Avainero 16s- ja 18s-rRNA:n välillä on, että 16s-rRNA on osa 30S-alayksikköä prokaryoottisissa ribosomeissa, kun taas 18s-rRNA on osa 40S-alayksikköä eukaryoottisissa ribosomeissa.
Ribosomaalinen RNA tai rRNA on ribosomien rakennekomponentti. rRNA osallistuu proteiinisynteesimekanismiin. Eukaryoottien ja prokaryoottien ribosomit vaihtelevat. Eukaryooteilla on 80-luvun ribosomit, kun taas prokaryooteilla on 70-luvun ribosomit. rRNA-koostumus vaihtelee myös kahden ribosomin välillä. Eukaryoottisen ribosomin pienet alayksiköt sisältävät 18s rRNA:n, kun taas prokaryoottisen ribosomin pienet alayksiköt sisältävät 16s rRNA:ta.
Mikä on 16s rRNA?
16srRNA tai 16s ribosomaalinen RNA on osa prokaryoottisen ribosomin 30s alayksiköstä. Siksi se on osa ribosomin pientä alayksikköä. 16s rRNA:lla on tärkeä rooli translaatiomekanismin stabiloinnissa yhdessä ribosomin kanssa. 16s rRNA sitoutuu prokaryoottisen mRNA:n kiiltävään Dalgarno-sekvenssiin aloittaakseen translaation. Se sitoutuu myös 23s-rRNA:han muodostaen ribosomin pieniä ja suuria alayksiköitä.
Kuva 01: 16s rRNA
16s rRNA-geeni on läsnä kaikkien bakteerien genomissa. Se on pitkä, spesifinen ja erittäin konservoitunut alue bakteerigenomista. Siksi 16s-rRNA-alueen havaitseminen bakteereista on tärkeä vaihe bakteerien fylogeneettisessä tunnistamisessa. Tässä suhteessa universaaleja alukkeita voidaan suunnitella monistamaan 16s rRNA-aluetta, jota seuraa sekvensointi.
Mikä on 18s rRNA?
18s rRNA tai 18s ribosomaalinen RNA on osa eukaryoottista ribosomaalista alayksikköä 40s. Siten se on eukaryoottisen ribosomin pienen alayksikön komponentti. Ribosomiin liittyvällä 18s-rRNA:lla on tärkeä rooli translaation aloituksessa eukaryooteissa.
Kuva 02: 18s rRNA
18s rRNA:ta koodaava geeni on 18s rRNA-geeni. Tämän geenin sekvenssi on tärkeä molekyylianalyysissä organismien evoluutiohistorian rekonstruoimiseksi, koska ne ovat erittäin konservoituneita alueita. 18s rRNA:lla on korkea resoluutio taksonomisiin tutkimuksiin sienillä, joissa 18s rRNA:n sisäistä transkriptioaluetta (ITS) käytetään pääasiassa sienten monimuotoisuustutkimuksiin sienen viivakoodimarkkerina. ITS-aluetta käytetään enimmäkseen metagenomisessa analyysissä.
Mitä yhtäläisyyksiä on 16s ja 18s rRNA:n välillä?
- 16s ja 18s rRNA ovat osa ribosomin pientä alayksikköä.
- Sekä 16s että 18s rRNA löytyy sytoplasmasta.
- Molemmilla on vastaavat geenit tietyllä sekvenssillä.
- Lisäksi molemmat ovat tärkeitä käännöksen aloittamisessa.
- Niillä on tärkeä rooli fylogeneettisessä analyysissä.
- Lisäksi ne ovat tärkeitä lajien evoluution ennustamisessa.
Mitä eroa on 16s ja 18s rRNA:lla?
16s RNA löytyy komponenttina prokaryoottisen ribosomin 30-luvun alayksiköstä. 18s rRNA löytyy eukaryoottisen ribosomin 40s alayksikön komponenttina. Siten tämä on avainero 16s ja 18s rRNA:n välillä. 16s rRNA on läsnä prokaryooteissa, kun taas 18s rRNA on läsnä eukaryooteissa. Lisäksi geeni, joka koodaa 16s rRNA:ta, on tärkeä bakteerilajin tunnistamisessa ja taksonomiassa, kun taas 18s rRNA-geeni on tärkeä sienten tunnistamisessa ja luokittelussa.
Alla oleva infografiikka esittelee 16s ja 18s rRNA:n väliset erot taulukkomuodossa vierekkäin vertailua varten.
Yhteenveto – 16s vs 18s rRNA
Ribosomaalinen RNA tai rRNA ovat ribosomin rakennekomponentteja ja muodostavat laajoja sekundaarirakenteita mRNA:iden ja tRNA:iden konservoituneiden osien tunnistamisessa. 16srRNA on osa prokaryoottisen ribosomin 30-luvun alayksikköä. 18s rRNA on osa eukaryoottisen ribosomin 40s alayksikköä. Joten tämä on avainero 16s ja 18s rRNA:n välillä. Molemmat muodostavat kuitenkin osan ribosomin pientä alayksikköä. Sekä 16s- että 18s-rRNA:ta koodaavilla geeneillä on tärkeä rooli lajien fylogeneettisessä analyysissä, koska nämä geenit ovat erittäin konservoituneita.
