Avainero CDS:n ja cDNA:n välillä on se, että CDS tai koodaava sekvenssi on transkriptin osa, joka todella transloidaan proteiiniksi, kun taas cDNA-sekvenssi on DNA-sekvenssi, joka on johdettu mRNA:sta käänteistranskriptiolla.
Geeni on proteiinia koodaava nukleotidisekvenssi. Se koostuu eri alueista, kuten promoottorialue, transkription aloituskohta, eksonit, aloituskodoni, intronit ja lopetuskodoni. Siksi geenissä on sekä koodaavia että ei-koodaavia sekvenssejä. Koodaavat sekvenssit tai CDS viittaavat eksoneihin ja kahteen kodoniin, jotka ovat aloituskodoni ja lopetuskodoni. Se on sekvenssi, joka todella muunnetaan proteiiniksi. Sitä vastoin cDNA on DNA-sekvenssi, joka on johdettu mRNA:sta käänteistranskriptiolla.
Mikä on CDS?
CDS tai koodaava sekvenssi on osa geeniä, joka todella transloituu proteiiniksi. Se koostuu eksoneista ja kahdesta kodonista AUG-kodonina ja lopetuskodonina. Toisin kuin cDNA, CDS ei sisällä kahta transloimatonta aluetta: 5' UTR ja 3 UTR. Lisäksi intronit eivät sisälly CDS:ään.
Kuva 01: Koodaussekvenssi
Koko genomiin ja yksilöön verrattuna koodaavat sekvenssit ovat pieni osa. Koodaava sekvenssi koostuu tarvittavasta nukleotidisekvenssistä proteiinin aminohapposekvenssin muodostamiseksi.
Mikä on cDNA?
cDNA tai komplementaarinen DNA on DNA-sekvenssi, joka on luotu mRNA-sekvenssistä. Se syntetisoidaan käänteistranskriptio-nimisellä prosessilla. Entsyymi käänteistranskriptaasi katalysoi cDNA-synteesiä, ja mRNA-sekvenssi toimii templaattina cDNA-synteesiä varten. Pohjimmiltaan eukaryoottisolujen mRNA voidaan uuttaa ja puhdistaa cDNA:n valmistamiseksi. Kun cDNA on rakennettu mRNA:sta, ne voidaan sitten kloonata bakteerisoluun cDNA-kirjastojen valmistamiseksi. cDNA-kirjastot ovat tärkeitä koodaavien alueiden, geenitoimintojen ja geenien ilmentymisen jne. analysoinnissa.
Kuva 02: cDNA
Toisin kuin koodaava sekvenssi, cDNA sisältää kaksi UTR:ää, jotka ovat 3' UTR ja 5' UTR. Kuten koodaava sekvenssi, cDNA ei sisällä introneita.
Mitä yhtäläisyyksiä CDS:n ja cDNA:n välillä on?
- CDS ja cDNA ovat nukleiinihappoja.
- Ne on valmistettu deoksiribonukleotideista.
- Sekä CDS että CDNA eivät sisällä introneita, jotka ovat ei-koodaavia alueita.
- Molemmat sisältävät geneettisen koodin tai tiedot proteiinin tuottamiseksi.
Mitä eroa CDS:llä ja cDNA:lla on?
CDS tai koodaava sekvenssi on geenin osa, joka todella transloituu proteiiniksi. Toisa alta cDNA-sekvenssi on DNA-sekvenssi, joka on johdettu mRNA:sta käänteistranskriptiolla. Joten tämä on avainero CDS:n ja cDNA:n välillä. Lisäksi CDS koostuu eksoneista ja kahdesta kodonista, jotka ovat aloituskodoni ja lopetuskodoni. Sitä vastoin cDNA koostuu täydellisestä mRNA-sekvenssistä ja kahdesta UTR:stä.
Lisäksi cDNA-synteesi tehdään keinotekoisesti mRNA:sta käänteistranskriptiolla, kun taas CDS:itä löytyy genomisesta DNA:sta.
Alla infografiassa on enemmän vertailuja CDS:n ja cDNA:n välisen eron havaitsemiseksi.
Yhteenveto – CDS vs cDNA
Koodaava sekvenssi ja cDNA ovat kahden tyyppisiä nukleotidisekvenssejä. Koodaava sekvenssi sijaitsee geenissä, kun taas cDNA syntetisoidaan keinotekoisesti. Koodaavassa sekvenssissä on eksoneja ja kaksi kodonia, kun taas cDNA:lla on mRNA-sekvenssi ja kaksi UTR:ää. Sekä CDS:llä että cDNA:lla on vain ne nukleotidisekvenssit, jotka todella muuttuvat proteiiniksi. Ne eivät sisällä introneja. Toisin kuin CDS, cDNA-synteesiprosessi vaatii käänteiskopioijaentsyymiä. Myös cDNA voi muuntua cDNA-kirjastoiksi. Näin ollen tämä tiivistää eron CDS:n ja cDNA:n välillä.
