Avainero signaalisekvenssin ja signaalilapun välillä on, että signaalisekvenssi on proteiineissa oleva aminohapposekvenssi, joka auttaa saamaan solun siirtämään proteiineja organelleihin tai solukalvoon, kun taas signaalilappu on aminohapposekvenssi proteiinit, jotka auttavat solua siirtämään proteiineja sytosolista tumaan.
Proteiinin kohdentaminen tai lajittelu on biologinen mekanismi, jolla proteiinit kuljetetaan sopiviin paikkoihinsa solussa tai sen ulkopuolella. Itse proteiinin sisältämä tieto ohjaa tätä toimitusprosessia. Oikea proteiinien lajittelu on ratkaisevan tärkeää solulle. Lajittelun virheet tai toimintahäiriöt voivat aiheuttaa useita sairauksia. Signaalisekvenssi ja signaalilappu ovat kaksi sekvenssiä, jotka koostuvat proteiinien aminohapoista, jotka osallistuvat proteiinien kohdentamiseen tai lajitteluun.
Mikä on signaalisekvenssi?
Signaalisekvenssi on proteiinien aminohapposekvenssi, joka saa solun siirtämään proteiinit, yleensä organelleihin tai solukalvoon. Signaalisekvenssi tunnetaan myös signaalipeptidinä. Se on lyhyt peptidi, joka sisältää 16-30 aminohappoa. Se on läsnä useimpien vasta syntetisoitujen proteiinien N-päässä (joskus C-päässä). Signaalisekvenssi auttaa proteiineja kohti eritysreittejä. Signaalisekvenssejä sisältäviin proteiineihin kuuluvat ne, jotka sijaitsevat organelleissa (endoplasminen verkkokalvo, Golgi-laitteisto tai endosomit), jotka erittyvät solusta tai liitetään useimpiin solukalvoihin.
Kuva 01: Signaalisekvenssi
Normaalisti useimmilla tyypin I kalvoon sitoutuneilla proteiineilla on signaalisekvenssejä. Suurin osa tyypin II ja monivälisistä kalvoon sitoutuneista proteiineista on kuitenkin kohdistettu eritysreitille niiden ensimmäisen transmembraanisen domeenin kautta, joka tunnetaan "kohdepeptidinä". Lisäksi prokaryooteissa signaalisekvenssit ohjaavat vasta syntetisoidut proteiinit SecYEG-proteiinia johtavaan kanavaan, joka on läsnä plasmamembraanissa. Lisäksi eukaryooteissa on olemassa homologinen järjestelmä, jossa signaalisekvenssit ohjaavat vasta syntetisoidut proteiinit Sec61-kanavalle. Vaikka tällä kanavalla on rakenteellista ja sekvenssihomologiaa SecYEG:n kanssa, se on läsnä endoplasmisessa retikulumissa.
Mikä on signaalikorjaus?
Signaalilappu on proteiineissa oleva aminohapposekvenssi, joka saa solun siirtämään proteiineja sytosolista tumaan. Signaalilappu sisältää tietoa tietyn proteiinin lähettämiseksi osoitettuun paikkaan solussa. Todennäköisimmin signaalipolku ohjaa proteiinia sytosolista ytimeen. Se koostuu aminohappotähteistä, jotka ovat kaukana toisistaan primäärisekvenssissä. Nämä aminohapot sijaitsevat kuitenkin lähellä toisiaan laskostuneen proteiinin tertiaarisessa rakenteessa.
Kuva 02: Signaalikorjaus
Toisin kuin signaalisekvenssit, signaalilaput eivät lohkea kypsästä proteiinista lajitteluprosessin jälkeen. Signaalipisteitä on erittäin vaikea ennustaa. Ydinpaikannussignaalit ovat yleensä signaalilappuja, vaikka joitain signaalisekvenssejä on myös olemassa. Lisäksi ytimeen tarkoitetuista proteiineista löytyy signaaliläiskiä, jotka mahdollistavat niiden selektiivisen kuljetuksen sytosolista ytimeen ydinhuokoskompleksien kautta.
Mitä yhtäläisyyksiä signaalisekvenssillä ja signaalipatchilla on?
- Signaalisekvenssi ja signaalilappu ovat kaksi sekvenssiä, jotka osallistuvat proteiinien kohdistamiseen tai lajitteluun.
- Molemmat sekvenssit ovat läsnä proteiineissa.
- Nämä sekvenssit ovat lyhyitä aminohapposekvenssejä.
- Molempien sekvenssien virheet voivat aiheuttaa toimintahäiriöitä proteiinien lajittelussa, mikä johtaa useisiin sairauksiin.
Mitä eroa signaalisekvenssillä ja signaalipatchilla on?
Signaalisekvenssi on proteiineista löytyvä aminohapposekvenssi, joka saa solun siirtämään proteiinit organelleihin tai solukalvoon, kun taas signaalilappu on proteiineista löytyvä aminohapposekvenssi, joka kehottaa solua siirtää proteiineja yleensä sytosolista ytimeen. Siten tämä on avainero signaalisekvenssin ja signaalikorjauksen välillä. Lisäksi kypsät proteiinit pilkkovat signaalisekvenssin lajittelun jälkeen, kun taas kypsät proteiinit eivät katkaise signaalilappua lajittelun jälkeen.
Seuraavassa taulukossa on yhteenveto signaalisekvenssin ja signaalipaikan välillä.
Yhteenveto – signaalisekvenssi vs signaalikorjaus
Signaalisekvenssi ja signaalilappu ovat kaksi sekvenssiä, jotka löytyvät proteiineista. Ne ovat välttämättömiä proteiinien kohdentamiseen tai lajitteluun. Signaalisekvenssi saa solun siirtämään proteiinit, yleensä organelleihin tai solukalvoon. Toisa alta signaalilappu kehottaa solua siirtämään proteiineja, yleensä sytosolista ytimeen. Joten tämä on avainero signaalisekvenssin ja signaalikorjauksen välillä.
