Avainero oligopeptidin ja polypeptidin välillä on, että oligopeptidit sisältävät vähän aminohappotähteitä, kun taas polypeptidit sisältävät suuren määrän aminohappotähteitä.
Termit oligopeptidit ja polypeptidit kuuluvat proteiinien luokkaan. Peptidit ovat lyhyitä aminohappoketjuja. Aminohapot sitoutuvat toisiinsa peptidisidosten kautta. Siksi voimme luokitella nämä peptidit näissä peptideissä olevien aminohappojen lukumäärän mukaan. Esimerkiksi dipeptidit, tripeptidit, tetrapeptidit, oligopeptidit ja polypeptidit.
Mikä on oligopeptidi?
Oligopeptidi on aminohappoketju, joka sisältää pienen määrän aminohappoja molekyyliä kohden. Kutsumme näitä molekyylejä usein "peptideiksi" yleistermiksi. Näissä peptidimolekyyleissä läsnä olevien aminohappotähteiden lukumäärä voi vaihdella kahdesta kahteenkymmeneen aminohappoon. Oligopeptidit voivat sisältää myös pieniä peptidimuotoja, kuten dipeptidejä, tripeptidejä jne. Joitakin yleisiä esimerkkejä luonnossa esiintyvistä oligopeptideistä ovat mikroviridiini, syanopeptoliinit, mikrokystiinit jne.
Kuva 01: Tripeptidin rakenne
Näitä oligopeptidejä tuottavat ei-ribosomaaliset peptidisyntaasit tai NRPS. Mutta on joitain poikkeuksia. Esimerkiksi syklamidit ja mikroviridiini syntetisoidaan ribosomireittejä pitkin. Oligopeptidien eristysprosessi sisältää oligopeptidin rikastamisen, puhdistuksen ja tunnistamisen. Tunnistusprosessissa voimme käyttää geelikromatografiaa, HPLC:tä, HPLC-massaspektroskopiaa, ioninvaihtokromatografiaa jne.
Mikä on polypeptidi
Polypeptidi on aminohappotähteiden ketju, joka sisältää suuren määrän aminohappoja. Proteiini sisältää yhden tai useamman polypeptidiketjun. Näissä polypeptidiketjuissa aminohapot on kytketty toisiinsa peptidisidoksilla, jotka ovat kovalenttisia kemiallisia sidoksia. Jokainen polypeptidiketju sisältää kaksi päätettä: N-terminaalin ja C-terminaalin. N-pää on aminopää, joka päättyy vapaaseen aminoryhmään, kun taas C-pää on karboksyylipää, joka päättyy vapaaseen karboksyyliryhmään. Peptidissä olevien aminohapposekvenssin määräävät mRNA:ssa olevat kodonit, jotka osallistuvat polypeptidin tai proteiinin tuotantoon templaattijuosteen translaation kautta.
Proteiinissa olevien polypeptidien lukumäärän ja järjestyksen mukaan proteiinirakenteita on neljää päätyyppiä seuraavasti:
- Primäärirakenne – Proteiinin primäärirakenne sisältää yhden polypeptidiketjun, jossa on disulfidisillat joidenkin saman ketjun aminohappojen välillä, mikä muodostaa laskostetun rakenteen.
- Toissijainen rakenne – Proteiinin sekundaarirakenteella on kaksi päämuotoa: alfa-heliksirakenne ja beetalevyrakenne.
Kuva 02: Alpha Helix -rakenne
- Tertiäärinen rakenne – Tämä on pitkälle taitettu verkkorakenne. Tämä rakenne on erittäin tärkeä, koska se määrää proteiinin toiminnan.
- Kvaternäärinen rakenne – Tämä on erittäin monimutkainen rakenne kahdesta tai kolmesta toisiinsa kytkeytyneestä polypeptidiketjusta.
Mitä eroa oligopeptidillä ja polypeptidillä on?
Oligopeptidit ja polypeptidit ovat kaksi eri proteiiniluokkaa. Ne eroavat toisistaan riippuen proteiinimolekyyleissä olevien aminohappotähteiden lukumäärästä. Siksi avainero oligopeptidin ja polypeptidin välillä on, että oligopeptidit sisältävät vähän aminohappotähteitä, kun taas polypeptidit sisältävät suuren määrän aminohappotähteitä.
Alla oleva infografiikka tiivistää eron oligopeptidin ja polypeptidin välillä.
Yhteenveto – Oligopeptidi vs. polypeptidi
Oligopeptidit ja polypeptidit ovat kaksi eri proteiiniluokkaa. Ne eroavat toisistaan riippuen näissä proteiinimolekyyleissä olevien aminohappotähteiden lukumäärästä. Eli avainero oligopeptidin ja polypeptidin välillä on se, että oligopeptidit sisältävät vähän aminohappotähteitä, kun taas polypeptidit sisältävät suuren määrän aminohappotähteitä.
