Avainero komposiittitransposonien ja IS-elementtien välillä on se, että komposiittitransposonit ovat eräänlaisia transposoneja, jotka kuljettavat apugeenejä, kuten antibioottiresistenssigeenejä, kun taas IS-elementit (tai lisäyssekvenssielementit) ovat transposoituvia elementtejä, jotka kuljettavat vain geenejä, jotka kooditransposaasi, joka katalysoi transponointitoimintoa.
Transposoni on DNA-fragmentti, joka voi muuttaa asemaansa bakteerigenomissa. Siksi ne ovat liikkuvia DNA-sekvenssejä. Ne siirtyvät genomin uusiin paikkoihin muuttaen bakteerigenomin sekvenssiä ja aiheuttaen merkittäviä muutoksia geneettisessä informaatiossa. Transposonit tunnetaan myös hyppygeeneinä, koska ne voivat estää geenien transkription ja järjestää bakteerin geneettisen materiaalin uudelleen. Lisäksi ne ovat vastuussa lääkeresistenssin, antibioottiresistenssigeenien liikkumisesta plasmidien ja kromosomien välillä. Komposiittitransposonit ja IS-elementit ovat kahden tyyppisiä liikkuvia geneettisiä elementtejä, joita löytyy bakteereista. Molemmat voivat siirtyä genomissa paikasta toiseen.
Mitä ovat komposiittitransposonit?
Yhdistetty transposoni on DNA-segmentti, jota reunustavat kaksi samank altaisten insertiosekvenssielementtien kopiota. Komposiittitransposonissa on keskusproteiinia koodaava alue. Geenit ovat usein antibioottiresistenttejä geenejä. Ne voivat myös sisältää katabolisia geenejä. Lisäksi komposiittitransposoni koostuu kahdesta käänteisestä toistosta. Yhdistelmätransposonin koko pituus liikkuu yhtenä kokonaisena yksikkönä.
Kuva 01: Yhdistelmätransposoni
Tn10 on yhdistelmätransposoni. Se koostuu 6,5 kb:n keskuskoodausalueesta (tetrasykliiniresistentti geeni) ja 1,4 kb:n käänteisistä insertiosekvenssielementeistä kummassakin päässä. IS-elementit tarjoavat transponoinnin. Transposaasi on entsyymi, joka katalysoi transposonin liikettä. Yhdistelmätransposoneja voidaan vahvistaa ja suunnitella alukkeita IS-elementeille.
Mitä IS Elementit ovat?
Lisäyssekvenssielementit tai IS-elementit ovat eräänlainen liikkuva geneettinen elementti. Ne ovat yksinkertainen muoto transposoneista. Niissä on vain transposaasientsyymejä koodaavia geenejä. Transposaasientsyymit katalysoivat transposonien transpositiota. Rakenteellisesti IS-elementtien koodaussekvenssiä reunustaa kaksi käänteistä toistoa. Esimerkiksi IS-elementtiä nimeltä IS911 reunustavat kaksi 36 bp:n käänteistä toistuvaa ääripäätä.
IS-elementit ovat bakteerigenomin yleisimpiä autonomisia transponoitavia elementtejä. Siksi ne ovat äärimmäisen tärkeitä prokaryoottisen genomin organisoinnissa ja evoluutiossa. Lisäksi IS-elementit esiintyvät komposiittitransposonien osana. Yleensä löydetään kaksi IS-elementtiä komposiittitransposonin koodaussekvenssin vieressä. Yksikkötransposonit eivät kuitenkaan sisällä viereisiä IS-elementtejä.
Koska IS-elementit voivat liikkua genomissa, ne voivat keskeyttää muiden geenien koodaussekvenssin ja inaktivoida geenit estämällä ilmentymisen.
Mitä yhtäläisyyksiä komposiittitransposonien ja IS-elementtien välillä on?
- Sekä komposiittitransposonit että IS-elementit pystyvät muuttamaan paikkaa bakteerigenomissa.
- Molempien transposonien koodausaluetta reunustavat yleensä käänteiset toistot.
- Yhdistelmätransposonia reunustavat kaksi erillistä IS-elementtiä.
Mitä eroa on komposiittitransposonien ja IS-elementtien välillä?
Yhdistelmätransposonit ovat liikkuvia geneettisiä elementtejä, jotka koostuvat kahdesta insertiosekvenssistä (IS), jotka usein reunustavat yhtä tai useampaa antibioottiresistenssigeeniä. Toisa alta IS-elementit ovat eräänlainen yksinkertainen transposoituva elementti, joka sisältää geenejä, jotka koodaavat transposaasientsyymiä transponoinnin katalysoimiseksi. Joten tämä on avainero komposiittitransposonien ja IS-elementtien välillä.
Alla on luettelo yhdistelmätransposonien ja IS-elementtien välisistä eroista taulukkomuodossa vierekkäin vertailua varten.
Yhteenveto – yhdistelmätransposonit vs IS-elementit
Bakteerigenomissa on geneettisiä elementtejä, jotka ovat liikkuvia. Komposiittitransposonit ja IS-elementit ovat kahden tyyppisiä liikkuvia geneettisiä elementtejä. Yhdistelmätransposonit sisältävät antibioottiresistenttejä geenejä ja vierekkäisiä IS-elementtejä. IS-elementit kantavat geneettistä koodia tuottamaan transposaasia, joka katalysoi transposonien liikettä. Näin ollen tämä on avainero komposiittitransposonien ja IS-elementtien välillä.
