Avainero – toistuva DNA vs. satelliitti-DNA
Genominen DNA koostuu pääasiassa koodaavasta DNA:sta ja ei-koodaavasta DNA:sta. Koodaavat sekvenssit tunnetaan geeneinä. Tuhansia geenejä sijaitsee kromosomeissa. Toistuvaa DNA:ta, introneita ja säätelysekvenssejä pidetään genomin ei-koodaavana DNA:na. Toistuva DNA on nukleotidisekvenssejä, jotka toistuvat yhä uudelleen ja uudelleen organismien genomissa. Toistuva DNA muodostaa merkittävän osan genomisesta DNA:sta, ja se luokitellaan kolmeen päätyyppiin, joita kutsutaan tandemtoistoiksi, terminaaleiksi toistoiksi ja välissä oleviksi toistoiksi. Tandem-toistot ovat erittäin toistuvia genomissa. Yksi tandemtoistojen tyyppi on satelliitti-DNA. avainero toistuvan DNA:n ja satelliitti-DNA:n välillä on se, että toistuva DNA on toistuvia DNA-sekvenssejä genomissa, kun taas satelliitti-DNA on toistuvan DNA:n tyyppi, joka toistuu voimakkaasti ja sijaitsee enimmäkseen sentromeerin ympärillä olevalla heterokromaattisella alueella.
Mikä on toistuva DNA?
Toistuvalla DNA:lla on toistuvia nukleotidisekvenssejä yhä uudelleen ja uudelleen. Toistuva DNA tunnetaan myös toistuvina elementteinä tai toistoina. Toistuva DNA vie merkittävän osan monien organismien kokonaisgenomista. Ihmisen genomi sisältää yli kaksi kolmasosaa toistuvan DNA:n sekvenssistä. Nämä eivät koodaa proteiineja ja kuuluvat genomin ei-koodaavan DNA:n luokkaan.
Toistuvaa DNA:ta on kolmea päätyyppiä nimeltä terminaalitoistot, tandemtoistot ja välissä olevat toistot. Tandem-toistot ovat erittäin toistuvia sekvenssejä, jotka sijaitsevat vierekkäin. Tandem-toistoja on kolmea tyyppiä, joita kutsutaan satelliitti-DNA:ksi, minisatelliitti-DNA:ksi ja mikrosatelliitti-DNA:ksi. Välissä oleva toistuva DNA on toistuva sekvenssi, joka on dispergoitunut koko genomiin yksittäisinä yksikköinä ainutlaatuisilla vierekkäisillä sekvensseillä. On olemassa kahden tyyppistä välissä olevaa DNA:ta, nimeltään transposonit ja retrotransposonit. Ne ovat peräisin genomin sisällä tapahtuvasta transpositiosta. Retrotransposonit kuuluvat luokan 1 transposoituviin elementteihin ja seuraavat kopioi ja liitä -mekanismia integroituakseen genomiin. Transposonit kuuluvat luokan 2 transposoituviin elementteihin, koska ne seuraavat leikkaa ja liitä -mekanismia liikkuakseen genomissa.
Vaikka toistuvaa DNA:ta ei koodata proteiineille, ne ovat tärkeitä genomin eri toiminnoille. Toistuva DNA on välttämätöntä ainutlaatuisten koodaavien sekvenssien ilmentymisen muotoilemiseksi ja lisätoimintojen tarjoamiseksi, joita tarvitaan genomin replikaatioon ja tarkkaan siirtymiseen tytärsoluihin jne. Toistuva DNA tarjoaa myös merkittävän osan rakennusteline- tai matriisikiinnitysalueista, mikä osoittaa sen tarpeellisuuden genomin järjestämisessä organismeista.
Mikä on satelliitti-DNA?
Satelliitti-DNA on eräänlainen toistuva DNA, joka toistuu voimakkaasti. Ne kuuluvat toistuvan DNA:n luokkaan, jota kutsutaan tandemtoistoiksi. Satelliitti-DNA toistuu peräkkäin ja sijaitsee kromosomien sentromeeri- ja telomeerialueilla. Yksi lyhyt toistuva satelliitti-DNA-yksikkö vaihtelee lajista riippuen 5-300 emäsparin välillä. Ne toistuvat normaalisti 105 - 106 kertaa genomissa. Nisäkkäiden genomissa satelliitti-DNA:n osuus on 10–20 %.
Satelliitti-DNA ei koodaa proteiineja eikä välitä toiminnallista geneettistä tietoa. Ne edistävät kromosomaalista organisaatiota, koska ne ovat toiminnallisten sentromeerien pääkomponentti ja heterokromatiinin päärakenneosa.
Satelliitti-DNA eroaa tiheydeltä suurimman osan DNA:sta. Siksi se antaa erillisen nauhan ultrasentrifugoinnin aikana. On olemassa erilaisia satelliitti-DNA:ta, joka tunnetaan nimellä alfoidi-DNA, beeta, satelliitti 1, satelliitti 2, satelliitti 3 jne.
Kuva 01: Toistuva DNA ja satelliitti-DNA
Mitä eroa on toistuvalla DNA:lla ja satelliitti-DNA:lla?
Toistuva DNA vs. satelliitti-DNA |
|
| Toistuva DNA on nukleotidisekvenssejä, jotka toistuvat monta kertaa organismien genomissa. | Satelliitti-DNA on yksi tyyppinen toistuva DNA, joka toistuu miljoonia kertoja genomissa. |
| Tyypit | |
| On olemassa kolme päätyyppiä, kuten päätetoistot, tandemtoistot ja välissä olevat toistot. | Satelliitti-DNA luokitellaan eri tyyppeihin, kuten alfoidi, beeta, saterlliitti1, 2 ja 3 jne. |
| Sijainti | |
| Toistuva DNA sijaitsee koko genomissa. | Satelliitti-DNA sijaitsee kromosomin sentromeeri- ja telomeerialueilla. |
Yhteenveto – Toistuva DNA vs. satelliitti-DNA
Genomit on järjestetty erityyppisiksi DNA:iksi. Niiden joukossa olevat koodaavat sekvenssit on tallennettu geneettisen tiedon kanssa proteiinien syntetisoimiseksi. Muut ei-koodaavat sekvenssit tarjoavat rakenteellisia ja lisätoimintoja DNA:n replikaatioon, kromosomirakenteen ylläpitoon jne. Toistuva DNA on eräänlainen ei-koodaava DNA, joka toistuu yhä uudelleen genomissa. Toistuvalla DNA:lla on eri tyyppejä, ja satelliitti-DNA, joka sijaitsee kromosomien sentromeeri- ja telomeerialueilla, on yksi niistä. Tämä on ero toistuvan DNA:n ja satelliitti-DNA:n välillä.
Lataa PDF-versio toistuvasta DNA:sta vs. satelliitti-DNA
Voit ladata tämän artikkelin PDF-version ja käyttää sitä offline-tarkoituksiin lainaushuomautuksen mukaisesti. Lataa PDF-versio tästä Toistuvan DNA:n ja satelliitti-DNA:n ero – PDF.
