Avainero – retrovirus vs bakteriofagi
Virukset ovat pieniä tarttuvia hiukkasia, jotka lisääntyvät vain elävän organismin sisällä. Ne pystyvät tarttumaan lähes kaikkiin eläviin organismeihin, mukaan lukien eläimet, kasvit ja bakteerit. Ne ovat mikroskooppisia hiukkasia, jotka koostuvat proteiinikapsideista ja DNA- tai RNA-genomista. Viruksen genomi voi olla joko DNA tai RNA, yksijuosteinen tai kaksijuosteinen, pyöreä tai lineaarinen. B altimoren luokitusjärjestelmän mukaan virukset voidaan luokitella seitsemään ryhmään genomityypin perusteella. Retrovirus ja bakteriofagi ovat kaksi tärkeää virusluokkaa.avainero retroviruksen ja bakteriofagin välillä on, että retrovirus on virusryhmä, joka sisältää positiivisen yksijuosteisen RNA-genomin ja pystyy replikoitumaan DNA:n välituotteen kautta, kun taas bakteriofagi on bakteereja infektoiva virus, joka sisältää joko DNA- tai RNA-genomin.
Mikä on retrovirus?
Retrovirus on virusryhmä, jolla on positiivinen yksijuosteinen RNA-genomi. Ne sisältävät entsyymiä, jota kutsutaan käänteiskopioijaentsyymiksi, ja niiden replikaatio tapahtuu DNA-välituotteen kautta. Välituote-DNA:n tuotanto replikaation aikana on ainutlaatuista tälle virusryhmälle.
Infektion aikana retrovirukset kiinnittyvät isäntäsoluun spesifisten glykoproteiinien kautta, jotka sijaitsevat viruspartikkelin ulkopinnalla. Ne fuusioituvat solukalvon kanssa ja menevät isäntäsoluun. Isäntäsolun sytoplasmaan tunkeutumisen jälkeen retrovirus käänteiskopioi genominsa kaksijuosteiseksi DNA:ksi käänteiskopioijaentsyymiä käyttämällä. Uusi DNA liitetään isäntäsolun genomiin integraasi-nimisen entsyymin avulla. Vaikka infektio tapahtuu, isäntäsolu ei tunnista virus-DNA:ta integraation jälkeen. Siten isäntägenomin replikaation aikana virusgenomi replikoituu ja tuottaa tarvittavia proteiineja uusien kopioiden tekemiseksi viruspartikkeleista.
Ihmisen immuunikatovirus (HIV) ja ihmisen T-soluleukemiavirus (HTLV) ovat yleisiä ihmisen retroviruksia. HIV aiheuttaa AIDSia ja HTLV leukemiaa.
Retroviruksia käytetään geeninkuljetusjärjestelmissä, koska ne pystyvät luontaisesti sijoittamaan virusgenomia isäntäorganismien sisään, ja niitä pidetään arvokkaina molekyylibiologian tutkimusvälineinä.
Kuva 01: HIV:n replikaatio
Mikä on bakteriofagi?
Bakteriofagi (faagi) on virus, joka saastuttaa tietyn bakteerin ja leviää siinä. Ne tunnetaan myös bakteerien syöjinä, koska ne toimivat bakteereja tappavina aineina. Frederick W. Twort löysi bakteriofagit vuonna 1915, ja Felix d’Herelle nimesi ne bakteriofageiksi vuonna 1917. Ne ovat maan yleisimpiä viruksia. Ne koostuvat myös genomista ja proteiinikapsidista. Bakteriofagigenomi voi olla joko DNA:ta tai RNA:ta. Mutta suurin osa bakteriofageista on kaksijuosteisia DNA-viruksia.
Bakteriofagit ovat spesifisiä yhdelle bakteerille tai tietylle bakteeriryhmälle. Ne on nimetty bakteerikannan tai niiden tartuttaman lajin mukaan. Esimerkiksi bakteriofageja, jotka infektoivat E coli -bakteeria, kutsutaan kolifageiksi. Bakteriofageissa on erilaisia muotoja. Yleisin bakteriofagien muoto on pään ja hännän muoto.
Bakteriofagien tulee infektoida isäntäsolu lisääntyäkseen. Ne kiinnittyvät tiukasti bakteerin soluseinään käyttämällä pintareseptoreitaan ja ruiskuttavat geneettistä materiaaliaan isäntäsoluun. Bakteriofagit voivat käydä läpi kahden tyyppisiä infektioita, joita kutsutaan lyyttiseksi ja lysogeeniseksi sykliksi. Se riippuu faagin tyypistä. Lyyttisessä syklissä bakteriofagit infektoivat bakteereja ja tappavat nopeasti isäntäbakteerisolun hajottamalla. Lysogeenisessä syklissä viruksen geneettinen materiaali integroituu bakteerigenomiin tai plasmideihin ja esiintyy isäntäsolussa useista tuhansiin sukupolviin tappamatta isäntäbakteeria.
Fageilla on erilaisia sovelluksia molekyylibiologiassa. Niitä käytetään antibiooteille vastustuskykyisten patogeenisten bakteerikantojen hoitoon. Niitä voidaan käyttää myös tiettyjen bakteerien tunnistamiseen sairauden diagnosoinnissa.
Kuva 02: Bakteriofagiinfektio
Mitä eroa on retroviruksen ja bakteriofagin välillä?
Retrovirus vs bakteriofagi |
|
| Retrovirus on virusryhmä, joka sisältää yksijuosteisen RNA-genomin. | Bakteriofagi on virus, joka saastuttaa ja lisääntyy bakteereissa. |
| Käänteistranskriptaasin läsnäolo | |
| Retrovirus sisältää käänteiskopioijaentsyymiä. | Bakteriofagi ei sisällä käänteiskopioijaentsyymiä. |
| Käänteisen transkription esiintyminen | |
| Käänteinen transkriptio tapahtuu viruksen replikaation aikana | Käänteistä transkriptiota ei tapahdu viruksen replikaation aikana. |
| DNA-välituotteen tuotanto | |
| Retrovirukset tuottavat genomin DNA-välikopion. | Bakteriofagi ei tuota DNA-välituotetta. |
Yhteenveto – Retrovirus vs bakteriofagi
Retrovirus ja bakteriofagi ovat kahdenlaisia viruksia. Retrovirus on ryhmä viruksia, joilla on positiivinen yksijuosteinen RNA-genomi, joka replikoituu väli-DNA:n kautta. Bakteriofagi on virus, joka hyökkää bakteerien kimppuun ja replikoituu käyttämällä bakteerien replikaatiomekanismeja. Bakteriofagit ovat biosfäärin yleisimpiä viruksia, ja niillä voi olla joko DNA- tai RNA-genomeja. Tämä on ero retroviruksen ja bakteriofagin välillä.
