Avainero sigmatekijän ja rho-tekijän välillä on, että sigmatekijä on proteiini, jota tarvitaan transkription aloittamiseen bakteereissa, kun taas rho-tekijä on proteiini, jota tarvitaan transkription lopettamiseen bakteereissa.
Sigma-tekijä ja rho-tekijä ovat kaksi tärkeää tekijää bakteerien transkriptiossa. Bakteeritranskriptio on prosessi, jossa bakteeri-DNA:n pala kopioidaan äskettäin valmistettuun mRNA-juosteeseen (lähetti-RNA). Tätä prosessia katalysoi entsyymi, joka tunnetaan nimellä RNA-polymeraasi. Bakteerit ovat vahvasti riippuvaisia transkriptiosta ja translaatiosta reagoidakseen ympäristöönsä oikein. Bakteerien RNA-polymeraasi koostuu ytimestä ja holoentsyymirakenteesta. Ydin sisältää alayksiköt β, β′, α ja 2ω, kun taas holoentsyymi sisältää sigmatekijän. Lisäksi RNA-polymeraasin aputekijä, joka tunnetaan nimellä rho-tekijä, on myös erittäin tärkeä bakteerien transkriptiolle.
Mikä on Sigma Factor?
Sigmatekijä tai spesifisyystekijä on proteiini, jota tarvitaan transkription aloittamiseen bakteereissa. Se on bakteerin transkription aloitustekijä. Tämä tekijä mahdollistaa RNA-polymeraasientsyymin sitoutumisen tiettyyn DNA-alueeseen, jota kutsutaan promoottorialueeksi transkription aikana. Sigmatekijä on normaalisti homologinen arkeaalisen transkriptiotekijä B:n ja eukaryoottisen transkriptiotekijän TF11B:n kanssa. Lisäksi tietyn geenin spesifinen sigmatekijä vaihtelee geenin ja ympäristösignaalien mukaan. RNA-polymeraasi valitsee promoottorit siihen liittyvän sigmatekijän mukaan.
Kuva 01: Sigma-tekijä
Sigmatekijä löytyy myös kasvien kloroplastista osana plastidikoodaamaa polymeraasia (PEP). Sigmatekijä ja RNA-polymeraasi tunnetaan kokonaisuudessaan RNA-polymeraasiholoentsyyminä. Sigmatekijän molekyylipaino on noin 70 kDa. Transkription alkamisen jälkeen sigmatekijä dissosioituu kompleksista. Sitten RNA-polymeraasi jatkaa elongaatiota, kunnes transkriptio päättyy.
Mikä on Rho Factor?
Rho-tekijä on prokaryoottinen proteiini, joka osallistuu transkription lopettamiseen. Rho-tekijä sitoutuu yleensä transkription terminaattorin taukokohtaan. Tämä kohta on yksijuosteisen RNA:n paljastettu alue lähellä avointa lukukehystä sytosiinirikkaissa guaniiniköyhissä sekvensseissä. Se on välttämätön transkriptioproteiini prokaryooteissa. Escherichia colissa rho-tekijä on noin 274,6 kDa:n identtisten alayksiköiden heksameeri. Jokaisella alayksiköllä on RNA:ta sitova domeeni ja ATP-hydrolyysidomeeni. Lisäksi rho-tekijän tehtävänä on helikaasiaktiivisuus.
Kuva 02: Rho Factor
Rho-tekijä sitoutuu RNA-molekyyliin ja käyttää sitten ATPaasiaktiivisuuttaan energian tuottamiseen RNA-molekyylien siirtämiseen. Rho-tekijä suorittaa translokaatiota, kunnes se saavuttaa RNA-DNA-kierteisen alueen, jossa se purkaa hybridi- (RNA-DNA) -dupleksirakenteen. Tämä prosessi pysäyttää RNA-polymeraasin lopetuskohdassa ja lopettaa transkriptioprosessin.
Mitä yhtäläisyyksiä Sigma-tekijällä ja Rho-tekijällä on?
- Sigma-tekijä ja rho-tekijä ovat kaksi tärkeää tekijää bakteerien transkriptiossa.
- Molempia esiintyy vain prokaryooteissa.
- Ne ovat proteiineja, jotka koostuvat aminohapoista.
- Molemmat ovat nukleiinihappoja sitovia proteiineja.
- Prokaryootit luottavat voimakkaasti näihin tekijöihin mRNA:n tuottamiseksi, joka voi tuottaa erikoisia proteiineja ja auttaa niitä reagoimaan erityisesti ympäristöönsä.
Mitä eroa Sigma-tekijällä ja Rho-tekijällä on?
Sigma-tekijä on proteiini, jota tarvitaan transkription aloittamiseen bakteereissa, kun taas rho-tekijä on proteiini, jota tarvitaan transkription lopettamiseen bakteereissa. Joten tämä on avainero sigma-tekijän ja rho-tekijän välillä. Lisäksi sigmatekijä on DNA:ta sitova proteiini, kun taas rho-tekijä on RNA:ta sitova proteiini.
Alla oleva infografiikka esittelee sigmatekijän ja rho-tekijän väliset erot taulukkomuodossa vierekkäin vertailua varten.
Yhteenveto – Sigma Factor vs Rho Factor
Transkriptio on prosessi, jossa DNA:ssa oleva tieto kopioidaan uudeksi molekyyliksi, jota kutsutaan mRNA:ksi (lähetti-RNA:ksi). Tämä m-RNA on viime kädessä mukana tietyn proteiinin tuottamisessa. Sigma-tekijä ja rho-tekijä ovat kaksi tärkeää tekijää bakteerien transkriptiolle. Ne ovat proteiineja. Sigmatekijä osallistuu transkription aloittamiseen bakteereissa. Rho-tekijä on vastuussa transkription lopettamisesta bakteereissa. Näin ollen tämä on yhteenveto sigma-tekijän ja rho-tekijän välisestä erosta.
