Peptidi vs proteiini
Aminohappoja, peptidejä ja proteiineja kutsutaan usein sukulaistermeiksi, mutta ne eroavat ominaisuuksiltaan. Aminohapot ovat sekä peptidien että proteiinien rakennuspalikoita. Aminohappo on pieni molekyyli, joka sisältää aminoryhmän (-NH2) ja karboksyylihapporyhmän (-COOH), jotka ovat sitoutuneet keskushiiliatomiin, lisävedyn ja sivuketju (R-ryhmä). Tämä sivuketju vaihtelee kaikkien aminohappojen kesken; siksi se määrittää kunkin aminohapon ainutlaatuiset merkit ja kemian. Sekä peptidien että proteiinien aminohapposekvenssin määrittämiseen käytetään tiettyä geenisekvenssiä.
Peptide
Peptidit koostuvat kahdesta tai useammasta aminohaposta, jotka on yhdistetty peptidisidoksilla ja ovat läsnä lineaarisina ketjuina. Peptidin pituus määräytyy siinä olevien aminohappojen määrän mukaan. Yleensä peptidin pituus on alle noin 100 aminohappoa.
Etuliitteitä käytetään kuvaamaan peptidityyppiä yleisessä terminologiassa. Esimerkiksi kun peptidi koostuu kahdesta aminohaposta, sitä kutsutaan dipeptidiksi. Näin ollen kolme aminohappoa yhdistetään tripeptideiksi, neljä aminohappoa yhdistetään tetrapeptideiksi jne. Näiden tyyppien lisäksi on oligopeptidejä (joissa on 2-20 aminohappoa) ja polypeptidejä, joissa on monia peptidejä (vähemmän). kuin 100). Peptidien tärkeimmät ominaispiirteet määräytyvät aminohappojen määrän ja sekvenssin mukaan.
Useimpien peptidien ensisijainen tehtävä on mahdollistaa tehokas viestintä kuljettamalla biokemiallisia viestejä kehon paikasta toiseen.
Proteiini
Proteiinit ovat monimuotoisin ryhmä biologisia makromolekyylejä. Proteiini koostuu yhdestä tai useammasta pitkästä haarautumattomasta ketjusta, joita kutsutaan polypeptideiksi, ja silti proteiinien rakennuspalikoita ovat aminohapot. Aminohapposekvenssi määrittää proteiinin tärkeimmät ominaisuudet, kun taas tämän aminohapposekvenssin määrittää tietty geenisekvenssi.
Yleensä proteiineilla on vakaa kolmiulotteinen rakenne. Näistä rakenteista voidaan keskustella neljän tason hierarkiassa; primaarinen, sekundaarinen, tertiäärinen ja kvaternäärinen. Päärakenne on proteiinin aminohapposekvenssi. Toissijainen rakenne tuotetaan muodostamalla vetysidoksia kahden lähellä olevan aminohapon välille, jolloin tuloksena on rakenteita, joita kutsutaan β-pinnoitetuiksi levyiksi ja käämeiksi, joita kutsutaan α-heliksiksi. Toissijaisen rakenteen alueet laskostetaan sitten edelleen avaruudessa proteiinin lopullisten kolmiulotteisten rakenteiden muodostamiseksi. Useiden polypeptidien järjestäytyminen avaruudessa johtaa proteiinin kvaternaariseen rakenteeseen.
Proteiinien tärkeimmät toiminnot ovat entsyymikatalyysi, puolustus, kuljetus, tuki, liike, säätely ja varastointi.
Mitä eroa on peptidillä ja proteiinilla?
• Peptidit ovat lyhyitä lineaarisia aminohappoketjuja, kun taas proteiinit ovat erittäin pitkiä aminohappoketjuja.
• Useat aminohapot kytkeytyvät toisiinsa muodostaen peptidin peptidisidoksilla, kun taas useat peptidit liittyvät toisiinsa muodostaen proteiinimolekyylejä.
• Normaalisti proteiineilla on vakaat kolmiulotteiset rakenteet. Sitä vastoin peptidit eivät ole organisoituneet vakaaseen kolmiulotteiseen rakenteeseen.
• Peptidin pituus on alle noin 100 aminohappoa, kun taas proteiinin pituus on yli 100 aminohappoa. (Poikkeuksiakin on, joten erot riippuvat enemmän molekyylien toiminnasta kuin niiden koosta)
• Toisin kuin peptidit, proteiineja pidetään makromolekyyleina.
• Peptideissä vain aminohappojen sivuketjut muodostavat vetysidoksia. Kun taas proteiineissa ei vain sivuketjut, vaan myös peptidiryhmät muodostavat vetysidoksia. Nämä vetysidokset voivat olla veden tai muiden peptidiryhmien kanssa.
• Kaikki peptidit ovat lineaarisina ketjuina, kun taas proteiinit voivat esiintyä primäärisinä, sekundaarisina, tertiäärisinä ja kvaternaarisina.
