Avainero – eukaryootti vs prokaryoottipromoottorit
Transkriptio on prosessi, jossa koodaavaan DNA-sekvenssiin tallennettu geneettinen tieto muunnetaan mRNA-sekvenssiksi. Spesifinen DNA-alue, joka sijaitsee transkriptioyksikön 5'-päässä, käynnistää tämän prosessin. Tämä alue tunnetaan promoottorialueena. Nämä promoottorit löytyvät tyypillisesti transkription aloituskohdan vieressä. Promoottorin pituus vaihtelee 100 bp:stä 1000 bp:iin. Promoottorit ovat erilaisia organismityypin mukaan. Eukaryootti- ja prokaryoottipromoottorit eroavat toisistaan. Prokaryooteissa löytyy vain kolmen tyyppisiä promoottorisekvenssejä, nimittäin -10 promoottoria, -35 promoottoria ja ylävirran elementtejä. Eukaryooteissa on monia erilaisia promoottorielementtejä, kuten TATA-laatikko, initiaattorielementit, GC-laatikko, CAAT-laatikko jne. Tämä on avainero eukaryoottisten ja prokaryoottisten promoottorien välillä.
Mitä ovat eukaryoottipromoottorit?
Kolme pääannosta; ydinpromoottori, proksimaalinen promoottori ja distaalinen promoottori muodostavat yhdessä promoottorin. Eukaryoottien yhteydessä on löydetty monia promoottorielementtejä, jotka ovat erittäin kehittyneitä ja monimuotoisempia kuin promoottorit. On havaittu, että tämän eukaryoottisten promoottorien monimutkaisuuden vuoksi DNA:lla on kyky laskostua takaisin itsensä päälle. Tämä selittää myös sen tosiasian, että monien säätelysekvenssien vaikutus tapahtuu, vaikka ne sijaitsevat monen kiloemäksen päässä transkriptiopaikasta. Näillä eukaryoottisilla promoottoreilla on kyky kattaa laajan valikoiman DNA-sekvenssejä.
Kuva 01: Eukaryotic Promoter
Esimerkkejä joistakin eukaryoottipromoottoreista ovat Pribnow-laatikko (TATA-laatikko), GC-laatikko, CAAT-laatikko jne. TATA-laatikon yhteydessä se on 5' - TATAA -3' -sekvenssi, joka on läsnä ytimessä promoottorialue. TATA-laatikkoon sitoutuvat transkriptiotekijäproteiinit ja histoniproteiinit. Transkriptiotekijäproteiinien sitoutuminen TATA-laatikkoon auttaa RNA-polymeraasin sitoutumisessa, mikä sitten johtaa transkriptiokompleksin muodostumiseen. Yksinkertaisesti sanottuna näiden proteiinien sitoutuminen ohjaa transkriptioprosessia. Tämä prosessi estyy, kun histoniproteiinit sitoutuvat TATA-laatikkoon. Siksi TATA-laatikko on tärkeä promoottorielementti, joka liittyy eukaryoottisen transkription nopeuden säätelyyn.
Mitä ovat prokaryoottipromoottorit?
Prokaryoottisissa organismeissa transkriptioon osallistuva promoottori tunnistetaan siihen liittyvällä tekijällä, jota kutsutaan sigmatekijäksi. Sigmatekijät ovat ainutlaatuisia eri promoottorisekvensseille. Siksi sanotaan, että jokainen yksittäinen sigmatekijä tunnistaisi yhden ydinpromoottorisekvenssin. Tämä on ainutlaatuinen ominaisuus, joka on läsnä prokaryoottisessa transkriptioprosessissa. Sekä RNA-polymeraasi että sigmatekijä tunnistavat yhdessä oikean promoottorialueen ja muodostavat transkriptiokompleksin.
Prokaryoottinen promoottori sisältää vain kolmen tyyppisiä promoottorielementtejä. Promoottorielementtien vähäisempi osallistuminen prokaryooteissa on tärkein syy siihen, miksi niiden transkriptioprosessi on vähemmän kehittynyt verrattuna eukaryoottiseen transkriptioon, johon liittyy suurempi määrä promoottorisekvenssejä. Prokaryoottien kolmesta promoottorielementistä on kaksi tärkeintä tärkeää kaksi lyhyttä DNA-sekvenssiä. Nämä sekvenssit luokitellaan niiden sijainnin mukaan. Ne ovat -10 promoottoria tai elementtiä (joka on läsnä 10 bp ylävirtaan transkription aloituskohdasta), -35 promoottoria tai elementtiä (joka on läsnä 35 bp ylävirtaan transkription aloituskohdasta).
Kuva 02: Prokaryoottinen promoottori
-10-promoottori vastaa eukaryoottista TATA-laatikkoa tai Pribnow-laatikkoa ja on olennainen komponentti transkription aloittamisessa prokaryooteissa. -35-promoottori koostuu sekvenssistä, joka on TTGACA, joka osallistuu aktiivisesti prokaryoottisen transkription nopeuden säätelyyn.
Mitä yhtäläisyyksiä eukaryoottisten ja prokaryoottisten promoottorien välillä on?
- Molemmissa tyypeissä promoottoreita säätelevät erilaiset DNA:n säätelysekvenssit, jotka sisältävät tehostajia, äänenvaimentimia, eristeitä ja rajaelementtejä.
- Promoottorit ovat sekvenssejä, jotka käynnistävät transkription prokaryooteissa ja eukaryooteissa.
- Promoottorit ovat DNA-sekvenssejä.
Mitä eroa eukaryoottisilla ja prokaryoottisilla promoottoreilla on?
Eukaryotic vs Prokaryotic Promoters |
|
| Eukaryoottipromoottorit ovat säätelysekvenssejä, jotka käynnistävät eukaryoottisten organismien transkription. | Prokaryoottipromoottorit ovat säätelysekvenssejä, jotka käynnistävät prokaryoottisten geenien transkription. |
| Elementit | |
| Prokaryoottinen promoottori koostuu ylävirran elementeistä, -10 elementistä ja -35 elementistä. | Eukaryoottinen promoottori koostuu Pribnow-laatikosta (TATA-laatikko), CAAT-laatikosta, GC-laatikosta ja aloituselementeistä. |
Yhteenveto – Eukaryotic vs Prokaryotic Promoottorit
Promoottori on DNA:n alue, johon liittyy transkriptio-nimisen prosessin käynnistäminen. Nämä promoottorit löytyvät tyypillisesti ylävirtaan transkription aloituskohdasta. Kolme pääosaa, jotka muodostavat promoottorin, ovat ydinpromoottori, proksimaalinen promoottori ja distaalinen promoottori. Eukaryoottien kontekstissa promoottorialueella on monia promootioelementtejä, jotka ovat erittäin kehittyneitä ja monimuotoisempia kuin prokaryootit. Esimerkkejä joistakin eukaryoottisista promoottorielementeistä ovat Pribnow-laatikko (TATA-laatikko), GC-laatikko, CAAT-laatikko jne. Prokaryooteissa on kaksi tärkeintä promoottorielementtiä, nimittäin -10 elementtiä (eli 10 bp ylävirtaan transkription aloituskohdasta), -35 elementtiä. (joka on läsnä 35 bp ylävirtaan transkription aloituskohdasta). -10-promoottori aloittaa transkription ja -35-promoottori säätelee transkriptiota. Molempia promoottorityyppejä ohjaavat erilaiset DNA:n säätelysekvenssit, jotka sisältävät tehostajia, äänenvaimentimia, eristeitä ja rajaelementtejä. Tämä on ero eukaryoottisten ja prokaryoottisten promoottorien välillä.
Lataa PDF Eukaryotic vs Prokaryotic Promoters
Voit ladata tämän artikkelin PDF-version ja käyttää sitä offline-tarkoituksiin lainaushuomautuksen mukaisesti. Lataa PDF-versio tästä: Ero eukaryoottisen ja prokaryoottisen promoottorin välillä
