Avainero – genomiikka vs proteomiikka
Genomiikka ja proteomiikka ovat kaksi tärkeää molekyylibiologian haaraa. Genomi on organismin geneettinen materiaali. Se sisältää geenejä, jotka on kirjoitettu organismien geneettisellä tiedolla (geneettiset koodit). Genomia koskevien tietojen löytämiseksi tehtyjä tutkimuksia kutsutaan genomiikaksi. Geenin nukleotidisekvenssi määrittelee proteiinin aminohapposekvenssin geneettisen koodin kautta. Geenit transkriptoidaan mRNA:ksi ja mRNA transloidaan tarvittavien proteiinien tuottamiseksi. Proteomi edustaa organismin ilmentyneiden proteiinien kokonaismäärää. Tutkimuksia, jotka on tehty solussa olevan koko proteiinijoukon ominaisuuksien, rakenteiden, toimintojen ja ilmentymien löytämiseksi, kutsutaan proteomiikaksi. Siten keskeinen ero genomiikan ja proteomiikan välillä on se genomiikka on molekyylibiologian osa, joka tutkii organismin geenejä, kun taas proteomiikka on molekyylibiologian haara, joka tutkii solun kokonaisproteiineja. Genomitutkimukset ovat tärkeitä organismin geenien rakenteen, toiminnan, sijainnin ja säätelyn ymmärtämiseksi. Proteomiikkatutkimukset ovat hyödyllisempiä, koska proteiinit ovat todellisia toiminnallisia molekyylejä soluissa ja edustavat todellisia fysiologisia olosuhteita.
Mikä on genomiikka?
Genomiikka on organismin koko genomin tutkimus. Se on tärkeä molekyylibiologian haara, joka käsittelee yhdistelmä-DNA-teknologiaa, DNA-sekvensointia ja bioinformatiikkaa genomin (organismien täydellisen DNA-sarjan) rakenteen ja toiminnan tutkimiseksi. DNA koostuu neljästä emäksestä, ja geenin sisältämä geneettinen informaatio on kirjoitettu neljällä peruskielellä, joita tarvitaan organismin syntymiseen. Geenit ovat vastuussa proteiinien valmistamisesta, ja ne ovat DNA:n yksiköitä, jotka sisältävät ohjeet tietyn proteiinin tai proteiinisarjan valmistamiseksi solussa. Siten geeneistä tehdyt tutkimukset ovat todella tärkeitä monimutkaisten sairauksien, geneettisten häiriöiden, mutaatioiden, tärkeiden geenisääntelyjen, geenien ja ympäristötekijöiden välisten vuorovaikutusten, sairauksien diagnoosin, hoitojen ja hoitojen kehittämisen yms. ymmärtämisen kann alta. Siten genomitutkimukset ovat erittäin tärkeitä. tärkeä, koska se koskee kaikkia geenejä ja niiden vuorovaikutusta ja käyttäytymistä.
Kuva 01: Genomiikan käyttö
Mikä on proteomiikka?
Proteiinit ovat välttämättömiä soluissa olevia makromolekyylejä. Ne ovat tärkeitä monille organismissa esiintyville fysiologisille toiminnoille. Lähes kaikkia biokemiallisia reaktioita katalysoivat soluissa olevat proteiinit. Geenit tallennetaan geneettisten ohjeiden kanssa proteiinien tuottamiseksi. Geneettinen koodi muunnetaan aminohapposekvenssiksi, joka määrittää tietyn proteiinin. Tämä prosessi on tunnettu geeniekspressio. Tarvittaessa geenejä ekspressoidaan ja syntetisoidaan proteiineina. Solun koko proteiinisarja tunnetaan nimellä proteomi. Solun proteomin tutkimus tunnetaan proteomiikkana. Proteiinien rakenteita, ominaisuuksia, vuorovaikutuksia ja toimintoja tutkitaan proteomiikan alla selvittääkseen, miten proteiinit vaikuttavat solun prosesseihin.
Organismit sisältävät tuhansia erilaisia proteiineja, jotka palvelevat erilaisia toimintoja soluissa. Genomitutkimukset tarjoavat avaintietoa proteomisten tutkimusten suorittamiseen, koska geenit koodaavat mRNA-molekyylejä ja mRNA koodaa proteiineja. Proteomiikan opinnot ovat tärkeitä monilla aloilla; tämä on erityisen hyödyllistä syöpäbiologiassa, jossa sitä voidaan käyttää paljastamaan epänormaaleja proteiineja, jotka johtavat syöpään.
Kuva 02: Proteiinisynteesi
Mitä eroa on genomiikassa ja proteomiikassa?
Genomiikka vs. Proteomiikka |
|
| Genomiikka on organismin genomin tutkimus. Geenejä tutkitaan genomiikassa. | Proteomiikka on solun kokonaisten proteiinien tutkimus. Proteiineja tutkitaan proteomiikan alla. |
| Opiskelualueet | |
| Genomiikka kattaa genomikartoituksen, sekvensoinnin, ilmentymisanalyysin, geenirakenneanalyysin jne. | Proteomiikka kattaa proteiinien karakterisoinnin, proteiinien rakenteen ja toiminnan tutkimuksen jne. |
| Luokittelu | |
| Kaksi päätyyppiä, rakenteellinen genomiikka ja toiminnallinen genomiikka. | Kolme pääluokkaa: rakenteellinen proteomiikka, toiminnallinen proteomiikka ja ilmentymisproteomiikka. |
| Oppimateriaalin luonne | |
| Genomi on vakio. Jokaisella organismin solulla on samat geenit. | Proteome on dynaaminen ja vaihtelee. Eri kudoksissa tuotettujen proteiinien joukko vaihtelee geenin ilmentymisen mukaan. |
Yhteenveto – Genomiikka vs proteomiikka
Genomiikka on organismin täydellisen genomin tutkimus. Proteomiikka on molekyylibiologian haara, joka tutkii solussa ilmentyvää täydellistä proteiinisarjaa ymmärtääkseen proteiinien rakennetta ja toimintaa sekä proteiinien vaikutusta solun prosesseihin. Genomiikka ei voi selittää solujen todellisia olosuhteita proteiinisynteesin aikana tapahtuneiden translaation jälkeisten modifikaatioiden vuoksi. Siksi proteomiikka on tärkeää todellisten olosuhteiden ja solujen toimintojen ymmärtämiseksi. Tämä on ero genomiikan ja proteomiikan välillä.
