Avainero N-sitoutuneiden ja O-sidottujen oligosakkaridien välillä on se, että N-sitoutuneita oligosakkarideja muodostuu, kun proteiinien N-atomit sitoutuvat sokeriin, kun taas O-sitoutuneita oligosakkarideja muodostuu, kun seriinin tai treoniinin O-atomit sitoutuvat sokeri.
Oligosakkaridit ovat hiilihydraattimolekyylejä, jotka sisältävät 3–6 yksikköä monosakkarideja tai yksinkertaisia sokereita. N-sidotut oligosakkaridit ovat hiilihydraattimolekyylejä, joissa oligosakkaridi on kiinnittynyt typpiatomiin. O-kytketyt oligosakkaridit ovat toisa alta eräänlainen hiilihydraatti, jossa sokerimolekyyli on kiinnittynyt proteiinin seriini- tai treoniinitähteen happiatomiin.
Mitä ovat N-kytketyt oligosakkaridit?
N-kytketyt oligosakkaridit ovat hiilihydraattimolekyylejä, joiden oligosakkaridit ovat kiinnittyneet typpiatomeihin. Tämä tapahtuu N-glykosylaatioprosessin kautta. Oligosakkaridit ovat hiilihydraattiyhdisteitä, jotka sisältävät useita sokerimolekyylejä. Näitä kutsutaan joskus "glykaaneiksi". N-sidoksessa glykosylaatioprosessissa typpiatomi tulee yleensä proteiinin asparagiinitähteen amiditypestä. Tämä prosessi kuvataan parhaiten biokemian alalla.
Yleensä N-sidottu glykosylaatio tapahtuu monissa eukaryoottiproteiineissa. Eukaryoottien joukossa tätä esiintyy laaj alti arkeissa, mutta harvoin bakteereissa. Voimme määrittää N-kytketyn oligosakkaridin luonteen, joka on kiinnittynyt glykoproteiiniin proteiinin ja sen solun kautta, jossa se ekspressoituu. N-kytketyn oligosakkaridin tyyppi riippuu myös organismilajeista.
Glykoproteiinissa on yleensä kaksi sidostyyppiä: sidos glykaanin sakkariditähteiden välillä ja sidos glykaaniketjun ja proteiinimolekyylin välillä. Siellä sokeriosat on sidottu toisiinsa glykosidisidoksilla. Glykosidisidokset ovat tyypillisesti C1-C4-sidoksia. Lisäksi oligosakkaridin ja proteiinitähteen välinen sidos vaatii konsensussekvenssin tunnistamisen.
Mitä O-sitoutuneet oligosakkaridit ovat?
O-kytketyt oligosakkaridit ovat eräänlaisia hiilihydraatteja, joissa sokerimolekyyli on kiinnittynyt proteiinin seriini- tai treoniinitähteen happiatomiin. Tämän sidoksen muodostumisprosessi tunnetaan O-sidokseksi glykosylaationa. Se on siirtymän jälkeinen modifikaatioprosessi, joka tapahtuu proteiinisynteesin jälkeen.
Eukaryootteja tarkasteltaessa tämä synteesi tapahtuu endoplasmisessa retikulumissa, Golgin laitteessa ja joskus sytoplasmassa. Prokaryooteilla tämä tapahtuu sytoplasmassa. On olemassa useita erilaisia sokereita, jotka voivat sitoutua seriinin tai treoniinin kanssa. Tämä sitoutuminen voi vaikuttaa proteiiniin eri tavoin. Esim. solujen salakuljetus immuunijärjestelmässä, mikä mahdollistaa vieraan materiaalin tunnistamisen.
Mitä eroa on N-kytketyillä ja O-sitoutuneilla oligosakkarideilla?
N-kytketyt oligosakkaridit ovat hiilihydraattimolekyylejä, joissa oligosakkaridi on kiinnittynyt typpiatomiin, kun taas O-sidotut oligosakkaridit ovat hiilihydraattityyppejä, joissa sokerimolekyyli on kiinnittynyt seriini- tai treoniinitähteen happiatomiin proteiinia. Siksi keskeinen ero N-sitoutuneiden ja O-sidottujen oligosakkaridien välillä on se, että N-sitoutuneita oligosakkarideja muodostuu, kun proteiinien N-atomi sitoutuu sokeriin, kun taas O-sitoutuneita oligosakkarideja muodostuu, kun seriinin tai treoniinin O-atomit sitoutuvat sokeriin.
Alla oleva infografiikka esittelee N-sitoutuneiden ja O-sitoutuneiden oligosakkaridien väliset erot taulukkomuodossa vierekkäin vertailua varten.
Yhteenveto – N-kytketyt vs. O-liittyvät oligosakkaridit
Olgosakkaridit ovat eräänlainen sokerimolekyyli. Keskeinen ero N-sitoutuneiden ja O-sidottujen oligosakkaridien välillä on se, että N-sitoutuneita oligosakkarideja muodostuu, kun proteiinien N-atomit sitoutuvat sokeriin, kun taas O-sitoutuneita oligosakkarideja muodostuu, kun seriinin tai treoniinin O-atomit sitoutuvat sokeriin.
