Avainero SEC- ja TAT-reitin välillä on, että SEC-reitti kuljettaa laskostuneita proteiineja, kun taas TAT-reitti kuljettaa laskostuneita proteiineja.
Proteiinisynteesi ja kuljetusmekanismit ovat yleisiä kaikissa eläimissä, kasveissa, arkeissa ja bakteereissa. Proteiinikuljetuksella tarkoitetaan proteiinien liikkumista solu- tai ekstrasellulaarisista osastoista toiseen. SEC-reitti ja TAT-reitti ovat kaksi tällaista järjestelmää, jotka osallistuvat proteiinien kuljetukseen. Nämä järjestelmät kuljettavat proteiineja joko sytoplasmisen kalvon tai plasmakalvon läpi. Tällaisen kuljetuksen prosessi vaihtelee organismista riippuen kehittyneen luonteen mukaan. SEC-polku on edistyneempi kuin TAT-polku, koska se koostuu erilaisista alakategorioista ja edistyneemmistä signalointijärjestelmistä. Molempien järjestelmien kuljetusreittejä helpottaa endosytoosi, eksosytoosi, proteiinien translokaatio ja kalvoliikenne.
Mikä on SEC Pathway?
SEC-reitti tai eritysreitti on kantajareitti, joka käsittää kaikkialla läsnä olevat ja yleiset vientikoneet useimpien proteiinien os alta, jotka on integroitu plasmakalvoon tai siirretty sen läpi. Tämä on olennainen reitti biologisissa järjestelmissä, joka indusoi proteiinien kuljetuksen solukalvoon, jossa ne vapautuvat. Monille proteiineille SEC-reitti tapahtuu suhteellisen vakionopeudella. Proteiinien syntetisointinopeus vaikuttaa suoraan kuljetusnopeuteen. SEC-reitin aikana proteiinien kuljetus tapahtuu laskostumattomalla tavalla.
Kuva 01: SEC Pathwayn organellit
SEC-reitille kohdistetut proteiinit koostuvat kahdesta ryhmästä. Yksi proteiiniryhmä sisältää proteiinit, jotka toimivat ER:ssä ja Golgissa varmistaakseen oikean proteiinin laskostumisen ja muuntamisen (residentit proteiinit). Toiseen proteiinien ryhmään kuuluvat proteiinit, jotka prosessoidaan ER:ssä ja Golgissa ja kuljetetaan myöhemmille osastoille, kuten plasmakalvoon, lysosomeihin ja solunulkoiseen tilaan. Näillä proteiineilla on kaksi signaalimekanismia. Yksi signaali ohjaa proteiineja siirtymään eritysreitille, ja toinen signaali käskee proteiineja lokalisoimaan sen tiettyyn organelliin reitin sisällä.
Mikä on TAT Pathway?
TAT-reitti tai kaksoisarginiinin translokaatioreitti on proteiinin kuljetusreitti, joka löytyy kasveista, bakteereista ja arkeista. Tämän reitin aikana proteiinit kuljetetaan laskostettuna lipidikalvon kaksoiskerroksen läpi. Kasveissa TAT-reitti on läsnä kloroplastin tylakoidikalvossa. Täällä proteiinit siirtyvät tylakoidionteloon. Bakteereissa sitä on sytoplasmisessa kalvossa ja se kuljettaa proteiineja solun vaippaan.
Kuva 02: Proteiinit TAT-reitillä
TAT-reitin aikana proteiinit laskostuvat ennen kuljetusta, koska ne sisältävät redox-kofaktoreja, jotka on liitetty sytoplasmaan. Taittaminen auttaa myös välttämään väärän metalli-ioni-kofaktorin asettumisen aktiiviseen kohtaan. Bakteereille ja arkeille TAT-reitin vaatimus vaihtelee. Joissakin organismeissa se on välttämätön kuljetusmekanismi, kun taas toisissa se ei ole välttämätön. Joissakin arkeoissa ja bakteereissa TAT-reitti puuttuu kokonaan. TAT-reitti riippuu myös peruskuljetusmekanismeista, kuten kalvoliikenteestä, proteiinien translokaatiosta ja endosytoosista tai eksosytoosista.
Mitä yhtäläisyyksiä SEC- ja TAT-polun välillä on?
- SEC- ja TAT-reitit ovat olennaisia komponentteja elävässä järjestelmässä kuljetustarkoituksiin.
- Ne osallistuvat proteiinien kuljettamiseen.
- Lisäksi molemmat reitit toimivat tietyn merkinantojärjestelmän mukaan.
- Sekä SEC- että TAT-reittejä helpottaa joko kalvoliikenne, proteiinien translokaatio ja endosytoosi tai eksosytoosi.
Mitä eroa SEC- ja TAT-poluilla on?
Avainero SEC- ja TAT-reitin välillä on, että SEC-reitti kuljettaa laskostumattomia proteiineja, kun taas TAT-reitti kuljettaa laskostuneita proteiineja. SEC-reitti on yleisin eläimillä. TAT-reitti on yleisin kasveissa, arkeissa ja bakteereissa. Lisäksi SEC-polku on saatavilla kaikissa eläimissä ja toimii olennaisena komponenttina. Toisa alta TAT-polku voi olla välttämätön, ei-välttämätön tai puuttua kokonaan.
Alla oleva infografiikka esittelee SEC- ja TAT-polkujen väliset erot taulukkomuodossa vierekkäin vertailua varten.
Yhteenveto – SEC vs TAT Pathway
Proteiinisynteesi ja kuljetusmekanismit ovat yleisiä kaikissa eläimissä, kasveissa, arkeissa ja bakteereissa. Proteiinin kuljetukseen liittyy proteiinien liikkuminen solu- tai ekstrasellulaarisista osastoista toiseen. SEC-reitti ja TAT-reitti ovat kaksi tällaista järjestelmää, jotka osallistuvat proteiinien kuljetukseen. avainero SEC- ja TAT-reitin välillä on, että SEC-reitti kuljettaa laskostumattomia proteiineja, kun taas TAT-reitti kuljettaa laskostettuja proteiineja. Molempien järjestelmien kuljetusreittejä helpottaa endosytoosi, eksosytoosi, proteiinien translokaatio ja kalvoliikenne.