Avainero restriktioendonukleaasin ja eksonukleaasin välillä on, että restriktioendonukleaasi on nukleaasientsyymi, joka tunnistaa tietyn DNA-sekvenssin ja katkaisee DNA:n kyseisessä sekvenssissä tai sen vieressä, kun taas eksonukleaasi on nukleaasientsyymi, joka pilkkoo nukleotidit polynukleotidi joko 5'-päästä tai 3'-päästä yksi kerrallaan.
Nukleaasit ovat entsyymejä, jotka katkaisevat fosfodiesterisidoksia nukleiinihappojen nukleotidien välillä. Elävissä organismeissa ne ovat välttämättömiä työkaluja monissa solun DNA-korjauksen näkökohdissa. Näiden entsyymien viat voivat aiheuttaa geneettistä epävakautta ja immuunipuutosta. Restriktionukleaasit ovat spesifisiä nukleaaseja, joiden toiminta riippuu tietystä nukleotidisekvenssistä. Esimerkki on restriktioendonukleaasi. Nukleaaseille on olemassa perusluokitus, joka perustuu aktiivisuuspaikkaan, kuten endonukleaasi ja eksonukleaasi. Endonukleaasi pilkkoo alueita kohde-DNA-molekyylin keskellä. Eksonukleaasi pilkkoo nukleiinihapot päistä. Tästä syystä restriktioendonukleaasi ja eksonukleaasi ovat kahden tyyppisiä nukleaasientsyymejä.
Mikä on restriktioendonukleaasi?
Restriktioendonukleaasi on nukleaasientsyymi, joka tunnistaa tietyn DNA-sekvenssin ja katkaisee DNA:n kyseisessä sekvenssissä tai sen vieressä. Spesifinen DNA-sekvenssi tunnetaan restriktiokohtana. Sitä kutsutaan myös restriktioentsyymiksi tai restriktaasiksi. Restriktioendonukleaasi on hyvin spesifinen entsyymi. Se on yksi luokka laajemmasta endonukleaasientsyymiryhmästä. Restriktioendonukleaasit luokitellaan tavallisesti viiteen tyyppiin, jotka eroavat rakenteeltaan ja kyvystään leikata DNA-substraattia tunnistuskohdassa. Viisi tyyppiä ovat tyyppi I, tyyppi II, tyyppi III, tyyppi IV ja tyyppi V.
Kuva 01: Restriktioendonukleaasi
Restriktioendonukleaaseja löytyy yleensä bakteereista ja arkeista. Ne tarjoavat bakteereille puolustusmekanismin viruksia vastaan. Tunnetaan yli 3600 restriktioendonukleaasia. Ne edustavat yli 250 erilaista ominaisuutta. Yli 3000 näistä on tutkittu yksityiskohtaisesti. Lisäksi yli 800 näistä on saatavilla kaupallisesti.
Mikä on eksonukleaasi?
Eksonukleaasi on nukleaasientsyymi, joka katkaisee polynukleotidin nukleotidit joko 5'- tai 3'-päästä yksi kerrallaan. Tämä tapahtuu hydrolysointireaktion kautta, joka katkaisee fosfodiesterisidokset nukleotidien välillä lopussa. Eukaryooteilla ja prokaryooteilla on kolmenlaisia eksonukleaaseja. Nämä eksonukleaasit osallistuvat mRNA:n normaaliin kiertoon. Ne ovat 5'-3'-eksonukleaasi (Xrn1), 3'-5'-eksonukleaasi ja poly-A-spesifinen 3'-5'-eksonukleaasi. 5'-3'-eksonukleaasi on riippuvainen proteiinia poistava proteiini. 3'-5' eksonukleaasi on itsenäinen proteiini. PolyA-spesifinen 3'-5'-eksonukleaasi tunnetaan myös poly-A-spesifisenä ribonukleaasina, joka osallistuu poly-A-hännän eksonukleolyyttiseen hajoamiseen.
Kuva 02: Eksonukleaasi
Sekä arkeoissa että eukaryooteissa RNA:n hajoamista suorittaa moniproteiininen eksosomikompleksi, joka koostuu 3'-5' eksoribonukleaaseista.
Mitä yhtäläisyyksiä restriktioendonukleaasin ja eksonukleaasin välillä on?
- Restriktioendonukleaasi ja eksonukleaasi ovat kahdenlaisia nukleaasientsyymejä.
- Molemmat entsyymit leikkaavat DNA-molekyylejä.
- Näitä entsyymejä löytyy prokaryooteista.
- Ne ovat proteiineja.
Mitä eroa on restriktioendonukleaasin ja eksonukleaasin välillä?
Restriktioendonukleaasi on nukleaasientsyymi, joka tunnistaa tietyn DNA-sekvenssin ja katkaisee DNA:n sekvenssin sisällä tai sen vieressä, kun taas eksonukleaasi on nukleaasientsyymi, joka katkaisee polynukleotidin nukleotidit joko 5'- tai 3'-päästä. yksi kerrallaan. Joten tämä on avainero restriktioendonukleaasin ja eksonukleaasin välillä. Lisäksi restriktioendonukleaasia löytyy vain prokaryooteista, kun taas eksonukleaasia löytyy sekä prokaryooteista että eukaryooteista.
Seuraava infografiikka luettelee restriktioendonukleaasin ja eksonukleaasin väliset erot taulukkomuodossa vierekkäin vertailua varten.
Yhteenveto – Restriktioendonukleaasi vs eksonukleaasi
Nukleaasit ovat entsyymejä, jotka katkaisevat fosfodiesterisidoksia nukleiinihappojen nukleotidien välillä. Restriktioendonukleaasi ja eksonukleaasi ovat kahden tyyppisiä nukleaasientsyymejä. Restriktioendonukleaasi on nukleaasientsyymi, joka tunnistaa tietyn DNA-sekvenssin ja katkaisee DNA:n kyseisessä sekvenssissä tai sen vieressä. Eksonukleaasi on nukleaasientsyymi, joka katkaisee polynukleotidin nukleotidit joko niiden 5'- tai 3'-päästä yksi kerrallaan. Siten tämä tiivistää eron restriktioendonukleaasin ja eksonukleaasin välillä.
