Avainero Cosmidin ja Phagemidin välillä on niiden sisältämien sekvenssien tyypissä. Kosmidi sisältää cos-kohdan ja plasmidin. Siksi se on hybridivektori, kun taas Phagemid on plasmidi, joka sisältää F1-faagin replikaation F1 aloituskohdan.
Kosmideja ja fagemidejä käytetään kloonaustarkoituksiin, erityisesti suurempien DNA-fragmenttien kloonaamiseen. Näitä käytetään laajasti erityisesti erilaisten proteiinien tuotannosta vastaavien geenien kloonauksessa. Kosmidit ja fagemidit joko replikoidaan yksinään plasmideina tai pakataan viruspartikkeleihin ja sitten replikoidaan.
Mikä on kosmidi?
A Kosmidi, jota kutsutaan hybridiplasmidiksi, käsittää cos-kohdat, jotka on uutettu lambda-faagipartikkeleista ja plasmidista. Nämä cos-kohdat ovat pitkiä DNA-fragmentteja, joissa on 200 emäsparia. Näin ollen niillä on kohesiiviset tai tahmeat päät, jotka sallivat plasmidin sovittua viruksen DNA:han. Siksi cos-paikat ovat elintärkeitä DNA:n pakkaamiselle.
On olemassa kolme cos-sivustoa;
- cosN-kohta – osallistuu DNA-juosteen niveltymiseen terminaasiaktiivisuuden kautta
- cosB-sivusto – osallistuu päätteen pitämiseen.
- cosQ-paikka – osallistuu DNA:n hajoamisen estämiseen DNaasien toimesta.
Kuva 01: Kosmidi
Lisäksi kosmidit voivat joko replikoida yksijuosteista DNA:ta tai kaksijuosteista DNA:ta käyttämällä sopivaa replikaation aloituskohtaa. Kosmidit sisältävät yleensä antibioottiresistenssigeenejä markkereina transformanttien valinnassa. Siten kosmidin käyttö vektorina voi helpottaa kloonausta, ja vektorin restriktioentsyymidigestio voi sitten erottaa nämä fragmentit.
Mikä on fagemidi (phasmid)?
Phagemid, jota kutsutaan myös Phasmidiksi, on myös eräänlainen hybridivektori. Phagemid sisältää erityisen replikaation aloituskohdan, jota kutsutaan replikaation f1-alkukohdaksi. Replikaation f1-alkukohta poimii f1-faagista.
Phagemid voi replikoida sekä yksijuosteista että kaksijuosteista DNA:ta. Replikaatio voi joko tapahtua plasmidina sen ollessa riippumaton replikaatio, tai se voi pakata faagipartikkeleihin ja lopulta infektoida bakteeri-isäntä-E coli -bakteerin. Infektoitaessa E coli -soluja f1-faagi vaatii piluksen läsnäolon. Tästä syystä sukupuolipilukset ovat tärkeitä fagemidien in vitro -pakkauksessa.
Mitä yhtäläisyyksiä Cosmidin ja Phagemidin välillä on?
- Sekä Cosmid että Phagemid ovat kloonausvektoreita, joita käytetään yhdistelmä-DNA-tekniikassa.
- Cosmid ja Phagemid voivat replikoida yksijuosteista ja kaksijuosteista DNA:ta.
- Molemmat voivat läpikäydä itsenäisen replikaation, joka on samanlainen kuin plasmidit.
- Cosmid ja Phagemid voivat pakata in vitro ja infektoida bakteerisoluja.
- Sekä Cosmid että Phagemid vaativat sopivan replikaation aloituskohdan kloonausta varten.
Mitä eroa on Cosmidilla ja Phagemidilla?
Cosmid vs Phagemid |
|
| Cosmid on hybridivektori, joka sisältää cos-kohdan ja plasmidin. | Phagemid on plasmidi, joka sisältää F1-faagin replikaation F1-alkukohdan. |
| Cos-sivustojen läsnäolo | |
| Cos-kohdat ovat kosmidissa ja ovat välttämättömiä in vitro -pakkauksessa. | Cos-sivustot puuttuvat phagemidistä. |
| F1-kopion alkuperän läsnäolo | |
| Kosmidissa fi replikaation aloituskohta voi esiintyä tai ei. | F1 replikaation aloituskohta on läsnä fagemidissa. |
| Antibioottiresistenttien geenien läsnäolo | |
| Kosmideissa on antibioottiresistenttejä geenejä, jotka tunnistavat transformantit ei-transformanteista. | Antibioottiresistentit geenit puuttuvat fagemideistä. |
| In vitro -pakkauksen vaatimus | |
| Edellyttää cos-sivustoa. | Vaatii seksipiluksen. |
Yhteenveto – Cosmid vs Phagemid
Cosmid ja Phagemid ovat kloonausvektoreita, joita käytetään yhdistelmä-DNA-tekniikassa. Kosmidit ovat hybridivektoreita, jotka sisältävät erityisiä tahmeita päitä, jotka tunnetaan cos-sivustoina. in vitro -pakkaukset vaativat nämä cos-sivustot. Vaikka fagemidit ovat plasmideja, jotka sisältävät f1-faagista uutetun replikaation aloituskohdan. Sekä kosmidi että fagemidi voivat läpikäydä itsenäisen replikaation tai in vitro -pakkauksen bakteerisoluihin. Nämä ovat tärkeitä eroja kosmidin ja fagemidin välillä.
