Avainero TATA- ja CAAT-boxin välillä on, että TATA-box on konservoitunut nukleotidialue, jolla on TATAWAW:n konsensussekvenssi, kun taas CAAT-box on konservoitunut nukleotidialue, jonka konsensussekvenssi on GGCCAATCT.
TATA box ja CAAT box ovat kaksi nukleotidialuetta, jotka vaikuttavat eukaryoottisten geenien transkriptioon. Ne ovat ei-koodaavia DNA-sekvenssejä, jotka löytyvät ylävirtaan transkription aloituskohdasta. Itse asiassa niitä löytyy säätelyalueelta, joka tunnetaan promoottorina. Sekä TATA-laatikko että CAAT-laatikko ovat vastuussa transkription tehokkuudesta. Ne ovat konsensussekvenssejä, jotka eivät ole muuttuneet evoluutioprosessin aikana.
Mikä on TATA Box?
TATA box tai Goldberg-Hogness box on konsensussekvenssi, joka löytyy eukaryoottigeenien promoottorialueelta. TATA-laatikko on promoottorin ydinelementti. Se sijaitsee 25 emäsparia ylävirtaan transkription aloituskohdasta. Se säilyy koko evoluutioprosessin ajan. TATA-laatikon konsensussekvenssi on TATAWAW, jossa W on joko A tai T. Se on ei-koodaava DNA-sekvenssi. TATA-laatikko on kuitenkin tärkeä geenin transkriptiolle. Se on TATA:ta sitovan proteiinin (TBP) ja muiden transkriptiotekijöiden sitoutumiskohta. Kun ne ovat sitoutuneet TATA-laatikkoon, RNA-polymeraasi II:n kerääntyminen ja transkription oikea säätely tapahtuu eukaryoottigeeneissä.
Kuva 01: TATA-laatikko
Koska TATA-box osallistuu transkription säätelyyn, TATA-boxin mutaatiot voivat johtaa fenotyyppisiin muutoksiin, jotka johtavat sairauksiin, kuten mahasyöpään, spinocerebellaariseen ataksiaan, Huntingtonin tautiin, sokeuteen, β-talassemiaan, immunosuppressioon, Gilbertin oireyhtymään, ja HIV-1 jne.
Mikä on CAAT Box?
CAAT-laatikko on nukleotidien alue, jolla on GGCCAATCT:n konsensussekvenssi. Samalla tavalla kuin TATA-box, CAAT-box sijaitsee myös geenin promoottorialueella. Siksi se sijaitsee noin 75-80 emäsparia ylävirtaan transkriptiopaikasta.
Kuva 02: CAAT-laatikko
Tietyt transkriptiotekijät sitoutuvat CAAT-laatikkoon. Tämä sitoutuminen stabiloi preiniitiaatiokompleksin helpottaen RNA-polymeraasientsyymin sitoutumista. Samoin CAAT-laatikko toimii säätösekvenssinä. Mutaatiot CAAT-laatikkoalueella vaikuttavat voimakkaasti promoottorivasteeseen ja transkription säätelyyn.
Mitä yhtäläisyyksiä TATA:n ja CAAT Boxin välillä on?
- TATA ja CAAT ovat kaksi nukleotidialuetta, jotka löytyvät eukaryoottisten geenien säätelysekvenssistä.
- Ne löytyvät ennen transkription aloituspaikkaa.
- Molemmat ovat konsensus-DNA-sekvenssejä.
- Ne ovat välttämättömiä transkription säätelylle, joten ne ovat säätelysekvenssejä.
Mitä eroa on TATA:n ja CAAT Boxin välillä?
TATA-laatikko on konservoitunut nukleotidialue, joka löytyy noin 25-30 emäsparia ylävirtaan transkription aloituskohdasta. Toisa alta CAAT-box on konservoitunut nukleotidialue, joka löytyy noin 75-80 emäsparia ylävirtaan transkription aloituskohdasta. Joten tämä on avainero TATA- ja CAAT-laatikon välillä. Lisäksi TATA-laatikossa on TATAWAW-konsensussekvenssi, kun taas GGCCAATCT on CAAT-laatikon konsensussekvenssi.
Lisäksi toinen merkittävä ero TATA- ja CAAT-boxin välillä on, että TATA-laatikko tarjoaa sitoutumiskohdan TBP:lle ja transkriptiotekijöille ja osallistuu transkription säätelyyn, kun taas CAAT-laatikko signaloi RNA-transkriptiotekijän sitoutumiskohdan.
Alla infografiassa on yhteenveto TATA- ja CAAT-laatikoiden eroista.
Yhteenveto – TATA vs CAAT Box
TATA-laatikko ja CAAT-laatikko ovat kaksi osaa eukaryoottisten geenipromoottorien konservoituneesta alueesta. Ne sijaitsevat ylävirtaan transkription aloituskohdasta. Molemmat vaikuttavat geenien transkriptioon tarjoamalla kohtia TATA:ta sitovien proteiinien ja transkription aloitustekijöiden sitoutumiselle. TATA-laatikko sijaitsee 25-35 emäsparia ylävirtaan transkription aloituskohdasta, kun taas CAAT-laatikko sijaitsee 75-80 emäsparia ylävirtaan transkription aloituskohdasta. TATA-laatikon konsensussekvenssi on TATAWAW, kun taas CAAT-laatikon konsensussekvenssi on GGCCAATCT. Näin ollen tämä on yhteenveto TATA- ja CAAT-laatikon välisestä erosta.
