Avainero geneettisen kartan ja fyysisen kartan välillä on genomikartoituksessa käytetyissä tekniikoissa. Geneettistä karttaa luotaessa geneettisiä markkereita ja geneettisiä lokuksia käytetään geenisidosmallien tutkimiseen, kun taas fyysisessä kartoituksessa käytetään molekyylibiologian tekniikoita, kuten RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism) ja hybridisaatiotekniikoita.
Geneettiset kartat ja fyysiset kartat kartoittavat kahden tyyppisiä karttoja, jotka muodostavat näyttämään kromosomeissa sijaitsevat geenit. Ne liittyvät geneettiseen diagnostiikkaan ja genomianalyysin kehityksen ennustamiseen. Lisäksi he käyttävät analysoimaan geenilokusten välisiä etäisyyksiä ja analysoimaan geenipolymorfismia.
Mikä on geneettinen kartta?
Geenikartta perustuu linkitysanalyysillä ja geeniassosiaatiotutkimuksilla tunnistettuihin geenilokusten sijaintiin ja geneettisiin markkereihin. Mendelin genetiikka selittää geneettiset kartat ja Gregor Mendel on henkilö, joka esitteli tämän käsitteen. Geneettinen kartta on hyödyllinen tutkittaessa kromosomien sijaintia ja geenejä, jotka osallistuvat tiettyjen ominaisuuksien synnyttämiseen. Nämä tytärsukupolvien perimät geenit tunnistetaan sitten tietyn taudin tai luonteen geneettisiksi markkereiksi.
Kuva 01: Geneettinen kartta
Useita jalostustekniikoita useiden sukupolvien aj alta ja sen jälkeen tietyn ominaisuuden tai ominaisuuden jalostusmallien analysointi ovat tarpeen ennen geenikartan laatimista. Ja myös geeniassosiaatiotutkimukset tukevat edelleen erilaisten alleelien tunnistamista, jotka ovat vastuussa spesifisistä periytymismalleista geenikartoituksessa. Alleelitaajuudet ja geenitaajuudet auttavat ennustamaan tietyn geenin geenikartan kromosomissa.
Mikä on fyysinen kartta?
Geenien fyysiset kartat rakennetaan käyttämällä molekyylibiologisia tekniikoita, kuten restriktioentsyymidigestiota jne. Tästä syystä restriktiokartta on toinen nimi tälle kartalle. Fyysistä karttaa luotaessa restriktioentsyymit leikkaavat DNA:n aluksi fragmenteiksi. Nämä fragmentit erottuvat sitten geelielektroforeesilla. Seuraava vaihe on DNA:n fyysisen kartan luominen. Lisävaiheena ne voidaan altistaa blottaustekniikoille hybridisaation jälkeen. Tällä hetkellä käytetään korkean suorituskyvyn tekniikoita, kuten fluoresenssi-in situ -hybridisaatiota, fyysisten karttojen luomiseen geneettisinä markkereina.
Kuva 02: Fyysinen kartta
Fyysiset kartat ovat tarkempia ja nopeampia verrattuna geneettisiin karttoihin. Siksi niiden käyttö geenien polymorfismin analysoinnissa on korkea verrattuna geneettisiin karttoihin. Fyysinen kartoitus ei myöskään ota huomioon Mendelin geneettisiä malleja.
Mitä yhtäläisyyksiä geneettisen kartan ja fyysisen kartan välillä on?
- Molemmat kartat liittyvät geneettisten merkkien karakterisointiin.
- Genominlaajuisissa tutkimuksissa käytetään molempia karttoja.
- Geenikartta ja fyysinen kartta ovat hyödyllisiä geneettisessä diagnostiikassa.
Mitä eroa on geneettisellä kartalla ja fyysisellä kartalla?
Genetic Map on geenikartta, joka perustuu kromosomin geneettiselle markkerille tai geenilokuksille tehtyihin geenisidos- ja geeniassosiaatiotutkimuksiin. Fyysinen kartta on geenikartta, jossa geenikartta johdetaan fyysisesti eristämällä DNA ja hankkimalla tarkka geneettinen merkki molekyylibiologian tekniikoita käyttäen. Mitä tulee näissä kahdessa kartassa käytettyihin tekniikoihin, ero geneettisen kartan ja fyysisen kartan välillä on se, että geneettinen kartta käyttää geenisidos- ja geeniassosiaatioanalyysimenetelmiä, kun taas fyysinen kartta käyttää restriktiokartoitus- ja hybridisaatiotekniikoita. Siksi geneettisen kartan tarkkuus on alhainen, kun taas fyysisen kartan tarkkuus on korkea.
Kun verrataan näissä kahdessa kartassa käytettyjen tekniikoiden nopeutta, geneettisellä kartalla on vähemmän nopeita, aikaa vieviä tekniikoita. Fyysisellä kartalla on kuitenkin erittäin nopeat tekniikat. Näin ollen geneettinen kartta on vähemmän tehokas, kun taas fyysinen kartta on erittäin tehokas. Lisäksi geneettiset kartat perustuvat Mendelin perinnöllisyysmalleihin, kun taas fyysiset kartat eivät ole suoraan Mendelin perintömalleihin.
Yhteenveto – geneettinen kartta vs fyysinen kartta
Genomitutkimukset käyttävät kromosomeissa sijaitsevia geneettisiä markkereita. Näiden merkkien tutkimiseksi ne on kartoitettava eri tekniikoilla. Mendelin genetiikka on geneettisten karttojen perusta. Geenikartoituksen aikana tutkitaan erilaisia ominaisuuksia useiden sukupolvien ajan ja geenejä analysoidaan geenisidos- ja geeniassosiaatiotutkimuksilla. Sitä vastoin fyysiset geenikartat sisältävät geneettisten markkerien eristämisen ja karakterisoinnin fyysisesti uuttamalla ne. Tämä on tärkein ero geneettisen kartan ja fyysisen kartan välillä.
