Ne ovat erittäin herkkiä ja luotettavia tekniikoita kuin immuunitekniikka, kuten vasta-aineiden havaitseminen.
- Molempia käytetään COVID-19-testaukseen.
Mitä eroa LAMP- ja PCR-testillä on?
Avainero LAMP- ja PCR-testien välillä on se, että LAMPissa monistus saavutetaan käyttämällä vakiolämpötilaa (60-650C), kun taas PCR:ssä jaksotetaan lämpötiloja tarvitaan. Tällä hetkellä saatavilla on useita LAMP-tekniikoita. Mutta tärkeimmät COVID-19:n havaitsemisessa ovat käänteistranskriptiosilmukkavälitteinen isoterminen tekniikka (RT-LAMP) ja transkriptiovälitteinen vahvistus (TMA). Lisäksi kliinisessä käytännössä on tällä hetkellä saatavilla erilaisia PCR-tekniikoita sairauksien diagnosointiin, kuten reaaliaikainen PCR, RT-PCR, sisäkkäinen PCR, multipleksinen PCR, hot-start PCR, pitkän kantaman PCR jne.
Alla oleva infografiikka luettelee LAMP- ja PCR-testin erot taulukkomuodossa.
Yhteenveto – LAMP vs PCR-testi
Silmukkavälitteinen isoterminen monistus on samanlainen prosessi kuin PCR-testit, kuten RT-PCR, mutta se tuottaa enemmän virus-DNA-kopioita vakiolämpötilassa. Polymeraasiketjureaktiotesti on tällä hetkellä maailman yleisin ja vakiomuotoisin sairauksien, kuten COVID-19-diagnoosin, testausmuoto. Sitä pidetään melko luotettavana. PCR käyttää useita lämpötilamuutoksia tuottaakseen kopioita DNA:sta monistuksen kautta. Näin ollen tämä tiivistää eron LAMP- ja PCR-testin välillä.
