Avainero fykosyaniinin ja allofykosyaniinin välillä on, että fykosyaniini absorboi ja emittoi lyhyemmillä aallonpituuksilla kuin allofykosyaniini.
Fykobiliproteiinit ovat vesiliukoisten proteiinien perhe, jota esiintyy syanobakteereissa ja tietyissä levälajeissa. Fykosyaniini ja allofykosyaniini ovat tämän perheen kaksi pääjäsentä.
Mikä on Phycocyanin?
Phycocyanin on pigmentti-proteiinikompleksi valoa keräävien fykobiliproteiinien perheestä. Muita tärkeitä tämän perheen jäseniä ovat allofykosyaniini ja fykoerytriini. Tämä pigmentti on klorofyllin lisäpigmentti. Yleensä kaikki fykobiliproteiinit ovat vesiliukoisia komplekseja, joita ei voi esiintyä kalvoissa, kuten karotenoidit. Sen sijaan, että ne olisivat kalvoissa, näillä pigmenteillä on taipumus aggregoitua muodostaen klustereita, jotka voivat kiinnittyä fykobilisomeina tunnetuihin kalvoihin.
Kuva 01: Uutetut fykosyaniinipigmentit (syanobakteereista)
Voimme havaita, että Phycocyaninilla on tyypillinen vaaleansininen väri, joka voi absorboida oranssia ja punaista valoa (lähes 620 nm) ja lähettää fluoresenssia (noin 650 nm). Voimme löytää tämän väripigmentin syanobakteereista, ja nimi "Phycocyanin" tulee kreikan sanasta "Phyco", joka viittaa "leviin" ja jälkiliite "syaniini" kreikan merkityksestä "Kyanos", joka viittaa "tummansiniseen".
Yleensä fykosyaniinimolekyyleillä on yhteinen rakenne kaikkien fykobiliproteiinien kanssa. Kun tarkastellaan tämän pigmentin rakennetta, se alkaa fykobiliproteiinimonomeerien kokoamisesta. Nämä monomeerit ovat heterodimeerejä, jotka koostuvat alfa- ja beeta-alayksiköistä ja niiden vastaavista kromoforeista. Kromoforit ja alayksiköt liittyvät toisiinsa kemiallisen tioeetterisidoksen kautta.
Fykosyaniinirakenteen alayksiköt sisältävät tyypillisesti kahdeksan alfa-heliksiä. Monomeerirakenteet pyrkivät aggregoitumaan spontaanisti muodostaen renkaan muotoisia trimeereitä, joilla on pyörimissymmetria ja keskuskanava. Lisäksi trimeereillä on taipumus aggregoitua pareittain muodostaen heksameerejä, joita avustaa lisälinkkeriproteiineilla. Siksi jokainen fykobilisomisauva sisältää kaksi tai useampia fykosyaniiniheksameeriä.
Mikä on allofykosyaniini?
Allofykosyaniini on fykobiliproteiiniperheestä peräisin oleva proteiinimolekyyli, ja se on klorofyllin lisäpigmentti. Muita tämän valoa keräävän fykobiliproteiiniperheen jäseniä ovat fykosyaniini, fykoerytriini ja fykoerytrosyaniini. Allofykosyaniinipigmentit voivat absorboida ja lähettää punaista valoa, ja löydämme tämän pigmentin helposti syanobakteereista ja punalevistä.
Kuva 02: Allofykosyaniinin ulkonäkö kaaviossa
Voimme eristää allofykosyaniinia eri puna- tai sinilevälajeista. Nämä levät tuottavat hieman erilaisia molekyylimuotoja. Yleensä allofykosyaniinimolekyyli sisältää kaksi erilaista alayksikköä, joita kutsutaan alfa- ja beeta-alayksiköiksi. Jokaisessa alayksikössä on yksi fykosyanobiliinin kromofori.
Allofykosyaniinilla on erilaisia sovelluksia; monia instrumentteja on kehitetty erityisesti allofykosyaniinia varten. Tätä komponenttia käytetään esimerkiksi yleisesti immuunimäärityksissä, mukaan lukien FACS, virtaussytometria jne.
Mitä yhtäläisyyksiä fykosyaniinilla ja allofykosyaniinilla on?
- Fykosyaniini ja allofykosyaniini ovat vesiliukoisia proteiineja
- Molemmat kuuluvat fykobiliproteiiniperheeseen.
Mitä eroa on fykosyaniinilla ja allofykosyaniinilla?
Fykobiliproteiinit ovat vesiliukoisten proteiinien perhe, jota esiintyy syanobakteereissa ja tietyissä levälajeissa. Fykosyaniini ja allofykosyaniini ovat tämän perheen kaksi pääjäsentä. avainero fykosyaniinin ja allofykosyaniinin välillä on se, että fykosyaniini absorboi ja emittoi lyhyemmillä aallonpituuksilla kuin allofykosyaniini.
Alla infografiassa luetellaan lisää eroja fykosyaniinin ja allofykosyaniinin välillä taulukkomuodossa vierekkäin vertailua varten.
Yhteenveto – Phycocyanin vs Allophycocyanin
Fykobiliproteiinit ovat vesiliukoisten proteiinien perhe, jota esiintyy syanobakteereissa ja tietyissä levälajeissa. Fykosyaniini ja allofykosyaniini ovat tämän perheen kaksi pääjäsentä. avainero fykosyaniinin ja allofykosyaniinin välillä on, että fykosyaniini absorboi ja emittoi lyhyemmillä aallonpituuksilla kuin allofykosyaniini.
