Avainero VNTR:n ja koettimen välillä on, että VNTR on lyhyt nukleotidisekvenssi, joka esiintyy genomissa tandemtoistona, kun taas koetin on keinotekoisesti syntetisoitu lyhyt DNA- tai RNA-sekvenssi, joka voidaan leimata radioaktiivisesti.
VNTR tarkoittaa muuttuvan numeron tandemtoistoa. Se on lyhyt nukleotidisekvenssi, joka on järjestetty genomin tandemtoistoiksi. VNTR:itä esiintyy luonnollisesti genomissamme. Koetin on keinotekoisesti syntetisoitu lyhyt DNA- tai RNA-sekvenssi. Sekä koetin että VNTR ovat nukleiinihappoja tai lyhyitä nukleotidisekvenssejä. Niillä on v altavasti käyttöä erilaisissa molekyylibiologisissa tekniikoissa, pääasiassa oikeuslääketieteellisissä tutkimuksissa. VNTR:llä ja anturilla on joitain yhtäläisyyksiä ja eroja. Tästä syystä artikkeli yrittää korostaa eroa VNTR:n ja luotain välillä.
Mikä on VNTR?
VNTR on lyhyt nukleotidisekvenssi, joka esiintyy genomissamme tandemtoistona. VNTR:t ovat läsnä monissa kromosomeissa. Lisäksi VNTR:t eroavat eri yksilöiden pituuksista, koska toistojen määrä on erilainen eri ihmisten VNTR:issä. Pohjimmiltaan se johtuu vanhemmiltaan perimistä alleeleista. Siksi käytämme VNTR:itä pääasiassa vanhempien tunnistamiseen (perinnön) tai henkilökohtaisiin tarkoituksiin. Vastaavasti niitä on mahdollista käyttää myös genetiikassa, oikeuslääketieteessä, biologisessa tutkimuksessa ja DNA-sormenjälkien ottamisessa. Siksi VNTR on tärkeä työkalu molekyylibiologiassa.
Kuva 01: VNTR
Perinnössä analysoimme VNTR-tietoja käyttämällä kahta perusperiaatetta: perinnön täsmäytystä ja identiteettisovitusta. Perinnön täsmäytyksen aikana yksilöllä on oltava vastaava alleeli kunkin vanhemman alleeliin. Identiteettisovituksen aikana molempien VNTR-alleelien on oltava läsnä tietyssä genomin paikassa.
Mikä on anturi?
Molekyylibiologian yhteydessä koetin on keinotekoisesti syntetisoitu DNA- tai RNA-fragmentti, jonka pituus on 100-1000 emästä. Voimme leimata nämä koettimet radioaktiivisesti. Siksi käytämme niitä kohdenukleotidisekvenssien havaitsemiseen, jotka ovat komplementaarisia koettimen sekvenssille. Kun lisäämme näytteeseen koettimia, hybridisaatio tapahtuu komplementaaristen sekvenssien tai kohdesekvenssien kanssa ja helpottaa kohdesekvenssien tunnistamista. Koska koettimissa on radioaktiivisuutta, voimme havaita ne helposti.
Kuva 02: Anturi
Oikeuslääketieteessä käytämme yleisesti koettimia DNA-profilointitekniikoissa, kuten lyhyiden tandemtoistoalueiden havaitsemisessa, restriktiofragmenttien pituuden polymorfismissa ja DNA-sormenjälkien ottamisessa.
Mitä yhtäläisyyksiä VNTR:n ja koettimen välillä on?
- Nukleiinihapot ovat VNTR:n ja Probe:n rakennuspalikoita.
- Käytämme niitä geenitunnistusprosesseissa.
- Lisäksi molempien pituudet ovat vaihtelevia.
- Ne ovat tärkeitä työkaluja oikeuslääketieteellisissä tutkimuksissa, DNA-sormenjälkien ottamisessa, genetiikassa jne.
Mitä eroa on VNTR:n ja Proben välillä?
VNTR on genomin alue, joka on järjestetty tandemtoistoiksi, kun taas koetin on lyhyt DNA- tai RNA-sekvenssi, joka on syntetisoitu keinotekoisesti kohdesekvenssien havaitsemiseksi näytteestä. Joten tämä on avainero VNTR:n ja anturin välillä. Tärkeä ero VNTR:n ja anturin välillä on myös se, että toisin kuin VNTR:t, voimme merkitä anturit radioaktiivisesti.
Lisäksi VNTR:t suorittavat enimmäkseen vanhempien tunnistamista, kun taas koettimet auttavat havaitsemaan DNA- tai RNA-näytteissä olevat kohdenukleotidisekvenssit, jotka ovat komplementaarisia koettimen sekvenssille. Siksi tämä on myös merkittävä ero VNTR:n ja anturin välillä.
Seuraava infografiikka antaa lisätietoja VNTR:n ja anturin välisestä erosta.
Yhteenveto – VNTR vs Probe
VNTR:n ja koettimen yleinen käyttö on molekyylianalyysitekniikoissa, kuten oikeuslääketieteellisissä tutkimuksissa ja DNA-sormenjälkien ottamisessa. Molemmat koostuvat vaihtelevista pituuksista. Tärkein ero VNTR:n ja koettimen välillä on kuitenkin se, että VNTR on genomin alue, joka on järjestetty tandem-toistoilla, kun taas koetin on DNA- tai RNA-fragmentti, joka voidaan leimata radioaktiivisesti. Lisäksi VNTR:t ovat läsnä genomissa. Mutta koettimet syntetisoidaan keinotekoisesti ja ne voidaan leimata radioaktiivisesti kohdenukleotidisekvenssien havaitsemiseksi DNA- tai RNA-näytteistä, jotka ovat komplementaarisia koettimen sekvenssin kanssa. Näin ollen tämä on yhteenveto VNTR:n ja anturin välisestä erosta.
