Avainero kromosomijuovien ja kromosomimaalauksen välillä on se, että kromosomiraita on värjäystekniikka, joka näyttää kromosomien alueet erottuvissa tummissa ja vaaleissa vyöhykkeissä, mutta kromosomimaalaus on hybridisaatiotekniikka, jossa tietyt kromosomien alueet tai segmentit maalattu sekvenssispesifisillä fluoresoivasti leimatuilla koettimilla.
Sytogenetiikassa on välttämätöntä tuottaa näkyvä karyotyyppi organismista kromosomien ja niiden poikkeavuuksien tunnistamiseksi. Kromosominauhat ja kromosomien maalaus ovat kaksi sytogeneettistä tekniikkaa, jotka auttavat kromosomien visualisoinnissa. Molemmat tekniikat ovat hyödyllisiä geneettisten häiriöiden tunnistamisessa.
Mikä on kromosomiraita?
Kromosomiraita on värjäystekniikka, joka näyttää vuorotellen vaaleita ja tummia juovia tai alueita kromosomin pituudella. Vyöhyke viittaa kromosomin osaan, joka on selvästi erotettavissa viereisistä segmenteistä näyttämällä tummemm alta tai vaaleamm alta. Tummien ja vaaleiden juovien tuottamiseksi on välttämätöntä värjätä kromosomit sopivalla väriaineella, kuten fluoresoivalla kinakriinilla tai Giemsa-värillä.
On olemassa useita eri tyyppisiä kromosomiraitatekniikoita. Niiden joukossa Q-kaista, käänteinen (R) ja G-kaista ovat yleisiä kaistanmuodostustekniikoita. G-vyöhyketekniikka käyttää värjäystä nimeltä Giemsa-värjäys, ja se värjää heterokromaattisten alueiden AT-rikkaat alueet tummanvärisissä vyöhykkeissä ja GC-rikkaat eukromaattiset alueet kevyesti värjäytyneissä vyöhykkeissä. R-juova on päinvastainen kuin G-juova, ja se värjää GC-rikkaat alueet tummilla vyöhykkeillä ja AT-rikkaat alueet vaaleilla vyöhykkeillä. Q-raita sen sijaan käyttää fluoresoivaa väriainetta kinakriinia ja se värjää kromosomit keltaisella fluoresenssilla, jonka voimakkuus vaihtelee. C-raitatekniikka on toinen nauhatekniikka, joka värjää sentromeerialueita. Lisäksi T-nauhatekniikka visualisoi telomeerialueet.
Kuva 01: Kromosominauhat
Raitakuvio on ainutlaatuinen organismeille. Näin ollen nämä ainutlaatuiset vyöhykekuviot ovat tärkeitä kromosomien tunnistamisessa ja kromosomaalisten poikkeavuuksien (kromosomien katkeaminen, katoaminen, päällekkäisyys, translokaatio tai käänteiset segmentit) havaitsemisessa.
Mitä kromosomimaalaus on?
Kromosomimaalaus on tekniikka, jossa tietyt kromosomien alueet tai segmentit maalataan sekvenssispesifisillä koettimilla, jotka on merkitty fluoresoivasti. Siksi kromosomimaalaus yhdistetään aina in situ FISH-tekniikkaan. Se perustuu täysin molekyylihybridisaatioon kromosomeissa olevien sekvenssispesifisten koettimien kanssa. Siksi se tarvitsee erityisiä koettimia hybridisoidakseen kohdekromosomit tai -kromosomialueet.
Kuva 02: Kromosomimaalaus
Lisäksi tämä tekniikka vaatii aluksi metafaasissa olevan kohdekromosomaalisen DNA:n denaturoinnin. Toiseksi hybridisaatiovaihe tapahtuu koettimilla. Kun koettimet löytävät komplementaariset sekvenssinsä, ne hybridisoituvat kromosomin spesifisten alueiden kanssa. Voimme helposti tarkkailla hybridisoituneita kohtia käyttämällä autoradiografiaa tai immunofluoresenssia. Koettimien valmistelu, denaturointi, hybridisaatio ja visualisointi ovat kromosomimaalauksen neljä päävaihetta.
Sovelluksissa kromosomimaalaus on hyödyllinen kromosomien uudelleenjärjestelyjen, murtumispisteiden ja kromosominulkoisten materiaalien määrittämisessä. Lisäksi se on tehokas työkalu kromosomien eri geenisekvenssien tarkkaan lokalisointiin mikroskooppisella tasolla. Lisäksi kromosomimaalauksesta on apua kromosomien haluttujen merkkien geenien tunnistamisessa.
Mitä yhtäläisyyksiä kromosomiraidoilla ja kromosomimaalauksella on?
- Kromosomiraita ja kromosomimaalaus ovat kaksi sytogeneettisessä analyysissä käytettyä tekniikkaa.
- Molemmat tekniikat visualisoivat kromosomit yleensä metafaasissa.
- Näillä tekniikoilla voidaan tunnistaa normaalit kromosomit ja poikkeamat.
- Lisäksi nämä tekniikat ovat todella hyödyllisiä geneettisten häiriöiden tunnistamisessa.
Mitä eroa on kromosomiraidoilla ja kromosomimaalauksella?
Kromosomiraita on värjäystekniikka, joka näyttää kromosomien osia tummina ja vaaleina vyöhykkeinä, jotka ovat erotettavissa. Samaan aikaan kromosomimaalaus on hybridisaatiotekniikka, joka maalaa tietyt kromosomien alueet sekvenssispesifisillä koettimilla, jotka on merkitty fluoresoivasti. Joten tämä on avainero kromosominauhan ja kromosomimaalauksen välillä. Lisäksi kromosomijuovat tuottaa vuorotellen tummia ja vaaleita juovia pitkin kromosomin pituutta, kun taas kromosomimaalaus tuottaa fluoresoivasti leimattuja kromosomien alueita.
Lisäksi kromosomijuovien muodostuminen riippuu kromosomaalisen DNA:n kyvystä värjäytyä väriaineella, kun taas kromosomien maalaus riippuu molekyylihybridisaatiosta kromosomien sekvenssispesifisten koettimien kanssa. Tämä on tärkeä ero kromosominauhan ja kromosomimaalauksen välillä. Näiden lisäksi, toisin kuin kromosomiraitaus, kromosomimaalaustekniikka vaatii sekvenssispesifisiä fluoresoivasti leimattuja koettimia.
Yhteenveto – kromosomiraita vs kromosomimaalaus
Kromosominauhat ja kromosomimaalaus ovat kaksi tekniikkaa, joita käytetään kromosomien visualisointiin, yleensä metafaasissa. Molemmat tekniikat auttavat tunnistamaan numeerisia ja rakenteellisia kromosomipoikkeavuuksia ja geneettisiä sairauksia. Kromosomiraita on värjäystekniikka, joka näyttää kromosomien tietyt alueet tummissa ja vaaleissa vyöhykkeissä, jotka ovat erotettavissa. Samaan aikaan kromosomimaalaus on eräänlainen hybridisaatiotekniikka, joka visualisoi kromosomien tietyt alueet johtuen hybridisaatiosta fluoresoivasti leimattujen sekvenssispesifisten koettimien kanssa. Joten tämä on avainero kromosomiraitauksen ja kromosomimaalauksen välillä.
