Avainero ssRNA:n ja dsRNA:n välillä on, että ssRNA:ssa on vain yksi RNA-juoste, kun taas dsRNA koostuu kahdesta komplementaarisesta siRNA- tai miRNA-juosteesta.
RNA tai ribonukleiinihappo on eräänlainen nukleiinihappo, joka koostuu ribonukleotideista. Yleensä RNA on yksijuosteinen molekyyli, toisin kuin DNA:n kaksoiskierre. B altimoren virusluokituksessa ryhmä III, ryhmä IV ja ryhmä V sisältävät RNA-virukset. Joillakin viruksilla on ssRNA tai yksijuosteinen RNA-genomi. Siksi heidän genominsa on valmistettu yhdestä RNA-juosteesta. Lisäksi joillakin viruksilla on dsRNA tai kaksijuosteinen RNA-genomi. Siksi heidän genominsa on valmistettu kahdesta komplementaarisesta RNA-juosteesta. Sakkaroosi- tai cesiumkloridi-tiheysgradienttitekniikka voi erottaa ssRNA-virukset ja dsRNA-virukset. Kevyemmät hiukkaset ovat ssRNA-viruksia, kun taas tiheämmät hiukkaset sisältävät dsRNA:ta.
Mikä on ssRNA?
ssRNA tarkoittaa yksijuosteista RNA:ta. Yleensä RNA on yksijuosteinen. On viruksia, joilla on ssRNA-genomi. Niitä on kahta tyyppiä: positiivinen tunne ja negatiivinen tunne, joka perustuu RNA:n tunteeseen tai polariteettiin. Positiivinen sense yksijuosteinen RNA käyttäytyy kuin mRNA. Siksi se voi muuttua suoraan proteiiniksi. Negatiivinen sense-ssRNA on komplementaarinen mRNA:lle. Siksi RNA-riippuvaisen RNA-polymeraasin tulisi muuntaa sen positiivisen sensen ssRNA:ksi. Sen jälkeen se voi muuttua proteiiniksi.
Kuva 01: RNA-virukset
B altimoren luokituksessa positiiviset ssRNA-virukset kuuluvat ryhmään IV, kun taas negatiiviset ssRNA-virukset kuuluvat ryhmään V. Sakkaroosin tai cesiumkloridin tiheysgradienteissa kevyemmät hiukkaset sisältävät ssRNA-viruksia.
Mikä on dsRNA?
dsRNA tarkoittaa kaksijuosteista RNA:ta. dsRNA:ssa on kaksi komplementaarista RNA-juostetta. Nämä säikeet paritetaan keskenään muodostamalla sidoksia komplementaaristen emästen välille. Toisin kuin ssRNA, dsRNA ei ole pitkä - se on lyhyt molekyyli. dsRNA muodostuu, kun komplementaariset DNA-juosteet transkriptoidaan RNA:ksi symmetrisellä transkriptiolla vastakkaisista promoottoreista. Lisäksi ssRNA voi muodostaa juosteen sisäisiä kaksoiskierreitä, jotka ovat dsRNA:ta komplementaarisen emäspariutumisen avulla. dsRNA voidaan muodostaa myös transposoneista ja toistuvista geeneistä johtuvien komplementaaristen ssRNA-molekyylien emäspariutumisen avulla.
Kuva 02: dsRNA-virus
Joillakin viruksilla on dsRNA-genomit. Näillä viruksilla on laaja isäntävalikoima. Rotavirukset ja pikobirnavirukset ovat dsRNA-viruksia. Näiden virusten dsRNA-genomi transkriptoi mRNA:ksi RNA:sta riippuvaisen RNA-polymeraasin toimesta. Sitten mRNA-molekyylit muuttuvat virusproteiineiksi. Lisäksi positiivista sense-RNA-juostetta voidaan jälleen käyttää tuottamaan dsRNA-genomeja uusille viruspartikkeleille. B altimoren luokituksessa dsRNA kuuluu ryhmään III. dsRNA-virukset tartuttavat kaikki organismit, mukaan lukien nisäkkäät, bakteerit, kasvit ja sienet.
Pieni häiritsevä RNA tai siRNA on eräänlainen dsRNA, joka voi laukaista RNA-häiriön eukaryooteissa sekä interferonivasteen selkärankaisilla.
Mitä yhtäläisyyksiä ssRNA:n ja dsRNA:n välillä on?
- On viruksia, joissa on ssRNA ja dsRNA.
- Yksijuosteinen RNA-molekyyli voi läpikäydä komplementaarisen emäsparin muodostaen intrajuosteen kaksoiskierreitä, jotka ovat dsRNA:ta.
- Sekä ssRNA että dsRNA valmistetaan ribonukleotideista, joissa on neljä emästä; adeniini (A), sytosiini (C), guaniini (G) tai urasiili (U), riboosisokeri ja fosfaattiryhmä.
Mitä eroa ssRNA:lla ja dsRNA:lla on?
Avainero ssRNA:n ja dsRNA:n välillä on, että ssRNNA:ssa on vain yksi juoste, kun taas dsRNA:ssa on kaksi komplementaarista RNA-juostetta, jotka on paritettu yhteen. Luonnossa ssRNA:ta löytyy runsaasti, kun taas dsRNA:ta on vähemmän runsaasti. B altimoren luokituksessa ssRNA-virukset ovat ryhmissä IV ja V, kun taas dsRNA-virukset kuuluvat ryhmään III.
Alla oleva infografiikka näyttää eron ssRNA:n ja dsRNA:n välillä taulukkomuodossa.
Yhteenveto – ssRNA vs dsRNA
Luonnossa RNA löytyy yksijuosteisena molekyylinä, joka on laskostunut itseensä. mRNA on yksijuosteinen RNA-molekyyli, joka muuttuu ribosomien proteiiniksi. Monilla viruksilla on RNA-genomit. Joillakin viruksilla on ssRNA-genomit, kun taas joillakin viruksilla on dsRNA-genomit. dsRNA:ssa on kaksi komplementaarista RNA-juostetta, jotka on paritettu yhteen. Positiivinen sense ssRNA toimii suoraan mRNA:na ja muuttuu virusproteiineiksi, kun taas negatiivisen sensen ssRNA muunnetaan positiivisen sense-ssRNA:ksi RNA:sta riippuvaisen RNA-polymeraasin vaikutuksesta ja transloidaan sitten proteiineihin. RNA:sta riippuvainen RNA-polymeraasi transkriptoi dsRNA:n mRNA:ksi, ja sitten mRNA-molekyylit muuttuvat virusproteiineiksi. Näin ollen tämä tiivistää eron ssRNA:n ja dsRNA:n välillä.