Avainero homodimeerin ja heterodimeerin välillä on, että homodimeeri on proteiini, joka on valmistettu kahdesta identtisestä proteiinista, kun taas heterodimeeri on proteiini, joka on valmistettu kahdesta eri proteiinista.
Proteiini on biomolekyyli, joka koostuu aminohappoketjuista. Proteiinidimeeri on kvaternäärinen proteiinirakenne, joka muodostuu kahden proteiinimonomeerin tai kahden aminohappoketjun yhdistymisestä. Yleensä ne sitoutuvat toisiinsa ei-kovalenttisilla sidoksilla. Proteiinidimeerit ovat joko homodimeerejä tai heterodimeerejä. Homodimeerissä on kaksi identtistä proteiinia, jotka ovat ei-kovalenttisesti sitoutuneita. Heterodimeerissä on kaksi erilaista proteiinia sitoutuneena yhteen. Tämä proteiinidimeerivuorovaikutus on tärkeä säätelyssä ja katalyysissä.
Mikä on homodimeeri?
Homodimeeri on eräänlainen proteiinidimeeri, joka koostuu kahdesta identtisestä monomeerista. Monomeerit sitoutuvat ei-kovalenttisilla sidoksilla. Yleensä homodimeereissä on 18 keskimääräistä H-sidosten lukumäärää. Lisäksi korrelaatiokerroin H-sidosten ja rajapintatähteiden välillä homodimeerissä on 0,85. Lisäksi H-sidosten enimmäismäärä homodimeerin rajapintajäännöstä kohti on 0,44. Ei vain sitä, vaan myös homodimeereissä on enemmän molekyylien välisiä H-sidoksia. H-sidosten tiheys rajapintajäännöstä kohti on kuitenkin pienempi homodimeereissä.
Kuva 01: Homodimeeri
Kun tarkastellaan esimerkkejä homodimeereistä, luokan 1 RNA:t ovat homodimeerejä. Tässä homodimeerissä R1-proteiini on vastuussa nukleotidien vähentämisestä, kun taas R2-proteiini on vastuussa dirautatyrosyyliryhmän säilyttämisestä. Toinen proteiinihomodimeeri on kilpirauhasen tuottama tyroglobuliini. Ksantiinioksidaasi ja etanersepti ovat myös proteiinihomodimeerejä.
Mikä on heterodimeeri?
Heterodimeeri on eräänlainen proteiinidimeeri, joka on kompleksoitu kahdesta epäidenttisestä monomeerista. Toisin sanoen heterodimeeri on proteiini, joka koostuu kahdesta eri proteiinimonomeerista. Yleensä heterodimeereissä on 12 keskimääräistä H-sidosten lukumäärää. Lisäksi korrelaatiokerroin H-sidosten ja rajapintatähteiden välillä heterodimeerissä on 0,83. Lisäksi H-sidosten enimmäismäärä heterodimeerin rajapintatähdettä kohti on 0,65. Verrattuna homodimeereihin, heterodimeereissä on vähemmän molekyylien välisiä H-sidoksia. H-sidosten tiheys rajapintajäännöstä kohti on kuitenkin suurempi heterodimeereissä.
Kuva 02: Heterodimeeri
Entsyymin käänteistranskriptaasi on heterodimeeri, joka koostuu kahdesta erilaisesta aminohappoketjusta. Toinen esimerkki heterodimeeristä ovat opioidireseptorit. Lisäksi tubuliini on heterodimeeriproteiini.
Mitä yhtäläisyyksiä homodimeerin ja heterodimeerin välillä on?
- Homodimeeri ja heterodimeeri ovat kahdenlaisia proteiinin himmentimiä.
- Molemmissa on kaksi monomeeriä.
- Ne ovat kvaternaarisia proteiinirakenteita.
- Dimeerit ovat yleisiä katalyysissä ja säätelyssä.
Mitä eroa on homodimeerillä ja heterodimeerillä?
Homodimeeri on proteiinidimeeri, joka koostuu kahdesta identtisestä proteiinimonomeerista, kun taas heterodimeeri on proteiinidimeeri, joka koostuu kahdesta eri proteiinimonomeerista. Joten tämä on avainero homodimeerin ja heterodimeerin välillä. Lisäksi homodimeereissä on 18 keskimääräistä H-sidosten lukumäärää, kun taas heterodimeereissä on 12 keskimääräistä H-sidosten lukumäärää.
Lisäksi toinen ero homodimeerin ja heterodimeerin välillä on se, että korrelaatiokerroin H-sidosten ja rajapintatähteiden välillä on 0,85 homodimeereissä, kun taas se on 0,83 heterodimeereissä.
Alla oleva infografiikka homodimeerin ja heterodimeerin välisestä erosta näyttää enemmän vertailuja molempien dimeerien välillä.
Yhteenveto – Homodimeeri vs heterodimeeri
Proteiinidimeerit ovat yleisiä katalyysissä ja säätelyssä. Ne voivat olla joko homodimeerejä tai heterodimeerejä. Homodimeerit koostuvat kahdesta identtisestä proteiinimonomeerista. Sitä vastoin heterodimeerit koostuvat kahdesta ei-identtisestä proteiinimonomeerista. Siten tämä on avainero homodimeerin ja heterodimeerin välillä.
