Avainero – malli vs. koodausosio
DNA toimii monissa organismeissa tiedon varastona, kun taas RNA toimii sanansaattajana. RNA:n synteesiprosessi DNA:sta tunnetaan transkriptiona, joka ohjaa geenien ilmentymistä ja proteiinien tuotantoa monissa biologisissa järjestelmissä. Tässä prosessissa kahdelle DNA-säikeelle annetaan erityiset nimet niiden osallistumisen perusteella. Templaattijuoste on DNA-juoste, joka toimii templaattina RNA-synteesille, kun taas toista juostetta kutsutaan koodaavaksi juosteeksi. Keskeinen ero näiden kahden juosteen välillä on se, että templaattijuosteessa on vastakkainen RNA:n emässekvenssi, kun taas koodaavalla juosteella on sama RNA:n emässekvenssi (lukuun ottamatta tymiiniä urasiilin sijaan). Kaikki solun DNA-säikeet eivät transkriptoidu RNA:ksi. Transkriptio syntetisoi kaikki RNA-tyypit, mukaan lukien mRNA, tRNA, rRNA, snRNA, miRNA ja siRNA. RNA-transkriptiossa on vähän eroja prokaryoottien ja eukaryoottien välillä. Esimerkiksi eukaryooteissa transkriptioprosessi on paljon monimutkaisempi kuin prokaryooteissa johtuen suuresta määrästä transkriptiotekijöitä. Tämän artikkelin tavoitteena on kuitenkin ilmaista ero mallinauhan ja koodaavan juosteen välillä.
Mikä on Template Strand?
Templaattijuoste on DNA-juoste, joka toimii templaattina RNA:n synteesille. RNA-polymeraasi lukee tämän juosteen 3':sta 5:een. Mallinauha ei liity koodaukseen, joten sitä kutsutaan ei-koodaavaksi juosteeksi. Templaattijuosteen nukleotidisekvenssi on komplementaarinen mRNA-molekyylille ja koodaavalle juosteelle.
Mikä on Coding Strand?
Koodaava juoste määrittää RNA-juosteen sekvenssin. Koodaavalla juosteella on sama RNA:n nukleotidisekvenssi, lukuun ottamatta urasiilia tymiinin sijasta. Koodaavaa juostetta kutsutaan myös sense-juosteeksi, koska se määrittää RNA-sekvenssin, joka lopulta koodaa tiettyä proteiinin aminohapposekvenssiä. Tämä säie lukee ohjaajassa 5' päästä 3' päähän. 5'-pää sisältää fosfaattiryhmän kiinnittyneenä 5'-hiiliatomiin, kun taas 3'-päässä on fosfaattiryhmä kiinnittyneenä 3'-hiiliatomiin tai hydroksyyliryhmään, jos se on DNA-ketjun päässä.
Mitä eroa on mallin ja koodausosion välillä?
Toiminto:
Mallinauha: Mallinauha toimii RNA-synteesin templaattina.
Koodaava juoste: Koodaavalla juosteella on sama sekvenssi kuin vasta syntetisoidulla RNA:lla.
Muut nimet:
Mallinauha: Mallinauhaa kutsutaan myös antisense-säikeeksi tai [-]-säikeeksi.
Koodausjuoste: Koodaava säie tunnetaan sense-säie-, [+]- tai ei-template-säikeenä.
Perussekvenssi:
Mallinauha: Mallinauha on komplementaarinen syntetisoidulle RNA:lle.
Koodaava juoste: RNA-sekvenssi on sama kuin koodaava DNA-juoste, jossa on tymiiniä urasiilin sijaan.
