Avainero geneettisen etäisyyden ja fyysisen etäisyyden välillä on sekvenssityyppi, jota käytetään analysoitaessa kahden saman lajin populaation välistä etäisyyttä. Geneettinen etäisyys mittaa geneettistä eroa lajien välillä tai lajin sisällä olevien populaatioiden välillä, kun taas fyysinen etäisyys mittaa nukleotidien lukumäärää kahden markkerin välillä.
Geneettinen etäisyys ja fyysinen etäisyys antavat käsityksen lajin kahden populaation välisistä evoluutiosuhteista. Siksi etäisyyskartat tarjoavat populaatioiden linkittämistä geneettiseen tietoon. Genomisekvensoinnilla ja bioinformatiikka-analyysillä on tärkeä rooli sekä geneettisten että fyysisten etäisyyksien määrittämisessä.
Mikä on geneettinen etäisyys?
Geneettinen etäisyys on lajien tai populaatioiden välisen geneettisen eron mitta. Tämä etäisyys mitataan käyttämällä esi-isien suhteita ja evoluutiomalleja. Geenien samank altaisuus on tärkeää geneettisen etäisyyden mittaamisessa. Geneettinen etäisyys määrittää myös lajin etäisyyden esi-isänsä. Lisäksi geneettisten etäisyyksien pääasiallinen käyttötarkoitus on populaatioiden välisten suhteiden arvioinnissa eri puolilla maailmaa. Siksi se yhdistää ihmislajipopulaatiot ympäri maailmaa niiden geneettisten mallien perusteella.
Geenietäisyyksien laskeminen tapahtuu etsimällä lajien ja populaatioiden geneettinen samank altaisuus kokonaisuutena. Siksi bioinformatiikalla on tärkeä rooli eri lajien ja populaatioiden välisen geneettisen etäisyyden määrittämisessä.
Lisäksi on olemassa erilaisia malleja, jotka edustavat populaatioiden välisiä geneettisiä etäisyyksiä. Niihin kuuluvat Nein geneettinen etäisyys, Cavalli-Sforzan ja Edwardsin mittaus sekä Reynoldsin, Weirin ja Cockerhamin geneettinen etäisyys.
Mikä on fyysinen etäisyys?
Fysikaalinen etäisyys on kahden lajin tai populaation välisten nukleotidien lukumäärän mittaus. Näin ollen fyysistä etäisyyttä laskettaessa mittaustaso menee pidemmälle monomeeritasoiksi. Tämä sisältää yksittäisten nukleotidisekvenssien tai kokonaisten genomien analysoinnin kokonaisuutena. Merkkigeenien välisellä fyysisellä etäisyydellä on tärkeä rooli niiden välisten nukleotidien lukumäärän määrittämisessä.
Jos siis fyysinen etäisyys kahden populaation välillä kasvaa, myös geneettinen etäisyys kasvaa. Tämä voi vuorostaan lisätä myös organismien monimutkaisuutta. Sekä geneettinen etäisyys että fyysinen etäisyys muodostavat yhdessä evoluutiosuhteen kahden populaation välille.
Mitä yhtäläisyyksiä geneettisen etäisyyden ja fyysisen etäisyyden välillä on?
- Geneettinen etäisyys ja fyysinen etäisyys määräävät lajin kahden populaation väliset evoluutiosuhteet.
- Molemmat käyttävät bioinformatiikkaa ja sekvensointidataa etäisyyksien analysointiin.
- Ne ovat tarkkoja tekniikoita evoluutio- ja esi-isien suhteiden ehdottamiseen.
- Lisäksi yhden lisäys lisää toista.
Mitä eroa on geneettisellä etäisyydellä ja fyysisellä etäisyydellä?
Avainero geneettisen etäisyyden ja fyysisen etäisyyden välillä riippuu etäisyyskartan johtamisessa käytettyjen sekvenssien tyypistä. Geneettinen etäisyys on kahden populaation välinen etäisyys, joka koskee geneettistä eroa, kun taas fyysinen etäisyys mittaa kahden populaation välisiä nukleotidietäisyyksiä.
Alla oleva infografiikka esittää enemmän tietoa geneettisen etäisyyden ja fyysisen etäisyyden eroista.
Yhteenveto – Geneettinen etäisyys vs. fyysinen etäisyys
Geneettinen etäisyys ja fyysinen etäisyys viittaavat molemmat lajin kahden populaation väliseen evoluution ja esi-isien väliseen suhteeseen. Siksi molemmat ovat tärkeitä johtopäätöksen tekemiseksi evolutionaarisista etäisyyksistä. Geneettinen etäisyys viittaa kahden populaation väliseen etäisyyteen suhteessa spesifisiin geneettisiin markkereihin, kun taas fyysinen etäisyys viittaa etäisyyteen valittujen merkkigeenien vieressä olevien nukleotidisekvenssien välillä. Näin ollen tämä on avainero geneettisen etäisyyden ja fyysisen etäisyyden välillä.
