Avainero komposiittisten ja ei-komposiittisten transposonien välillä on se, että yhdistelmätransposoneilla on kaksi viereistä insertiosekvenssiä, kun taas ei-komposiittitransposoneilla on käänteisiä toistoja viereisten insertiosekvenssien sijaan.
Transposoni on DNA-fragmentti, joka voi siirtyä bakteerigenomissa. Ne ovat liikkuvia DNA-sekvenssejä. Ne siirtyvät genomin uusiin paikkoihin. Nämä liikkeet muuttavat bakteerigenomin sekvenssiä aiheuttaen merkittäviä muutoksia geneettisessä informaatiossa. Ne ovat siirrettäviä geneettisiä elementtejä, jotka vastaavat uusien geneettisten sekvenssien muodostamisesta bakteereihin. Transposoneja kutsutaan myös hyppygeeneiksi, koska nämä hyppysekvenssit voivat estää geenien transkription ja järjestää bakteerin geneettisen materiaalin uudelleen. Lisäksi ne ovat vastuussa lääkeresistenssin, antibioottiresistenssigeenien liikkumisesta plasmidien ja kromosomien välillä. On olemassa kahden tyyppisiä transposoneja yhdistelmä- ja ei-komposiittitransposoneina.
Mitä ovat komposiittitransposonit?
Yhdistetty transposoni on DNA-segmentti, jota reunustavat kaksi samank altaisten insertiosekvenssielementtien kopiota. Yhdistelmätransposonissa on keskusproteiinia koodaava alue. Geenit ovat usein antibioottiresistenttejä geenejä. Ne voivat sisältää myös katabolisia geenejä. Lisäksi yhdistelmätransposonit koostuvat kahdesta käänteisestä toistosta.
Kuva 01: Yhdistelmätransposoni
Komposiittitransposonin koko pituus liikkuu yhtenä kokonaisena yksikkönä. Tn10 on yhdistelmätransposoni. Se koostuu 6,5 kb:n keskusalueesta (tetrasykliiniresistentti geeni) ja 1,4 kb:n käänteisistä insertiosekvenssielementeistä kummassakin päässä.
Mitä ovat ei-komposiittitransposonit?
Ei-komposiittitransposonit ovat toisen tyyppisiä prokaryoottisia transposoneja, joiden kahdessa päässä ei ole insertiosekvenssejä. Samoin kuin yhdistelmätransposonit, ei-yhdistelmätransposoneissa on geenejä, jotka koodaavat antibioottiresistenssiä. Lisäksi ne sisältävät toistuvia sekvenssejä päissään. Näitä toistuvia sekvenssejä tarvitaan transponointiin. Tn3 on ei-komposiittitransposoni. Tn3:n ei-komposiittitransposonissa on kolme geeniä keskimmäisessä ja 38 emäsparin käänteisessä terminaalisessa toistossa. Ei-yhdistettyjen transposonien geenit voivat koodata virulenssia ja muita katabolisia entsyymejä kuin antibioottiresistenssiä. Tn21 on toinen ei-komposiittitransposoni.
Mitä yhtäläisyyksiä komposiitti- ja ei-komposiittitransposonien välillä on?
- Sekä yhdistelmä- että ei-komposiittitransposoneissa on antibioottiresistenttejä geenejä.
- Heillä on myös käänteisiä toistoja.
- Lisäksi ne ovat liikkuvia DNA-segmenttejä; siksi ne voivat liikkua genomissa.
Mitä eroa on komposiittitransposoneilla ja ei-komposiittitransposoneilla?
Yhdistelmätransposonit ovat erään tyyppisiä transposoneja, joissa on terminaaliset insertiosekvenssielementit ja keskuskoodausalue. Ei-komposiittitransposonit ovat erään tyyppisiä transposoneja, joista puuttuu viereisiä insertiosekvenssielementtejä. Ne sisältävät vain käänteisiä toistoja kummassakin päässä. Joten tämä on avainero komposiittisten ja ei-komposiittisten transposonien välillä. Tn10 on yhdistetty transposoni, kun taas Tn3 ja Tn21 eivät ole yhdistelmätransposoneja.
Alla infografiassa on yhteenveto yhdistelmä- ja ei-komposiittitransposonien eroista.
Yhteenveto – komposiitti- ja ei-komposiittitransposonit
Komposiitti- ja ei-komposiittitransposoni ovat kahden tyyppisiä prokaryoottisia transposoneja. Molemmilla transposonityypeillä on keskuskoodausalue. Yhdistelmätransposoneilla on kuitenkin kaksi viereistä käänteistä insertiosekvenssielementtiä, kun taas ei-komposiittitransposoneissa ei ole viereisiä insertiosekvenssielementtejä. Sen sijaan ne sisältävät toistuvia sekvenssejä, joita tarvitaan transponointiin. Siksi tämä on avainero komposiittisten ja ei-komposiittisten transposonien välillä. Tn10 on yhdistetty transposoni, kun taas Tn3 ja Tn21 ovat kaksi ei-komposiittitransposonia. Molemmilla transposoneilla on geenejä, jotka koodaavat antibioottiresistenssiä ja katabolisia entsyymejä. Lisäksi niissä on päätekäänteisiä toistoja.
