Avainero DNA:n ja proteiinimikrosirun välillä on, että DNA-mikrosiru on kokoelma mikroskooppisia DNA-täpliä, jotka on kiinnitetty kiinteään pintaan, kuten lasilevyyn, kun taas proteiinimikrosiru on puhdistettujen proteiinien järjestely kiinteälle pinnalle kuten lasi dia.
Microarray on laboratorio sirulaitteella (LOC). Se on miniatyyri, multipleksinen, rinnakkaiskäsittely- ja tunnistuslaite. Se on myös kaksiulotteinen ryhmä kiinteällä pinnalla, kuten lasilevyllä tai piiohutkalvokennolla. Mikrosiru määrittää suuren määrän biologista materiaalia käyttämällä korkean suorituskyvyn seulontaa. Ensimmäinen mikrosiru oli Tse Wen Changin vuonna 1983 esittelemä vasta-ainesiru. Ensimmäisen geenisirun esittelivät vuonna 1995 Ron Davis ja Pat Brown Stanfordin yliopistossa. Siksi DNA- ja proteiinimikrosiru ovat kahden tyyppisiä mikrosirulaitteita.
Mikä on DNA Microarray?
DNA-mikrosiru on kokoelma mikroskooppisia DNA-täpliä, jotka on kiinnitetty kiinteään pintaan, kuten lasilevyyn. Tutkijat käyttävät DNA-mikrosirua mittaamaan useiden geenien ilmentymistä samanaikaisesti. Sitä käytetään myös useiden genomin alueiden genotyypitykseen. DNA-mikrosiru valmistetaan robottikoneilla. Nämä koneet järjestävät satoja tai tuhansia geenisekvenssejä (koettimia) yhdelle mikroskooppiselle objektilasille.
Kuva 01: DNA-mikrosiru
DNA-mikrosirussa jokainen DNA-täplä sisältää pikomolia (10−12 moolia) tietystä DNA-sekvenssistä. Nämä DNA-sekvenssit tunnetaan myös koettimina tai reporttereina. Nämä koettimet ovat lyhyt osa geenin tai muun DNA-elementin DNA:ta. Ne voivat hybridisoitua cDNA:n tai CRNA:n kanssa näytteessä erittäin tiukoissa olosuhteissa. Fluoresoivasti leimatut näytesekvenssit, jotka sitoutuvat koettimiin, tuottavat signaaleja, jotka riippuvat hybridisaatio-olosuhteista, kuten lämpötilasta. Siksi tätä menetelmää voidaan käyttää näytteen nukleiinihapposekvenssien suhteellisen runsauden määrittämiseen. Lisäksi DNA-mikrosirutekniikkaa käytetään laajasti geenien ilmentymistutkimuksissa, vertailevissa genomitutkimuksissa, ruoan tai soluviljelmien patogeenien aiheuttaman kontaminaatioiden tarkastamisessa, geenimutaatioiden arvioinnissa, lääkekandidaattien tunnistamisessa, geneettisen kytkentäanalyysin tekemisessä jne.
Mikä on Protein Microarray?
Proteiinimikrosiru on puhdistettujen proteiinien järjestely kiinteälle pinnalle, kuten lasilevylle. Se on menetelmä, jota käytetään proteiinien vuorovaikutusten ja aktiivisuuksien havaitsemiseen. Sitä käytetään myös proteiinien toimintojen määrittämiseen suuressa mittakaavassa. Proteiinimikrosirun tärkein etu on, että suuria määriä proteiineja voidaan seurata rinnakkain. Proteiinimikrosiru on siru, joka koostuu tukipinnasta, kuten lasilevystä, nitroselluloosakalvosta, helmistä tai mikrotiitterilevystä. Sieppausproteiinit (vasta-aineet, antigeenit) sitoutuvat tähän kiinteään pintaan. Yleensä fluoresoivalla väriaineella leimatut koetinmolekyylit lisätään myöhemmin ryhmään. Koettimen ja immobilisoitujen proteiinien välinen hybridisaatio lähettää fluoresoivan signaalin, joka voidaan havaita laserskannerilla.
Kuva 02: Proteiinimikrosiru
Ensimmäinen proteiiniryhmä on vasta-ainemikrosiru (vasta-ainematriisi), joka otettiin käyttöön vuonna 1983. Proteiinimikrosirut ovat nopeita, automatisoituja, erittäin herkkiä ja taloudellisia. Ne kuluttavat myös vain pienen määrän näytteitä ja reagensseja. Lisäksi proteiinimikrosiruja käytetään laaj alti sairauksien diagnosoinnissa, proteiinien funktionaalisessa analyysissä, vasta-aineiden karakterisoinnissa ja hoidon kehittämisessä.
Mitä yhtäläisyyksiä DNA:n ja proteiinimikrosirun välillä on?
- DNA ja proteiinimikrosiru ovat kahden tyyppisiä mikrosirulaitteita.
- Molemmat laitteet perustuvat hybridisaatioperiaatteeseen.
- Molemmat laitteet käyttävät antureita.
- Ne käyttävät myös fluoresenssisignaaleja hybridisaation havaitsemiseen.
- Molemmat ovat erittäin hyödyllisiä sairauksien diagnosoinnissa lääketieteessä.
Mitä eroa on DNA:n ja proteiinimikrosirun välillä?
DNA-mikrosiru on kokoelma mikroskooppisia DNA-täpliä, jotka on kiinnitetty kiinteään pintaan, kuten lasilevyyn. Sitä vastoin proteiinimikrosiru on puhdistettujen proteiinien järjestely kiinteälle pinnalle, kuten lasilevylle. Joten tämä on avainero DNA:n ja proteiinimikrosirun välillä. Lisäksi DNA-mikrosirussa näyte ja koetin ovat DNA-sekvenssejä. Toisa alta proteiinimikroarrayssa näyte ja koetin ovat proteiineja.
Seuraava infografiikka esittelee DNA:n ja proteiinimikrosirun väliset erot taulukkomuodossa.
Yhteenveto – DNA vs Protein Microarray
Mikrosiru on korkean suorituskyvyn ja multipleksattu lab-on-a-chip. Se on valmistettu hybridisaatioperiaatteella. DNA- ja proteiinimikrosiru ovat kahden tyyppisiä mikrosirulaitteita. DNA-mikrosiru on kokoelma mikroskooppisia DNA-täpliä, jotka on kiinnitetty kiinteään pintaan, kuten lasilevyyn. Toisa alta proteiinimikrosiru on puhdistettujen proteiinien järjestely kiinteälle pinnalle, kuten lasilevylle. Näin ollen tämä on yhteenveto DNA:n ja proteiinimikrosirun välisestä erosta.
