Avainero snRNA:n ja snoRNA:n välillä on se, että snRNA sisältää pre-mRNA:n vaihtoehtoisen silmukoinnin, kun taas snoRNA:ssa rRNA:n ja tRNA:n modifiointia, mRNA-muokkausta ja genomin painamista.
Pienet RNA:t ovat polymeerisiä RNA-molekyylejä, jotka koostuvat alle 200 nukleotidista. Ne ovat yleensä koodaamattomia. Ne ovat olemassa lähetti-RNA:iden joukossa kuljettamaan signaaleja. Pienet RNA:t ovat peräisin täydellisestä kaksijuosteisesta RNA:sta, jota tuotetaan RNA-riippuvaisen RNA-polymeraasin vaikutuksesta. Pienillä RNA:illa on tärkeä rooli solujen erilaistumisessa, kasvussa ja proliferaatiossa, apoptoosissa, aineenvaihdunnassa, migraatiossa ja puolustuksessa. Siksi pienet RNA:t ovat tärkeitä ja kriittisiä kehityksen ja fysiologian säätelijöitä. Pieni tuma-RNA ja pieni nukleolaarinen RNA ovat kaksi pienten RNA-molekyylien luokkaa.
Mikä on snRNA?
Pieni tuma-RNA tai snRNA on luokka pieniä RNA-molekyylejä, joita löytyy eukaryoottisolujen ytimestä. SnRNA:n keskimääräinen pituus on noin 150 nukleotidia. RNA-polymeraasi II tai RNA-polymeraasi III transkriptoivat snRNA:ta. SnRNA:n päätehtävä on esilähetti-RNA:n prosessointi ytimessä. Ne auttavat myös säätelemään transkriptiotekijöitä tai RNA-polymeraasi II:ta ja ylläpitämään telomeerejä.
Kuva 01: Pienen RNA:n toimintamekanismi
SnRNA:ta on kaksi luokkaa, jotka perustuvat yhteisiin sekvenssiominaisuuksiin ja niihin liittyviin proteiinitekijöihin, kuten RNA:ta sitovaan LSm-proteiiniin. Nämä kaksi luokkaa ovat Sm-luokan snRNA ja Lsm-luokan snRNA. Sm-luokan snRNA koostuu korkeista uridiinipitoisuuksista U1, U2, U4, U4atac, U5, U7, U11 ja U12. RNA-polymeraasi II transkriptoi SM-luokan snRNA:ta. Pre-snRNA:n transkription jälkeen he saavat yleensä 7-metyyliguanosiinin 5'-korkin tumaan. Sitten ne viedään sytoplasmaan ydinhuokosten kautta jatkokäsittelyä varten. Lsm-luokan snRNA:lla on korkea U6- ja U6atac-uridiinipitoisuus. RNA-polymeraasi III transkriptoi Lsm-luokan snRNA:ta, eikä se poistu ytimestä. Yleisimmät ihmisen snRNA-komponentit ovat U1-spliceosomaalinen RNA, U2-spliceosomaalinen RNA, U4-silmukointi-RNA, U5-silmukointi-RNA ja U6-silmukointi-RNA.
Mikä on snoRNA?
Pieni nukleolaarinen RNA tai snoRNA on pienten RNA-molekyylien luokka, joka ohjaa kemiallisia modifikaatioita toisessa RNA:ssa, kuten ribosomaalisessa RNA:ssa, siirto-RNA:ssa ja pienessä tuma-RNA:ssa. Jokainen snoRNA-molekyyli liittyy noin neljään ydinproteiiniin RNA/proteiinikompleksissa modifiointiprosessin aikana. SnoRNA sisältää antisense-elementin, joka on noin 10-20 nukleotidia. Nämä emäkset ovat täydentäviä sekvenssille, joka ympäröi pre-RNA-molekyylin modifikaatioon kohdistuvia nukleotideja.
Kuva 02: Pieni nukleaarinen RNA
SnoRNA:ita on kaksi luokkaa. Ne ovat C/D box snoRNA ja H/ACA box snoRNA. C/D box snoRNA liittyy metylaatioon ja H/ACA box snoRNA pseudouridylaatioon. Jokainen snoRNA-molekyyli toimii oppaana yhdelle tai kahdelle kohde-RNA:n modifikaatiolle. C/D box snoRNA sisältää kaksi lyhyttä konservoitunutta sekvenssimotiivia C ja D lähellä snoRNA:n 5' ja 3' päitä, vastaavasti. Lyhyet alueet, jotka koostuvat 5 nukleotidista, asettuvat ylävirtaan C-laatikosta ja alavirtaan D-laatikosta ja muodostavat kantalaatikkorakenteen. Tämä tuo C- ja D-laatikon aiheet lähelle. Varsilaatikkorakenne on tärkeä oikean snoRNA-synteesin ja nukleolaarisen lokalisoinnin kann alta. H/ACA box snoRNA:lla on toissijainen rakenne, joka koostuu kahdesta hiusneulasta ja kahdesta yksijuosteisesta alueesta. Tämä tunnetaan yleisesti hiusneula-sarana-hiusneula-häntä -rakenteella. H/ACA box snoRNA koostuu myös kahdesta konservoituneesta motiivista H ja ACA. Molemmat sijaitsevat yksijuosteisilla alueilla. H-laatikko on saranassa ja ACA on hännän alueella. Kolme nukleotidiä muodostaa sekvenssin 3'-pään.
Mitä yhtäläisyyksiä snRNA:n ja snoRNA:n välillä on?
- snRNA ja snoRNA ovat pieniä RNA:ita.
- Molempia esiintyy eukaryoottisoluissa.
- Molemmat ovat ei-koodaavia RNA-molekyylejä.
- Lisäksi ne osallistuvat RNA:n muuntamiseen transkriptioprosessin aikana.
Mitä eroa snRNA:lla ja snoRNA:lla on?
snRNA osallistuu vaihtoehtoiseen pre-mRNA:n silmukointiin, kun taas snoRNA modifioi pääasiassa RNA-molekyylejä. Siten tämä on avainero snRNA:n ja snoRNA:n välillä. Lisäksi snRNA:t ovat noin 150 nukleotidin pituisia, ja niiden havaitaan usein liittyneenä proteiinien ja kompleksien ryhmään, joita kutsutaan pieniksi tuman ribonukleoproteiineiksi. snoRNA:t ovat noin 60-170 nukleotidin pituisia ja niitä löytyy pääasiassa tumasta.
Lisäksi snRNA:t transkriptoi joko RNA-polymeraasi II tai RNA-polymeraasi III, kun taas snoRNA:n transkriptoi vain RNA-polymeraasi II.
Alla oleva infografiikka esittelee snRNA:n ja snoRNA:n väliset erot taulukkomuodossa vierekkäin vertailua varten.
Yhteenveto – snRNA vs snoRNA
snRNA ja snoRNA ovat pienten RNA-molekyylien luokkia. snRNA osallistuu vaihtoehtoiseen pre-mRNA:n silmukointiin, kun taas snoRNA modifioi pääasiassa RNA-molekyylejä. Siten tämä on avainero snRNA:n ja snoRNA:n välillä. Pienet RNA:t ovat polymeerisiä RNA-molekyylejä, jotka koostuvat alle 200 nukleotidin pituudesta ja jotka eivät yleensä koodaa. snRNA:ita löytyy eukaryoottien ytimestä. snoRNA:ita löytyy arkeista ja eukaryooteista. SnRNA:n transkriptio tapahtuu RNA-polymeraasi II:n ja II:n kautta, kun taas vain RNA-polymeraasi II osallistuu snoRNA:n transkriptioon. Joten tämä tiivistää eron snRNA:n ja snoRNA:n välillä.
