Avainero ORF:n ja eksonin välillä on, että ORF tai avoin lukukehys on DNA-sekvenssin jakso, joka alkaa translaation aloituskohdasta (aloituskodoni) ja päättyy translaation lopetuskohtaan (lopetuskodoni), kun taas eksoni on nukleotidisekvenssi geenissä, joka koodaa aminohappoja.
Avoin lukukehys on osa lukukehystä. Ribosomit lukevat lukukehyksiä proteiinien valmistamiseksi. ORF on jatkuva kodonijakso, joka tuottaa täysin toimivan proteiinin. Se alkaa aloituskodonilla ja päättyy lopetuskodonilla. ORF:n sisällä ei ole lopetuskodonia, joka katkaisee koodaussekvenssin. Käännös alkaa aloituskodonista ja päättyy lopetuskodoniin. Eksoni on geenin nukleotidisekvenssi. Se koodaa proteiinin aminohappoja. Siksi eksonit ovat geenin koodaavia alueita.
Mikä on ORF?
Avoin lukukehys eli ORF on nukleotidisekvenssin jatkuva jakso, joka alkaa aloituskodonilla ja päättyy lopetuskodoniin. Yksinkertaisesti sanottuna ORF viittaa nukleotidisekvenssin alueeseen, joka sijaitsee aloitus- ja lopetuskodonien välissä. Välissä ei ole ORF:ää katkaisevaa lopetuskodonia. Nukleotidisekvenssi aloitus- ja lopetuskodonin välillä koodaa aminohappoja. Yleensä aloituskodoni on ATG, kun taas lopetuskodonit ovat TAG, TAA ja TGA. ORF antaa toiminnallisen proteiinin, kun se transkriptoidaan ja transloidaan. Siksi ORF sisältää aloituskodonin, useita kodoneja keskialueella ja lopetuskodonin. Mielenkiintoista on, että ORF:n pituus voidaan jakaa kolmella.
Kuva 01: ORF
Prokaryooteissa, koska introneja ei ole, ORF on geenin koodaava alue, joka transkriptoi suoraan mRNA:ksi. Koska eukaryooteissa on introneita, ORF on kodonisekvenssi, joka syntyy prosessoinnin tai RNA-silmukoinnin jälkeen. ORF on todiste, joka auttaa geenien ennustamisessa, koska pitkät ORF:t ovat todennäköisesti osa geeniä.
Mikä on eksoni?
Eksonit ovat geenien koodaavia nukleotidisekvenssejä, jotka muuntuvat proteiineiksi. Ne ovat intronin kummallakin puolella. Kun ei-koodaavat sekvenssit on poistettu pre-mRNA:sta, kypsä mRNA-molekyyli käsittää vain eksonisekvenssit. Sitten lopullisen RNA-molekyylin (kypsän mRNA:n) nukleotidisekvenssi muuttuu tietyn proteiinin aminohapposekvenssiksi.
Kuva 02: Exons
Melkein kaikilla geeneillä on alkuperäinen nukleotidisekvenssi, joka erottaa sen geeninä DNA- tai RNA-pääjuosteesta, joka tunnetaan nimellä Open Reading Frame (ORF. Joissakin geeneissä kaksi ORF-sekvenssiä merkitsee koko geenin ja eksonit). Vaikka näyttää siltä, että eksonit ilmentyvät aina geeneissä, on tapauksia, joissa intronisekvenssit puuttuvat eksoniin aiheuttaen mutaatioita, ja tätä prosessia kutsutaan eksonisaatioksi.
Mitä yhtäläisyyksiä ORF:n ja Exonin välillä on?
- Sekä ORF että eksoni ovat nukleotidisekvenssejä.
- Pitkä ORF ja eksonit ovat osia geenistä.
- Molemmissa on koodaussekvenssit.
Mitä eroa ORF:llä ja Exonilla on?
ORF ja eksoni ovat nukleotidisekvenssejä. ORF viittaa mihin tahansa DNA-sekvenssin osaan, joka sijaitsee aloituskodonin ja lopetuskodonin välissä. Sitä vastoin eksoni on aminohappoja koodaavan geenin koodaava nukleotidisekvenssi. Siksi tämä on avainero ORF:n ja eksonin välillä. Eksonit ovat osia geenistä, kun taas pitkä ORF on todennäköisesti osa geeniä. Lisäksi eksonin molemmilla puolilla on introneita, kun taas ORF ei sisällä introneja.
Alla infografiassa on yhteenveto ORF:n ja eksonin eroista taulukkomuodossa.
Yhteenveto – ORF vs Exon
Avoin lukukehys (ORF) on osa lukukehystä. Se on jatkuva DNA-sekvenssin jakso, joka alkaa aloituskodonilla ja päättyy lopetuskodonilla. Eksoni on geenin nukleotidisekvenssi. Se koodaa osaa mRNA-sekvenssistä. Siksi eksonit ovat osia geenisekvenssistä, jotka ilmentyvät proteiinissa. Näin ollen tämä tiivistää eron ORF:n ja eksonin välillä.
