Avainero UTR:n ja intronin välillä on, että UTR on ei-koodaava nukleotidisekvenssi, joka sisältyy kypsään mRNA-sekvenssiin, kun taas introni on sekvenssi, joka ei sisälly kypsään mRNA-molekyyliin.
UTR tai transloimaton alue on ei-koodaava sekvenssi, joka löytyy mRNA-molekyylistä. mRNA-sekvenssin kummallakin puolella voimme nähdä yhden UTR:n. Siksi on olemassa kaksi UTR:ää, 5'UTR ja 3'UTR. Sitä vastoin introni on ei-koodaava sekvenssi, joka löytyy geenin eksonien väliltä. Intronit silmukoidaan pois mRNA:ta valmistettaessa. Tästä syystä introneita ei nähdä mRNA-sekvenssissä. Sekä UTR että intron ovat kuitenkin tärkeitä elementtejä eukaryoottigenomeissa.
Mikä on UTR?
UTR tai transloimaton alue on sekvenssi, joka on mRNA-sekvenssin kummallakin puolella. Siksi on olemassa kaksi UTR:ää. Toinen on 5'-puolella, ja se tunnetaan nimellä 5'UTR, kun taas toinen löytyy 3'-puolelta ja se tunnetaan nimellä 3'UTR. 5'UTR tunnetaan myös johtosekvenssinä, kun taas 3'UTR tunnetaan perävaunusekvenssinä. Rakenteellisesti 5' UTR löytyy ylävirtaan koodaavasta sekvenssistä, kun taas 3' UTR löytyy välittömästi translaation lopetuskodonin jälkeen. Lisäksi 5'UTR:n emäskoostumus eroaa 3' UTR:n emässekvenssistä. Yleensä 5′ UTR-sekvenssin G+C-sisältö on suurempi kuin 3′ UTR-sekvenssin. Kun mRNA-sekvenssi transloidaan aminohapposekvenssiksi, nämä kaksi UTR:ää jäävät transloimattomiksi.
Kuva 01: UTR:t
Kääntämättömillä alueilla on ratkaiseva rooli geeniekspression transkription jälkeisessä säätelyssä. Ne osallistuvat mRNA:n translaation, hajoamisen ja lokalisoinnin säätelyyn (mRNA:iden kuljetus tumasta). Lisäksi UTR:t ovat vastuussa mRNA:n stabiilisuudesta ja translaatiotehokkuudesta.
Mikä on intron?
Intronit ovat geenin nukleotidisekvenssejä, jotka eivät koodaa proteiineja. Siksi niitä kutsutaan ei-koodaaviksi sekvensseiksi. Ne sijaitsevat eksonien välissä. Intronit yhdessä eksonien kanssa transkriptoivat pre-mRNA-molekyyliksi. Koska ne eivät kuitenkaan ole mukana proteiinin geneettisessä koodissa, ne suljetaan pois RNA-molekyylistä RNA-silmukointiprosessin kautta. Jäljelle jäänyt RNA-sekvenssi tunnetaan nimellä mRNA tai kypsä mRNA-molekyyli. Siksi mRNA-molekyyli ei sisällä intronisekvenssejä. RNA:n silmukointi tapahtuu kahdella tavalla: cis-silmukointi ja trans-silmukointi. Cis-silmukointi tapahtuu, kun geenissä on yksi introni. Transsilmukointi tapahtuu, kun geenissä on kaksi tai useampia intronia.
Kuva 02: Intronit
Nämä sekvenssit voidaan nähdä sekä DNA:ssa että RNA:ssa. Tästä syystä termiä introni voitaisiin käyttää viittaamaan sekä DNA:n että RNA:n ei-koodaaviin sekvensseihin. On tärkeää huomata, että ribosomaalinen RNA (rRNA) ja siirto-RNA (tRNA) sisältävät myös geenejä, joissa on introneja. Mutta kuten DNA-transkriptio, kun rRNA- ja tRNA-geenit transkriptoivat, nämä ei-koodaavat sekvenssit suljetaan pois lopullisesta RNA-molekyylistä. Siksi näitä kutsutaan DNA:n kääntämättömiksi sekvensseiksi.
Intronien välitön toiminta on hieman epäselvä, mutta uskotaan, että ne ovat tärkeitä monimuotoisten, mutta samank altaisten proteiinien muodostamiseksi yhdestä geenistä. Intronivälitteinen geenin ilmentymisen tehostaminen on hyväksytty yhdeksi niiden toiseksi tärkeäksi tehtäväksi.
Mitä yhtäläisyyksiä UTR:n ja Intronin välillä on?
- UTR ja intron ovat ei-koodaavia nukleotidisekvenssejä, jotka eivät translatoidu.
- Molemmat sisältyvät geenirakenteeseen.
Mitä eroa on UTR:n ja Intronin välillä?
UTR tai transloimaton alue on nukleotidisekvenssi, joka löytyy kypsän mRNA-molekyylin kumm altakin puolelta. Samaan aikaan introni on ei-koodaava sekvenssi, joka löytyy geenistä eksonien välistä. Joten tämä on avainero UTR:n ja intronin välillä. UTR:itä ei silmukoidu, kun taas intronit silmukoidaan. Siksi introneita ei pidetä kääntämättöminä alueina. UTR:t osallistuvat geeniekspression transkription jälkeiseen säätelyyn, kun taas introneilla ei ole merkitystä geeniekspression transkription jälkeisessä säätelyssä.
Alla infografiikka taulukoi lisää eroja UTR:n ja intronin välillä.
Yhteenveto – UTR vs Intron
UTR ja intron ovat kahdenlaisia ei-koodaavia sekvenssejä. Mutta introni ei sisälly kypsään mRNA-sekvenssiin, koska intronit silmukoidaan pois RNA:n silmukointimekanismilla. UTR:t sisältyvät mRNA-sekvenssiin. Siten tämä on avainero UTR:n ja intronin välillä. Toiminnallisesti UTR:t ovat tärkeitä geeniekspression transkription jälkeisessä säätelyssä, kun taas intronit eivät ole tärkeitä tässä prosessissa.
