Avainero – minisatelliitti vs mikrosatelliitti
Toistuva DNA on nukleotidisekvenssejä, jotka toistuvat yhä uudelleen ja uudelleen organismien genomissa. Toistuva DNA muodostaa merkittävän osan genomisesta DNA:sta, ja siellä on kolme päätyyppiä, joita kutsutaan tandemtoistoiksi, terminaaleiksi toistoiksi ja välissä oleviksi toistoiksi. Tandemtoistot ovat erittäin toistuvia sekvenssejä, jotka sijaitsevat toistensa vieressä keskeytyksettä. Selkärankaisten genomissa on kolme päätyyppiä tandemtoistoja. Ne ovat satelliitti-DNA, mikrosatelliitti-DNA ja minisatelliitti-DNA. Minisatelliitti on osa erittäin toistuvaa DNA:ta, joka koostuu sarjasta toistuvaa sekvenssiä, joka koostuu 10-100 emäsparista. Mikrosatelliitti on osa toistuvaa DNA:ta, joka koostuu lyhyistä toistuvista sekvensseistä, jotka koostuvat 1-9 emäsparista. Siksi avainero minisatelliitin ja mikrosatelliitin välillä on toistuvan sekvenssin koko tai pituus.
Mikä on minisatelliitti?
Minisatelliitti-DNA on DNA:n osa, joka käsittää sarjan lyhyttä DNA:n toistuvaa sekvenssiä, jonka pituus on 10-60 emäsparia. Minisatelliitteja kutsutaan myös muuttuvalukuisiksi tandemtoistoiksi (VNTR). Minisatelliitit sekoitetaan usein mikrosatelliitteihin. Tiedemiehet erottavat kuitenkin minisatelliitit ja mikrosatelliitit nyt toistuvan sekvenssin koon perusteella.
Minisatelliitteja voidaan nähdä yli 1000 paikassa ihmisen genomissa. Näissä lyhyissä sarjoissa on runsaasti G:tä ja C:tä. Toistojen määrä tietyssä minisatelliitissa vaihtelee suuresti yksilöiden välillä.
A. R. Wyman ja R. White tunnistivat ensimmäisen ihmisen minisatelliitin vuonna 1980. Myöhemmin Alec Jeffreys havaitsi minisatelliittien kopiomäärän äärimmäisen polymorfismin organismien keskuudessa. Nämä löydöt tekivät minisatelliiteista ihanteellisia merkkejä DNA-sormenjälkien ottamiseen, kytkentäanalyysiin ja väestötutkimuksiin. Minisatelliitit myötävaikuttavat myös geenien ilmentymisen, transkription, vaihtoehtoisen silmukoinnin jne. säätelyyn.
Mikä on mikrosatelliitti?
Mikrosatelliitti on DNA:n osa, jossa on yksinkertaisia 1-10 emäsparin pituisia sekvenssitoistoja. Mikrosatelliitteja kutsutaan myös lyhytsekvenssitoistoiksi (SSR) tai yksinkertaisiksi tandemtoistoiksi (STR). On olemassa kahdenlaisia mikrosatelliitteja, joita kutsutaan yksinkertaisiksi mikrosatelliiteiksi ja yhdistelmämikrosatelliiteiksi. Yksinkertaiset mikrosatelliitit koostuvat vain yhden tyyppisistä toistosekvensseistä. Komposiittimikrosatelliitit koostuvat useammasta kuin yhden tyyppisestä toistosta. Mikrosatelliiteilla on yleisimmin poly-A/T-alueita. Mikrosatelliitit ovat kodominantteja ja niitä on runsaasti eukaryoottigenomeissa.
Minisatelliittien tapaan mikrosatelliitit osoittavat myös monimuotoisuutta yksilöiden välillä. Tietyn mikrosatelliitin toistokertojen määrä vaihtelee yksilöiden välillä. Siksi mikrosatelliitteja voidaan käyttää myös geneettisinä markkereina DNA-sormenjälkien ottamisessa. Mikrosatelliittipolymorfismi voidaan helposti tunnistaa PCR:llä ja geelielektroforeesilla. Mikrosatelliitin viereinen alue on erittäin konservoitunut sukulaislajeissa.
Mitä yhtäläisyyksiä minisatelliittien ja mikrosatelliittien välillä on?
- Minisatelliitit ja mikrosatelliitit ovat ei-koodaavia DNA-sekvenssejä.
- Molemmat ovat tandemtoistoja.
- Molemmat koostuvat erittäin toistuvista jaksoista.
- Molempia voidaan käyttää tehokkaina geneettisinä merkkiaineina DNA-sormenjälkien ottamiseen.
Mitä eroa minisatelliitilla ja mikrosatelliitilla on?
minisatelliitti vs mikrosatelliitti |
|
| Minisatelliitit ovat tandemtoistoja, joiden monomeeritoiston pituus on 10-100 emäsparia. | Mikrosatelliitit ovat lyhyitä tandemtoistoja, jotka koostuvat 1-9 emäsparin monomeerin toistuvista sekvensseistä. |
| Toistuvan sekvenssin koko | |
| Minisatelliitissa on toistuvia 10-100 emäsparin sekvenssejä. | Mikrosatelliitissa on lyhyet 1-9 emäsparin sekvenssit. |
| Yleiset perusteet | |
| Minisatelliiteissa on runsaasti G- ja C-kantoja. | Mikrosatelliiteissa on runsaasti A- ja T-emäksiä. |
| Muut nimet | |
| Minisatelliitit tunnetaan myös muuttuvan lukumäärän tandemtoistoina (VNTR). | Mikrosatelliitit tunnetaan myös lyhytsekvenssitoistoina (SSR) tai yksinkertaisina tandemtoistoina (STR). |
Yhteenveto – Minisatelliitti vs mikrosatelliitti
Minisatelliitti ja mikrosatelliitti ovat kahden tyyppisiä tandemtoistoja. Ne erotetaan toistuvan sekvenssin emästen lukumäärän tai sekvenssin koon perusteella. Minisatelliitissa on 10-100 emäsparin pituinen toistuva sekvenssi, kun taas mikrosatelliitissa on 1-9 emäsparin pituinen toistuva sekvenssi. Tämä on tärkein ero minisatelliitin ja mikrosatelliitin välillä. Minisatelliittien ja mikrosatelliittien toistuvien sekvenssien kopiomäärä vaihtelee suuresti yksilöiden välillä. Sekä minisatelliitit että mikrosatelliitit ovat tehokkaita DNA-markkereita, jotka analysoivat geneettistä vaihtelua lajipopulaatioiden sisällä ja välillä.
Lataa PDF-versio Minisatellite vs Microsatellite
Voit ladata tämän artikkelin PDF-version ja käyttää sitä offline-tarkoituksiin lainaushuomautuksen mukaisesti. Lataa PDF-versio tästä Minisatelliitin ja mikrosatelliitin ero.
