Avainero geeli- ja paperielektroforeesin välillä on, että geelielektroforeesissa erotusväliaine on agaroosigeeli, kun taas paperielektroforeesissa erotusväliaine on puskuriliuokseen upotettu paperiliuska.
Elektroforeesi on analyyttinen tekniikka, joka on hyödyllinen näytteen analysoinnissa käyttämällä näytteessä olevien kemiallisten aineiden sähköisiä ominaisuuksia. Tässä voimme tarkkailla dispergoituneen liuenneen aineen liikettä analysoitavassa väliaineessa. Siksi voimme määrittää kemiallisen lajin liikkeen suhteessa väliaineeseen. Geelielektroforeesi ja paperielektroforeesi ovat kaksi tärkeää tekniikkaa kemiassa.
Mikä on geelielektroforeesi?
Geelielektroforeesia voidaan kuvata menetelmäksi makromolekyylien erottamiseksi ja analysoimiseksi koosta ja varauksesta riippuen. Makromolekyylit voivat tässä yhteydessä viitata DNA:han, RNA:han, proteiineihin ja niiden fragmentteihin. Tämä menetelmä on käyttökelpoinen kliinisessä kemiassa proteiinien erottamiseen varauksen tai koon mukaan. Lisäksi biokemiassa ja molekyylibiologiassa DNA- ja RNA-fragmenttien koon arvioimiseksi on tärkeää erottaa DNA- ja RNA-fragmenttien sekapopulaatio niiden pituuden perusteella. Lisäksi voimme käyttää sitä proteiinien erottamiseen niiden varauksen perusteella.
Kuva 01: Geelielektroforeesiinstrumentointi
Voimme erottaa nukleiinihappomolekyylejä käyttämällä sähkökenttää negatiivisesti varautuneiden molekyylien liikkumiseen agaroosin tai muiden aineiden matriisin läpi. Tässä prosessissa lyhyemmät molekyylit voivat liikkua nopeammin, kun taas pidemmät molekyylit liikkuvat hitaammin. Tämä johtuu siitä, että lyhyemmät molekyylit voivat liikkua helposti geelihuokosten läpi. Kutsumme tätä fragmenttien liikettä huokosten läpi "seulomiseksi". Lisäksi emme yleensä voi erottaa proteiineja koon mukaan tästä menetelmästä, koska proteiinit ovat liian suuria siivilöitäväksi geelihuokosista. Voimme kuitenkin käyttää tätä prosessia nanopartikkelien erottamiseen.
Mikä on paperielektroforeesi?
Paperielektroforeesia voidaan kuvata erotukseksi käyttämällä puskuriliuokseen liotettuja suodatinpapereita. Yleensä puskuriliuoksena käytämme dietyylibarbituurihappoa ja alkaliin liuotettua barbituurihappoa. Tämän puskuriliuoksen pH-arvo on pH 8,6. Lisäksi voimme laittaa pienen määrän seerumia paperille, jonka läpi johdetaan tasavirta useiden tuntien ajan.
Paperielektroforeesi on tärkeä pienten, varautuneiden molekyylien, mukaan lukien aminohappojen ja pienten proteiinien, erottamisessa. Tässä meidän on kostutettava suodatinpaperiliuska puskurilla ja upotettava nauhan päät puskurisäiliöihin, jotka sisältävät elektrodeja. Ensimmäinen tätä menetelmää käyttänyt henkilö oli Konig vuonna 1937. Löydöksessään hän otti käyttöön paperilla liotetun puskurin vyöhykeelektroforeesia varten ja ehdotti myös UV-ilmaisua.
Mitä eroa on geeli- ja paperielektroforeesilla?
Elektroforeesi on analyyttinen tekniikka, joka on hyödyllinen näytteen analysoinnissa käyttämällä näytteessä olevien kemiallisten aineiden sähköisiä ominaisuuksia. Geelielektroforeesi ja paperielektroforeesi ovat kaksi tärkeää elektroforeesimenetelmää. Keskeinen ero geelin ja paperin elektroforeesin välillä on, että geelielektroforeesissa erotusväliaine on agaroosigeeli, kun taas paperielektroforeesissa erotusväliaine on puskuriliuokseen upotettu paperiliuska.
Alla on yhteenveto geeli- ja paperielektroforeesin eroista taulukkomuodossa vierekkäin vertailua varten.
Yhteenveto – geeli vs paperielektroforeesi
Geelielektroforeesi on menetelmä makromolekyylien erottamiseksi ja analysoimiseksi koosta ja varauksesta riippuen, kun taas paperielektroforeesi on erotus käyttämällä puskuriliuokseen liotettuja suodatinpapereita. Keskeinen ero geeli- ja paperielektroforeesin välillä on, että geelielektroforeesissa erotusväliaine on agaroosigeeli, kun taas paperielektroforeesissa erotusväliaine on puskuriliuokseen upotettu paperiliuska.