Avainero yhdensuuntaisten ja antirinnakkaisten beetalaskostettujen arkkien välillä on, että rinnakkaisissa beetalaskostetuissa levyissä polypeptidisäikeet kulkevat samaan suuntaan, kun taas antirinnakkaisissa beetalaskostetuissa levyissä vierekkäiset säikeet kulkevat vastakkaisiin suuntiin.
Beetalaskostettu levy tai beetalevy on yleinen proteiinien toissijainen rakenne. Beeta-säikeiden välillä on vetysidoksia, jotka muodostavat kierteisen laskostetun ulkonäön. Polypeptidijuoste voi kulkea samaan suuntaan tai päinvastaiseen suuntaan. Sen perusteella on olemassa kahta päätyyppiä beeta-laskostettuja arkkeja, yhdensuuntaisia betalaskostettuja arkkeja ja vastasuuntaisia betalaskostettuja arkkeja. Rinnakkaisissa beetalaskostetuissa levyissä on kaksi polypeptidinauhaa, jotka kulkevat samaan suuntaan. Antirinnakkaisissa beetalaskostetuissa levyissä polypeptidisäikeet kulkevat vastakkaisiin suuntiin.
Mitä ovat Parallel Beta -laskostetut arkit?
Rinnakkaisbeetalaskostetut levyt ovat beetalevyjä, joissa on kaksi polypeptidinauhaa, jotka kulkevat samaan suuntaan. Nämä toissijaiset rakenteet ovat vähemmän stabiileja kuin vastasuuntaiset beetalaskostetut levyt, koska vetysidokset rinnakkaisessa beeta-arkissa eivät ole lineaarisia. Jokaisessa vetysidoksessa renkaassa on 12 atomia rinnakkaisessa beetalevyssä.
Kuva 01: Rinnakkaiset beta-laskostetut arkit
Rinnakkaisissa beetalevyissä kaikki polypeptidinauhan N-päät on suunnattu samaan suuntaan. Alle viiden säikeen rinnakkaiset β-levyt ovat harvinaisia, koska säikeiden välillä on vähemmän stabiileja vetysidoksia.
Mitä ovat Antiparallel Beta -laskostetut arkit?
Antirinnakkaiset beetalaskostetut arkit ovat proteiinien toiseksi tärkein beeta-arkkityyppi. Antirinnakkaisissa beetalevyissä kaksi vierekkäistä polypeptidinauhaa kulkevat vastakkaiseen suuntaan. Atomien lukumäärä kussakin vetysidoksessa renkaassa vaihtelee 14:n ja 10:n välillä. Koska vetysidokset antirinnakkaisessa beetalevyssä ovat lineaarisia, se on vakaampi kuin rinnakkaiset beetalevyt.
Kuva 02: Antiparallel Beta laskostetut arkit
Antirinnakkaisissa beetalevyissä yhden juosteen N-pää on seuraavan juosteen C-pään vieressä. Tämä järjestely muodostaa vahvimman säikeiden välisen vakauden. Antirinnakkaiset β-levyt ovat natiiviproteiineja.
Mitä yhtäläisyyksiä rinnakkaisten ja vastasuuntaisten betalaskostettujen arkkien välillä on?
- Rinnakkaiset ja vastasuuntaiset betalaskostetut arkit ovat kaksi päätyyppiä beeta-arkkeja.
- Molemmissa tyypeissä polypeptidinauhat pysyvät yhdessä juosteiden välisen vetysidoksen avulla.
- Molemmat muodot näkyvät luonnollisissa proteiineissa.
- Ne ovat proteiinien toissijaisia rakenteita.
Mitä eroa on rinnakkaisilla ja vastasuuntaisilla betalaskostetuilla levyillä?
Rinnakkaisissa beetalaskostetuissa levyissä on kaksi polypeptidisäiettä, jotka kulkevat samaan suuntaan, kun taas antirinnakkaisissa beetalaskostetuissa levyissä on kaksi polypeptidisäiettä, jotka kulkevat vastakkaisiin suuntiin. Joten tämä on avainero rinnakkaisten ja vastasuuntaisten betalaskostettujen arkkien välillä. Lisäksi vetysidokset rinnakkaisissa beetalevyissä ovat vähemmän stabiileja, kun taas vetysidokset antirinnakkaisissa beetalevyissä ovat hyvin suunnattuja, vahvoja ja stabiileja.
Alla olevassa infografiikassa luetellaan erot rinnakkaisten ja vastasuuntaisten betalaskostettujen arkkien välillä taulukkomuodossa.
Yhteenveto – Rinnakkais vs antiparallel Beta-laskostetut arkit
Kaksi polypeptidijuostetta ulottuu samaan suuntaan rinnakkaisissa beetalevyissä. Sitä vastoin kaksi polypeptidijuostetta ulottuu vastakkaiseen suuntaan antirinnakkaisissa beetalaskosteisissa levyissä. Lisäksi atomien lukumäärä kussakin vetysidoksessa renkaassa rinnakkaisissa beetalevyissä on 12, kun taas se vuorottelee 14 ja 10 välillä antirinnakkaisissa beetalevyissä. Kun tarkastellaan kunkin beeta-arkkityypin stabiilisuutta, antirinnakkaiset beetalaskokset ovat vakaampia kuin rinnakkaiset beeta-arkit. Näin ollen tämä on yhteenveto rinnakkaisten ja vastasuuntaisten betalaskosten välisistä eroista.
