Avainero NAAT:n ja PCR:n välillä on se, että NAAT monistaa geneettistä materiaalia useilla tavoilla, mukaan lukien polymeraasiketjureaktio, juosteen siirtyminen tai transkriptiovälitteinen monistus, kun taas PCR on menetelmä, joka monistaa geneettistä materiaalia käyttämällä vain lämpöpyöräily.
Patogeenit tunnistetaan pääasiassa niiden geneettisen materiaalin monistumisen perusteella. Suurin osa tämän alueen tekniikoista keskittyy patogeenin geneettisen materiaalin havaitsemiseen vahvistamalla tiettyjä sekvenssejä reaaliajassa. Siksi tulokset tuotetaan erittäin nopeasti diagnostisessa kontekstissa. NAAT, PCR, biosensori ja LCR ovat useita tekniikoita, joita käytetään laboratorioissa patogeenin geneettisen materiaalin monistamiseen.
Mikä on NAAT?
Nukleiinihappoamplifikaatiotesti (NAAT) on molekyylibiologian menetelmä, joka monistaa geneettistä materiaalia useilla tavoilla, kuten polymeraasiketjureaktiolla, juosteen syrjäytysamplifikaatiolla tai transkriptiovälitteisellä amplifikaatiolla. Geneettisen materiaalin monistaminen voidaan tehdä myös tekniikoilla, kuten ligaatioketjureaktio ja haarautunut DNA-reaktio (quantiplex b DNA) NAAT-menettelyssä. NAAT käyttää Watson-Crick-perusparisuhteen erityispiirteitä. NAAT-menettelyssä yksijuosteinen koetin tai alukemolekyyli hybridisoidaan kohde-DNA- tai RNA-molekyylin kanssa. Siksi koetinsäikeen suunnittelu on erittäin merkittävä havainnoinnin herkkyyden ja spesifisyyden parantamiseksi. Sitten NAAT:n seuraava vaihe vahvistaa geneettistä materiaalia tekemällä siitä useita kopioita havaitsemista varten.
Kuva 01: NAAT
NAAT:ta käytetään tällä hetkellä useiden patogeenien, kuten Neisseria gonorrhean, Chlamydia trachomatisin, Mycobacterium tuberculosisin ja SARS-COV2:n, havaitsemiseen. Lisäksi NAAT-testi on kehitetty lyhentämään ikkunajaksoa. Ikkunajakso on ajanjakso, joka kuluu siitä, kun potilas on saanut tartunnan, ja sen jälkeen, kun vasta-ainetestit osoittavat positiivisiksi. Lisäksi FDA hyväksyi NAAT-seulontamenetelmän ensimmäisen kerran vuonna 1999. NAAT:lla on monia etuja, kuten alhaisten DNA- tai RNA-tasojen havaitseminen, korkea herkkyys ja korkea spesifisyys.
Mikä on PCR?
PCR on molekyylibiologian menetelmä, joka vahvistaa geneettistä materiaalia käyttämällä vain lämpökiertoa. PCR tarkoittaa polymeraasiketjureaktiota. Se on testi, jolla havaitaan geneettistä materiaalia tietystä organismista, kuten bakteereista, sienistä ja viruksista. Taudin diagnosoinnissa PCR havaitsee taudinaiheuttajan läsnäolon, jos henkilöllä on taudinaiheuttaja testihetkellä. Sairauden diagnosoinnissa PCR-protokollassa on useita vaiheita, mukaan lukien näytteenotto, DNA:n uutto, PCR ja sekvensointi. Patogeenien testauksessa kerättyä näytettä käytetään geneettisen materiaalin (DNA tai RNA) erottamiseen. PCR-menettely vaatii erityisiä kemikaaleja, alukkeita ja entsyymejä tuottaakseen miljoonia kopioita geneettisestä materiaalista PCR-koneen sisällä, jota kutsutaan lämpösykliseksi. Kun patogeeni on monistettu PCR-tuotteesta, se voidaan havaita. Tutkijat käyttävät erityistä ohjelmistoa tulosten tulkitsemiseen.
Kuva 02: PCR
Lisäksi tutkimuksessa käytetään tällä hetkellä erilaisia PCR-menetelmiä. RT-PCR, Multiplex PCR, RAPD ja Nested PCR ovat useita niistä. PCR on käyttökelpoinen erityisesti nielutulehduksen (Streptococcl pharyngitis), epätyypillisen keuhkokuumeen (Chlymydia pneumoniae), tuhkarokkon (Morbillivirus), hepatiitin (HBV) ja haavaisen urogenitaalisen infektion (Haemophilus ducreyi) havaitsemisessa.
Mitä yhtäläisyyksiä NAAT:n ja PCR:n välillä on?
- NAAT ja PCR ovat kaksi tärkeää molekyylibiologista menetelmää, joita käytetään geneettisen materiaalin monistamiseen.
- Nukleiinihapot (DNA tai RNA) monistetaan molemmilla tekniikoilla.
- Ne ovat nopeita ja nopeita tekniikoita.
- Molempia tekniikoita käytetään tällä hetkellä sairauksien diagnosointiin.
- Ne ovat kalliimpia kuin perinteiset menetelmät.
Mitä eroa on NAAT:n ja PCR:n välillä?
NAAT on molekyylibiologian menetelmä, joka monistaa geneettistä materiaalia useilla menetelmillä, kun taas PCR on molekyylibiologian menetelmä, joka monistaa geneettistä materiaalia käyttämällä vain lämpökiertoa. NAAT käyttää erilaisia geneettisen materiaalin monistustekniikoita, kuten polymeraasiketjureaktiota, juosteen syrjäytysamplifikaatiota, transkriptiovälitteistä monistusta, ligaatioketjureaktiota ja haarautunutta DNA-reaktiota (quantiplex b DNA). Toisa alta PCR käyttää erilaisia geneettisen materiaalin monistustekniikoita, kuten RT-PCR:ää. Multiplex PCR, RAPD, sisäkkäinen PCR. Tämä on siis tärkein ero NAAT:n ja PCR:n välillä.
Alla oleva infografiikka esittelee NAAT:n ja PCR:n väliset erot taulukkomuodossa vierekkäin vertailua varten.
Yhteenveto – NAAT vs PCR
Laboratorioissa käytetään erilaisia molekyylibiologisia työkaluja geneettisten materiaalien vahvistamiseen. NAAT, PCR, biosensori ja LCR ovat useita tällaisia tekniikoita. NAAT on molekyylibiologinen tekniikka, joka monistaa geneettistä materiaalia useilla tavoilla, kuten polymeraasiketjureaktiolla, juosteen syrjäyttämisellä tai transkriptiovälitteisellä amplifikaatiolla. PCR on molekyylibiologian menetelmä, joka monistaa geneettistä materiaalia lämpökiertoa käyttämällä. Siten tämä on avainero NAAT:n ja PCR:n välillä.
