Avainero isoskitsomeerien ja isokaudomeerien välillä on se, että isoskitsomeerit tunnistavat ja katkaisevat saman restriktio- tai tunnistuskohdan, kun taas isokadomeerit tunnistavat hieman erilaiset restriktiokohdat ja pilkkoutuvat samasta kohdasta.
Restriktioentsyymit tai restriktioendonukleaasit ovat eräänlaisia nukleaaseja, jotka katkaisevat kaksijuosteista DNA:ta. He pystyvät tunnistamaan spesifisiä sekvenssejä, joita kutsutaan restriktiokohtiksi ja jotka ovat alkuperältään palindromia. Bakteerit tuottavat restriktioentsyymejä vieraita taudinaiheuttajia vastaan, erityisesti viruksia vastaan. Se on bakteerien osoittama puolustusmekanismi. Entsyymin rakenteesta ja leikkausten luonteesta riippuen on olemassa kolmenlaisia restriktioentsyymejä, kuten tyypin I restriktioentsyymejä, tyypin II restriktioentsyymejä ja tyypin II restriktioentsyymejä. Lisäksi biokemiallisesta aktiivisuudesta ja eristyslähteestä riippuen on olemassa kolmenlaisia restriktioentsyymejä, kuten isoskizomeereja, neoskizomeereja ja isokaudomeereja.
Mitä isoskitsomeerit ovat?
Isoskitsomeerit ovat eräänlainen restriktioentsyymi, joka tulee eri lähteistä, mutta tunnistaa ja katkaisee saman restriktiokohdan DNA:ssa. Siksi kahdella isoskitsomeerilla on sama tunnistuskohta. Ne pilkkoutuvat samasta kohdasta, joten ne ovat spesifisiä samalle tunnistussekvenssille. Esimerkiksi restriktioentsyymit SphI ja BbuI ovat kaksi isoskitsomeeria, jotka tunnistavat ja pilkkoutuvat CGTAC/G:ssä.
Kuva 01: Restriktioentsyymi
Toinen isoskizomeripari on HpaII ja MspI. Ne molemmat tunnistavat sekvenssin 5'-CCGG-3' ja pilkkovat DNA:n. Lisäksi Bsp EI ja Acc III ovat myös isoskizomeereja, jotka ovat peräisin Bacillus-lajista ja Acinetobacter calcoaceticus -bakteerista, vastaavasti. Isoskitsomeerien eristäminen voidaan tehdä eri bakteereista. Koska ne ovat peräisin eri bakteereista, niiden restriktioolosuhteet voivat poiketa toisistaan.
Mitä isokaudimeerit ovat?
Isokaudomeerit ovat eräänlainen restriktioentsyymi, joka tunnistaa hieman erilaisia sekvenssejä, mutta ne pilkkoutuvat samasta kohdasta tuottaakseen samat päät. Isocaudomeerit tulevat myös eri bakteereista. Sau3a ja BamHI ovat isokaudomeeripari. Ne tuottavat 5'-GATC-3' tahmean pään saman kohdan pilkkomisen jälkeen. Toinen isokaudomeeripari on Nocardia corallinan NcoI ja Pseudomonas alcaligenesin PagI. Nämä kaksi entsyymiä myös sitoutuvat eri tunnistussekvensseihin, mutta leikkaavat samasta kohdasta ja tuottavat samat tahmeat päät. Siksi valmistetut leikkuupäät ovat yhteensopivia keskenään ja ne voidaan liittää toisiinsa. XhoI, PspXI ja SalI ovat myös isokaudiomeerejä.
Mitä yhtäläisyyksiä isoskitsomeerien ja isokaudomeerien välillä on?
- Isoskitsomeerit ja isokaudomeerit ovat kahdenlaisia restriktioentsyymejä.
- Kahdella isoskizomerilla on sama pilkkoutumiskohta, samanlainen kuin kahdella isokaudomeerilla, joilla on sama digestiokohta.
- Ne ovat alkuperältään prokaryoottisia.
- Molemmilla on rajoitusten tunnistuspaikka sekä ruoansulatuspaikka.
- Ne tuottavat päitä, jotka ovat yhteensopivia keskenään.
- Lisäksi nämä entsyymit ovat hyödyllisiä työkaluja yhdistelmä-DNA-tekniikassa.
Mitä eroa isoskizomeereilla ja isokaudomeereilla on?
Isoskitsomeerit ovat restriktioentsyymejä, jotka tunnistavat saman DNA-sekvenssin ja pilkkoutuvat samasta restriktiokohdasta, kun taas isokaudomeerit ovat restriktioentsyymejä, jotka tunnistavat hieman erilaisia DNA-sekvenssejä, mutta tuottavat samat tahmeat päät leikkaamalla samasta kohdasta. Joten, tämä on avainero isoskizomeerien ja isokaudomeerien välillä.
Alla olevassa infografiikassa on taulukko isoskizomeerien ja isokaudomeereiden eroista.
Yhteenveto – Isoskizomerit vs Isocaudomers
Isoskitsomeerit ovat restriktioentsyymejä, jotka tunnistavat saman DNA-sekvenssin ja pilkkoutuvat samasta kohdasta. Toisa alta isokaudomeerit ovat restriktioentsyymejä, jotka tunnistavat hieman erilaiset sekvenssit ja pilkkoutuvat samasta kohdasta tuottaen samat päät. Siten tämä on avainero isoskizomeerien ja isokaudomeereiden välillä. SphI, BbuI, HpaII ja MspI ovat useita esimerkkejä isoskitsomeereistä, kun taas Sau3a ja BamHI ovat kaksi esimerkkiä isokaudomeereistä. Bakteerit tuottavat luonnostaan sekä isoskitomeerejä että isokaudomeerejä.
