Avainero plasmidin ja kosmidin välillä on, että plasmidi on kaksijuosteinen, pyöreä ja suljettu ekstrakromosomaalinen DNA, jota esiintyy bakteereissa ja arkeissa, kun taas kosmidi on hybridivektorijärjestelmä, joka muodostuu cos-sekvenssin yhdistämisen seurauksena lambda-faagi ja bakteerien plasmidi-DNA.
Geenitekniikka on pitkälle kehitetty bioteknologian tutkimus. Geenitekniikka voi muuttaa tai muuttaa elävien organismien genomia. Lisäksi geenitekniikasta on apua geeniterapiassa ja geneettisten häiriöiden hoidossa. Ennen geenien lisäämistä toisen organismin genomiin on tarpeen tehdä yhdistelmä-DNA-molekyyli, joka voi kuljettaa halutun DNA-fragmentin ja kuljettaa sen isäntäorganismiin. Siksi yhdistelmä-DNA-tekniikan aikana se tehdään vektorijärjestelmällä. Siten vektori toimii välittäjänä tai välittäjänä luovuttajan ja isäntäorganismin välillä. Plasmidi ja kosmidi ovat kahden tyyppisiä vektoreita, joita käytetään yleisesti yhdistelmä-DNA-tekniikassa ja geenitekniikassa. Jotkut ovat luonnollisia vektoreita, kun taas jotkut ovat keinotekoisia vektoreita. Plasmidi on luonnollinen vektori, kun taas kosmidi on keinotekoisesti rakennettu vektori. Molemmilla tyypeillä on hyvät ja huonot puolensa.
Mikä on plasmidi?
Plasmidi on pieni, pyöreä, kaksijuosteinen DNA, jota esiintyy prokaryoottisissa organismeissa pääasiassa bakteereissa ja arkeissa. Ne esiintyvät suljettuina ympyröinä bakteerien sisällä. Plasmidit eivät myöskään ole genomista DNA:ta. Siten plasmidien läsnäolo tai puuttuminen prokaryoottisoluissa ei vaikuta näiden solujen eloonjäämiseen. Plasmidit ovat ekstrakromosomaalista DNA:ta. Plasmidit tarjoavat kuitenkin lisäetuja bakteereille ja arkeille. Ne sisältävät erityisiä geenejä, kuten antibioottiresistenssi, vastustuskyky erilaisille raskasmetalleille, makromolekyylien hajoaminen jne.
Lisäksi plasmidit pystyvät replikoitumaan itsestään ilman, että ne kytkeytyvät kromosomeihin. Se kantaa geenejä tai tietoa, joka on tarpeen sen omalle replikaatiolle ja ylläpitämiselle. Lisäksi ne ovat itsenäisiä DNA: ta. Näiden erityispiirteiden vuoksi plasmideilla on v altava käyttö molekyylibiologiassa vektoreina.
Kuva 01: Plasmidit
DNA:n kaksijuosteisuus, antibioottiresistenssigeenit, itsestään replikoitumiskyky ja erityiset restriktiokohdat ovat tärkeitä ominaisuuksia, jotka tekevät plasmideista sopivampia vektorimolekyyleiksi yhdistelmä-DNA-tekniikassa. Ja myös plasmidit on helppo eristää ja muuttaa isäntäbakteereiksi.
Mikä Cosmid on?
Cosmid on hybridivektorijärjestelmä. Se on keinotekoinen vektori, joka on rakennettu yhdistämällä lambda-faagipartikkelien cos-sekvenssit ja plasmidi. Nämä cos-kohdat tai -sekvenssit ovat pitkiä DNA-fragmentteja, jotka koostuvat 200 emäsparista. Niissä on kohesiiviset tai tahmeat päät, jotka sallivat plasmidin sovittua viruksen DNA:han. Siksi cos-kohdat ovat elintärkeitä DNA:n pakkaamiselle. Cos-sivustoja on kolme, nimittäin cosN-sivusto, cosB-sivusto ja cosQ-sivusto. Näihin kohtiin kuuluu DNA-juosteen niveltäminen terminaasiaktiivisuuden avulla, terminaasin pidättäminen ja DNA:n hajoamisen estäminen DNaasien vaikutuksesta.
Kuva 02: Kosmidi
Kosmidit voivat replikoida joko yksijuosteista DNA:ta tai kaksijuosteista DNA:ta käyttämällä sopivaa replikaation aloituskohtaa. Ne sisältävät myös antibioottiresistenssigeenejä, jotka voivat olla hyödyllisiä markkereina transformoituneiden solujen valinnassa. Siten kosmidit ovat samoin kuin plasmidit myös hyviä vektoreita yhdistelmä-DNA-tekniikassa.
Mitä yhtäläisyyksiä plasmidin ja kosmidin välillä on?
- Plasmidi ja kosmidi ovat vektoreita, joita käytetään yleisesti yhdistelmä-DNA-tekniikassa.
- Molemmat pystyvät toistamaan itsensä.
- Niillä on replikaation alkuperä.
- Lisäksi heillä on useita kloonauspaikkoja.
- Ne sisältävät myös antibiooteille vastustuskykyisiä geenejä, jotka ovat hyödyllisiä markkereina.
- Vieras DNA voidaan liittää molempiin tyyppeihin ja tehdä yhdistelmämolekyylejä.
- Helppoja seulontamenetelmiä on saatavilla molemmille vektoreille.
- Molemmat ovat hyödyllisiä genomikirjastojen rakentamisessa.
Mitä eroa on plasmidilla ja kosmidilla?
Plasmidi ja kosmidi ovat kahdenlaisia kloonausvektoreita, joita käytetään geenitekniikassa. Plasmidit ovat pieniä, pyöreitä kaksijuosteisia ekstrakromosomaalisia DNA-molekyylejä, joita esiintyy bakteereissa ja arkeissa. Toisa alta kosmidi on hybridivektori, joka on rakennettu lambda-faagi-DNA:n ja plasmidi-DNA:n cos-sekvensseistä. Tämä on avainero plasmidin ja kosmidin välillä. Lisäksi plasmidit voivat sisältää jopa 25 kb:n DNA-fragmentteja, kun taas komsidit voivat sisältää jopa 45 kb:n fragmentteja. Siten tämä on toinen ero plasmidin ja kosmidin välillä.
Lisätietoja on infografiassa plasmidin ja kosmidin erosta.
Yhteenveto – Plasmid vs Cosmid
Plasmidi on luonnossa esiintyvä ekstrakromosomaalinen DNA, kun taas kosmidi on faagi-DNA:n ja plasmidi-DNA:n hybridivektori. Molemmat ovat kloonausvektoreita, joita käytetään yhdistelmä-DNA-tekniikassa. Kosmidit sisältävät erityisiä tahmeita päitä, jotka tunnetaan cos-paikoina, joita tarvitaan in vitro -pakkaukseen. Toisa alta plasmidit sisältävät useita ominaisuuksia, jotka tekevät niistä ihanteellisia vektoreita geenitekniikassa. Molemmat voivat käydä läpi itsenäisen replikaation tai in vitro -pakkauksen bakteerisoluihin. Plasmidit pystyvät sisältämään vieraan DNA-fragmentin, jonka pituus on 25 kb, kun taas kosmidit kykenevät sisältämään vieraan DNA-fragmentin, jonka pituus on 45 kb. Näin ollen kosmidit ovat käyttökelpoisia kloonaustarkoituksiin suurempien DNA-fragmenttien kloonaamiseen, koska plasmidivektorit eivät voi kloonata suurempia fragmentteja. Siten tämä tiivistää eron plasmidin ja kosmidin välillä.
