Avainero Rho-riippuvaisen ja Rho-riippumattoman lopetuksen välillä on, että Rho-riippuvaisessa terminaatiossa Rho-tekijä sitoutuu transkriptiin ja lopettaa transkription katkaisemalla vetysidokset templaatin ja transkriptin välillä, kun taas Rho-riippumaton lopetus lopettaa transkription tuotetaan hiusneulasilmukkarakenne ja sitten U-rikas alue transkriptioon.
Transkriptio on yksi geenin ilmentymisen kahdesta vaiheesta. Se on prosessi, joka tuottaa mRNA-sekvenssin geenin DNA-sekvenssiin piilotetusta geneettisestä tiedosta. Transkriptio tapahtuu kolmen vaiheen kautta: aloitus, elongaatio ja lopetus. RNA-polymeraasientsyymi sitoutuu geenin promoottorisekvenssiin ja alkaa katalysoida RNA-juosteen synteesiä. Kunnes terminaattorisekvenssi on löydetty, RNA-polymeraasi lisää nukleotideja ja rakentaa RNA-juosteen. Prokaryooteissa lopetus tapahtuu kahden suuren lopetusstrategian kautta: Rho-riippuvainen lopetus ja Rho-riippumaton lopetus. Rho-tekijä on proteiini, jolla on helikaasiaktiivisuutta.
Mikä on Rho-riippuvainen irtisanominen?
Rho-riippuvainen lopetus on yksi kahdesta prokaryooteissa esiintyvästä transkription lopetusstrategiatyypistä. Rho-tekijä on proteiini, jolla on helikaasiaktiivisuutta.
Kuva 01: Rho-riippuvainen irtisanominen
Rho-proteiini sitoutuu RNA-transkriptiin ja liikkuu RNA-polymeraasia pitkin 5'-3'-suunnassa, mikä edistää vetysidosten dissosiaatiota DNA-templaatin ja RNA-transkriptin välillä. Kun Rho-tekijä saavuttaa transkriptiokuplan, se vetää DNA/RNA-hybridin erilleen ja vapauttaa transkriptin transkriptiokuplasta. Kun tämä tapahtuu, se lopettaa transkription.
Mikä on Rho Independent lopettaminen?
Rho-riippumaton lopetus on toinen strategia, joka lopettaa prokaryoottisen transkription. Yleensä terminaattorialueella on käänteinen toistosekvenssi. Välittömästi käänteisen toistosekvenssin jälkeen on adeniinirikas alue (AAAA). Kun RNA-polymeraasi liikkuu eteenpäin, se tuottaa mRNA-sekvenssin. Koska nämä kaksi aluetta ovat komplementaarisia käänteisen toistosekvenssin alueella, se muodostaa hiusneulasilmukkarakenteen vetysidoksen vuoksi. Seuraava alue on U-rikkaiden alue. Hiusneularakenne lopettaa RNA-polymeraasiaktiivisuuden.
Kuva 02: Rhon riippumaton irtisanominen
Lisäksi U-rikkailla alueilla transkriptin U-emästen ja mallin A-emästen välillä on heikko vuorovaikutus. Nämä heikot adeniini-urasiili-sidokset epävakauttavat DNA-templaatin ja RNA-transkriptin ja erottavat toisensa. Lopulta transkriptio vapautuu transkriptiopaikasta.
Mitä yhtäläisyyksiä Rho-riippuvaisen ja Rho-riippumattoman lopettamisen välillä on?
- Rho-riippuvainen ja Rho-riippumaton lopetus ovat kaksi pääasiallista lopetusstrategiaa, joita esiintyy prokaryooteissa.
- Molemmat muodot vapauttavat transkription DNA-templaatista transkription lopettamiseksi.
Mitä eroa on Rho-riippuvaisen ja Rho-riippumattoman lopettamisen välillä?
Rho-riippuvainen lopetus on Rho-proteiinin välittämä, kun taas Rhosta riippumaton lopetus tapahtuu hiusneulasilmukkarakenteen muodostumisen kautta. Joten tämä on avainero Rho-riippuvaisen ja Rho-riippumattoman päätteen välillä. Lisäksi Rho-proteiini käyttää ATP-energiaa, kun taas Rho-riippumaton lopetus ei sisällä Rho-proteiinia eikä käytä ATP-energiaa. Siksi tämä on myös merkittävä ero Rho-riippuvaisen ja Rho-riippumattoman päätteen välillä.
Alla oleva infografiikka näyttää enemmän vertailuja, jotka liittyvät eroon Rho-riippuvaisen ja Rho-riippumattoman päätteen välillä.
Yhteenveto – Rho-riippuvainen vs. Rho-riippumaton lopettaminen
Rho-riippuvainen ja Rho-riippumaton lopetus ovat kaksi pääasiallista prokaryooteissa esiintyvää transkription lopetusmekanismia. Rho-proteiini on vastuussa transkription lopettamisesta Rho-riippuvaisessa terminaatiossa. Sitä vastoin Rho-riippumaton lopetus tapahtuu hiusneulasilmukkarakenteen muodostumisen kautta. Joten tämä on avainero Rho-riippuvaisen ja Rho-riippumattoman päätteen välillä.
