Avainero DNA-transposonien ja retrotransposonien välillä on, että DNA-transposonit ovat liikkuvia geneettisiä elementtejä, jotka siirtyvät genomissa paikasta toiseen leikkaa ja liitä -mekanismia käyttämällä, kun taas retrotransposonit ovat liikkuvia geneettisiä elementtejä, jotka liikkuvat paikasta. toiseen genomissa käyttämällä kopioi ja liitä -mekanismia.
Liikkuvat geneettiset elementit (MGE) ovat DNA:n segmenttejä, jotka koodaavat tiettyjä entsyymejä ja proteiineja, jotka välittävät niiden liikkumista genomissa tai jotka voidaan siirtää lajista toiseen. Ne tunnetaan myös itsekkäinä geneettisinä elementteinä. Siirrettävät elementit edustavat yhtä useista liikkuvien geneettisten elementtien tyypeistä. Transposoituvia elementtejä on kahta päätyyppiä: DNA-transposonit ja retrotransposonit. Siksi DNA-transposonit ja retrotransposonit ovat liikkuvia geneettisiä elementtejä, jotka voivat liikkua genomissa paikasta toiseen.
Mitä DNA-transposonit ovat?
DNA-transposonit ovat liikkuvia geneettisiä elementtejä, jotka siirtyvät genomissa paikasta toiseen leikkaa ja liitä -mekanismin avulla. Ne kuuluvat luokan II transponoitaviin elementteihin, jotka liikkuvat DNA-välituotteen läpi. Tämä on vastoin luokan I transposoituvia elementtejä (retrotransposoneja), jotka liikkuvat RNA-välituotteen läpi. Normaalisti DNA-transposonit liikkuvat genomissa käyttämällä leikkaa ja liitä -menetelmää. Tämä menetelmä vaatii transposaasientsyymin, joka katalysoi DNA:n liikkumista sen nykyisestä sijainnista genomissa ja insertoimista uuteen paikkaan.
Kuva 01: DNA-transposonit
Tämä transpositio vaatii kolme DNA-kohtaa transposonissa (kaksi transposonin kummassakin päässä, joita kutsutaan terminaaleiksi käänteisiksi toistoiksi ja yksi kohdekohdassa). Transposaasientsyymi sitoutuu transposonin terminaalisiin käänteisiin toistoihin ja välittää transposonin päiden synapsia. Sitten transposaasientsyymi irrottaa elementin alkuperäisen luovuttajakohdan viereisestä DNA:sta ja välittää transposonin liittymistä uuteen insertiokohtaan genomissa. Transposonin lisääminen uuteen paikkaan aiheuttaa lyhyitä aukkoja lisätyn segmentin kummallekin puolelle. Isäntäjärjestelmät korjaavat nämä aukot, mikä johtaa kohdesekvenssin kaksoiskappaleeseen (TSD), joka on ominaista transponoimiselle.
Mitä retrotransposonit ovat?
Retrotransposonit ovat liikkuvia geneettisiä elementtejä, jotka siirtyvät genomissa paikasta toiseen kopioi ja liitä -mekanismin avulla. Ne kuuluvat luokan I siirrettäviin elementteihin. Luokan I transposoituvat elementit (retrotransposonit) liikkuvat genomissa olevan RNA-välituotteen läpi. Ne ovat eräänlaisia geneettisiä komponentteja, jotka kopioivat ja liittävät itsensä eri genomiin.
Kuva 02: Retrotransposonit
Ensinnäkin ne transkriptoidaan DNA:sta RNA:ksi. Sitten tuotettu RNA käänteiskirjoitetaan DNA:ksi. Tämä kopioitu DNA insertoidaan myöhemmin takaisin genomiin uuteen paikkaan. Käänteiskopioija katalysoi käänteistranskriptaasi. Käänteistranskriptaasia koodaa usein itse retrotransposoni. Integraation suorittaa integraasi-niminen entsyymi. Lisäksi niitä on yleensä kolmea tyyppiä: pitkät terminaalit toistot (LTR), pitkät välissä olevat ydinelementit (LINE) ja lyhyet välissä olevat ydinelementit (SINE).
Mitä yhtäläisyyksiä DNA-transposonien ja retrotransposonien välillä on?
- DNA-transposonit ja retrotransposonit ovat liikkuvia geneettisiä elementtejä.
- Molemmat luokitellaan siirrettäviin elementteihin.
- Molemmat tunnetaan hyppygeeneinä.
- Ne voivat liikkua genomissa paikasta toiseen.
- Ne ovat evoluution kann alta erittäin tärkeitä.
Mitä eroa on DNA-transposoneilla ja retrotransposoneilla?
DNA-transposonit ovat liikkuvia geneettisiä elementtejä, jotka siirtyvät genomissa paikasta toiseen leikkaa ja liitä -mekanismin avulla, kun taas retrotransposonit ovat liikkuvia geneettisiä elementtejä, jotka siirtyvät genomissa paikasta toiseen käyttämällä kopiota ja liitä mekanismi. Siten tämä on avainero DNA-transposonien ja retrotransposonien välillä. Lisäksi DNA-transposonit kuuluvat luokan II transposoituviin elementteihin, kun taas retrotransposonit kuuluvat luokan I transposoituviin elementteihin.
Alla oleva infografiikka esittelee DNA-transposonien ja retrotransposonien väliset erot taulukkomuodossa vierekkäin vertailua varten.
Yhteenveto – DNA-transposonit vs retrotransposonit
DNA-transposonit ja retrotransposonit ovat liikkuvia geneettisiä elementtejä. DNA-transposonit siirtyvät genomissa paikasta toiseen käyttämällä leikattua pastamekanismia. Retrotransposonit siirtyvät genomissa paikasta toiseen käyttämällä kopioi ja liitä -mekanismia. Joten tämä tiivistää eron DNA-transposonien ja retrotransposonien välillä.
