Avainero suurimman parsimonian ja suurimman todennäköisyyden välillä riippuu fylogeneettisen puun kehittämisessä käytetystä menetelmästä. Suurin parsimony keskittyy minimoimaan kokonaisluonnetilojen fylogeneettisen puun rakentamisen aikana, kun taas suurin todennäköisyys on tilastollinen lähestymistapa fylogeneettisen puun piirtämisessä riippuen geneettisten tietojen välisestä todennäköisyydestä.
Fylogeny on uusi lähestymistapa organismien luokitteluun ja nimikkeistöön. Fylogenia perustuu geneettiseen dataan ja evoluutiosuhteisiin. Geneettiset tiedot ovat tulosta DNA-sekvensoinnista. Fylogeniassa organismien luokittelu tapahtuu yhteisen esi-isän perusteella. Suurin vähävaraisuus ja fylogeneettisen suhteen suurin todennäköisyys lisäävät fylogeneettisen puun tarkkuutta ja luotettavuutta.
Mikä on maksimaalinen hillittömyys?
Maksimaalisen parsimonisuuden tekniikassa luonteen kokonaistilan muutosten minimointi tapahtuu fylogeneettisen analyysin aikana. Fylogenetiikka on biologian ala, joka tutkii evoluutiosuhteita. Fylogeneettinen puu on puu, joka näyttää evoluutiosuhteet, jotka perustuvat yhteiseen esi-isään. Näin ollen, kun piirretään fylogeneettinen puu käyttämällä maksimaalisen parsimonian käsitettä, rinnakkaisen evoluution määrä minimoidaan. Siksi maksimaalinen hillittömyys luo puun paljon nopeammin kuin muut menetelmät. Tämä johtuu siitä, että vain tärkeimmät erottavat ominaisuudet otetaan huomioon maksimaalisesti.
Kuva 01: Suurin hillittömyys
Kun piirretään maksimaalista puuta, puu on aina lyhin mahdollinen puu, jossa on mahdollisimman vähän taksoneja. Maksimaalisen puun luotettavuus on kuitenkin erittäin korkea. Tilastollinen johdonmukaisuus ja fylogeneettisen suhteen tarkkuus, joka perustuu maksimaaliseen parsimoniaan, vaihtelee. Lisäksi on olemassa monimutkaisia algoritmeja, jotka analysoivat fylogeneettisen suhteen maksimaalista parsimonia.
Mikä on suurin todennäköisyys?
Maksimitodennäköisyys on yksi eniten käytetyistä fylogeneettisten suhteiden analysointimenetelmistä. Menetelmä analysoi filogeniaa todennäköisyysmallin perusteella. Lisäksi tämä menetelmä ottaa huomioon sekä keskiarvon että varianssin. Siten fylogiassa suurin todennäköisyys saadaan tietyn organismin annetuilla geneettisillä tiedoilla.
Kuva 02: Suurin todennäköisyys
Maksimitodennäköisyyden tilastollisen menetelmän käyttämisessä on sekä etuja että haittoja. Menetelmä soveltuu erittäin hyvin yksinkertaisen geneettistä tietoa sisältävän tietojoukon analysointiin. Kun geneettisen tiedon varianssi on pienempi, maksimitodennäköisyyspisteet ovat luotettavia. Maksimitodennäköisyyden avulla saadut tulokset vahvistavat edelleen tietyn fylogeneettisen suhteen maksimaaliset parsimonipisteet. Siksi maksimitodennäköisyysanalyysi toimii varmistustestinä.
Yllä mainittuihin etuihin verrattuna tämä menetelmä on hidas ja intensiivinen prosessi. Lisäksi yksittäisen tietojoukon puuttuessa virhetulostus on korkea. Siten se myös vaikeuttaa tulosten toistettavuutta suurimman todennäköisyyden estimoinnilla.
Mitkä ovat yhtäläisyydet suurimman hillityn ja suurimman todennäköisyyden välillä?
- Maksimaalinen vähävaraisuus ja maksimitodennäköisyys ovat kaksi lähestymistapaa, joilla on tärkeä rooli fysiologiassa.
- Molemmat tekniikat kuvaavat organismin suhdetta esi-isänsä saatavilla olevien geneettisten tietojen perusteella.
- Fylogeneettisiä puita voidaan tulkita käyttämällä sekä maksimaalista parsimoniaa että maksimaalista todennäköisyyttä.
- Molemmissa tekniikoissa geneettiset tiedot perustuvat DNA- tai RNA-sekvensointiin.
- Molemmat menetelmät ovat tärkeitä fylogeneettisten puiden luomisessa.
Mitä eroa on suurimmalla hillittömyydellä ja suurimmalla todennäköisyydellä?
Sekä maksimaalinen vähävaraisuus että maksimitodennäköisyys ovat kaksi eri lähestymistapaa fylogeneettisen puun tulkinnassa. Maksimaalinen vähävaraisuus uskoo muutamien ominaisuuksien analysointiin ja luonteenmuutosten minimoimiseen organismista organismiin. Sitä vastoin suurimman todennäköisyyden menetelmässä otetaan huomioon sekä keskiarvo että varianssi ja saadaan suurin mahdollinen todennäköisyys tietyn organismin annetuille geneettisille tiedoille. Joten tämä on avainero suurimman hillinnän ja suurimman todennäköisyyden välillä.
Lisäksi maksimaalisen vähävaraisuuden luotettavuus ei yksin riitä johtopäätöksen tekemiseen. Mutta maksimaalisen todennäköisyyden menetelmä toimii vahvistavana testinä maksimaalisen vähävaraisuuden tuloksille. Näin ollen johtopäätökset tulisi tehdä käyttämällä sekä maksimaalista hillintää että maksimaalista todennäköisyyttä.
Alla oleva infografiikka tiivistää eron suurimman hillinnän ja suurimman todennäköisyyden välillä.
Yhteenveto – Suurin hillittömyys vs suurin mahdollinen todennäköisyys
Fylogenialla on tärkeä rooli evoluutiosuhteiden johtamisessa fylogeneettisiä puita rakentamalla. Suurin parsimoni on tekniikka puun rakentamiseksi, jossa on pienin määrä merkkien tilamuutoksia. Sitä vastoin fylogeneettisen puun suurin todennäköisyys riippuu geneettisten tietojen suurimman samank altaisuuden käyttämisestä. Molempien analyysien tiedot ovat peräisin DNA- tai RNA-sekvenssitiedoista. Luotettavuus ja tarkkuus ovat korkeat, kun puurakentaminen tapahtuu molemmilla tekniikoilla. Näin ollen tämä tiivistää eron suurimman hillinnän ja suurimman todennäköisyyden välillä.
