Avainero rakenteellisen ja toiminnallisen genomiikan välillä on se, että rakennegenomiikka tutkii genomien fysikaalista luonnetta, mukaan lukien genomien sekvensointi ja kartoitus, kun taas toiminnallinen genomiikka tutkii genomin ilmentymistä ja toimintaa.
Genomiikka on biologian ala, joka koskee elävien organismien genomien rakennetta, organisaatiota, toimintaa, kehitystä ja kartoittamista. Se sisältää myös genomien sekvensoinnin, organismin koodaamien proteiinien täydellisen sarjan määrittämisen sekä geenien ja aineenvaihduntareittien toiminnan organismissa. Yksinkertaisesti sanottuna genomiikka on laajamittaista geeniryhmän tutkimusta. Siksi tutkimukset tehdään genomin tasolla. Rakennegenomiikka ja toiminnallinen genomiikka ovat genomiikan kaksi päähaaraa. Rakennegenomiikka keskittyy genomin koko geenijoukon karakterisointiin ja sijainnin tarjoamiseen. Sitä vastoin toiminnallinen genomiikka keskittyy toimintoon ja ominaisuuteen.
Mitä on rakennegenomiikka?
Rakennegenomiikka on genomin fyysisen luonteen tutkimista. Siksi rakenteellinen genomiikka koskee pääasiassa genomien sekvensointia ja kartoittamista. Organismin genomien täydellinen sekvenssi tai täydellinen proteiinisarja määräytyy rakenteellisella genomiikalla. Geneettisiä ja fyysisiä karttoja rakennetaan rakennegenomiikassa. Lisäksi rakenteelliseen genomiikkaan kuuluu myös genomin sekvensointi ja kunkin genomin geenien koodaaman proteiinin kolmiulotteisen rakenteen määrittäminen.
Mitä on toiminnallinen genomiikka?
Funktionaalinen genomiikka on genomiikan osa, joka käsittelee geenien ilmentymistä ja niiden toimintoja. Se koskee myös geenien ilmentymismallia ja aineenvaihduntareittejä. Funktionaalinen genomiikka käyttää v altavaa määrää genomiprojektien tuottamaa dataa geenien toimintojen ja vuorovaikutusten kuvaamiseen.
Geenitoimintoja määritettäessä genomiikassa analysoidaan myös transkriptio ja translaatio. Ekspressioprofilointi analysoi, milloin ja missä tietyt geenit ilmentyvät. Tiettyjen geenien toiminnan määrittäminen tapahtuu mutatoimalla halutut geenit selektiivisesti.
Mitä ovat rakenteellisen ja toiminnallisen genomiikan yhtäläisyydet?
- Rakenne ja toiminnallinen genomiikka ovat genomiikan kaksi päähaaraa.
- Molemmat tutkimukset keskittyvät genomien eri puoliin.
Mitä eroa on rakenteellisella ja toiminnallisella genomilla?
Rakennegenomiikka on tutkimus, jossa yritetään sekvensoida koko genomi ja kartoittaa genomi, kun taas toiminnallinen genomiikka on tutkimus, joka yrittää määrittää kaikkien organismin genomin koodaamien geenituotteiden toiminnan. Siksi rakenteellinen genomiikka koskee pääasiassa genomin sekvensointia ja kartoittamista, kun taas toiminnallinen genomiikka keskittyy pääasiassa genomin ilmentymisen ja toiminnan tutkimiseen. Joten tämä on avainero rakenteellisen ja toiminnallisen genomiikan välillä. Lisäksi rakenteellinen genomiikka määrittää genomin fyysisen luonteen, kun taas toiminnallinen genomiikka määrittää kaikkien geenien ilmentymisen ja niiden toiminnot.
Alla infografiassa on lisätietoja rakenteellisen ja toiminnallisen genomiikan eroista.
Yhteenveto – Rakenne vs toiminnallinen genomiikka
Rakenne ja toiminnallinen genomiikka ovat genomiikan kaksi aluetta. Rakennegenomiikka keskittyy genomien sekvensointiin ja kartoittamiseen. Samalla kun se sekvensoi ja tarjoaa koko genomin geenijoukon sijainnin, se yrittää määrittää jokaisen genomin koodaaman proteiinin rakenteen. Funktionaalinen genomiikka puolestaan keskittyy geenien ilmentymiseen ja niiden toimintoihin ja ominaisuuksiin. Se yrittää määrittää geenien ja niiden tuotteiden vuorovaikutuksia. Siten tämä tiivistää eron rakenteellisen ja toiminnallisen genomiikan välillä.
