Avainero PARP1:n ja PARP2:n välillä on, että kasvien ja eläinten PARP1 kantaa Zn-sormen DNA:ta sitovia motiiveja, kun taas kasvin PARP2 kantaa N-terminaalisia SAP DNA:ta sitovia motiiveja.
Poly-ADP-riboosipolymeraasi (PARP) on ryhmä proteiineja, jotka ovat tuman entsyymejä. PARP-perheessä on 17 erilaista PARP-entsyymiä. PARP1 ja PARP2 ovat kaksi entsyymiä, jotka ovat välttämättömiä normaalille DNA:n korjaustoiminnalle.
Mikä PARP on?
PARP (poly-ADP-riboosipolymeraasi) on proteiiniperhe, joka toimii lukuisissa soluprosesseissa, kuten DNA:n korjauksessa, genomisen stabiilisuudessa ja ohjelmoidussa solukuolemassa. Ne katalysoivat prosessia, jota kutsutaan ADP-ribosylaatioksi. ADP-ribosylaatio tarkoittaa ADP-riboosiyksiköiden lisäämistä nikotiiniamidiadeniinidinukleotidista (NAD) kohdesubstraatteihin DNA-juosteen katkeamien korjaamiseksi.
PARP-entsyymit ovat DNA:ta sitovia proteiineja. Ne aktivoituvat DNA-molekyyleissä olevien lovien vaikutuksesta. Kun ne sitoutuvat DNA-katkoiksi, ne hydrolysoivat NAD+ nikotiiniamidiksi ja edistävät ADP-riboosin polymeroitumista. Siksi PARP-ydinentsyymit osallistuvat DNA:n korjaukseen. Lisäksi poly-ADP-ribosylaatio toimii translaation jälkeisenä modifikaationa, jolla on avainrooli replikaatiossa, transkription säätelyssä, telomeerien ylläpidossa ja proteiinien hajoamisessa. PARP-entsyymit osallistuvat myös genomin stabiilisuuden ylläpitämiseen, kromatiinin rakenteen säätelyyn, solujen lisääntymiseen ja apoptoosiin.
Mikä on PARP1?
PARP1 on PARP-proteiiniperheen jäsen. Se on ensimmäinen ja parhaiten karakterisoitu proteiini tässä perheessä. Se toimii ensimmäisenä reagoijana, joka havaitsee DNA-vauriot ja helpottaa sitten korjausmekanismin valintaa. Lisäksi PARP1 säätelee yksijuosteisten DNA-vaurioiden korjaamista.
Kuva 01: PARP1
Yksijuosteisten DNA-katkojen korjaamisen lisäksi PARP1 säätelee replikaatiohaarukan etenemistä ja uudelleenkäynnistystä. Lisäksi se edistää vaihtoehtoista ei-homologista loppuliitosta.
Mikä on PARP2?
PARP2 on toinen PARP-proteiiniperheen jäsenproteiini. Se on läheistä sukua PARP1-entsyymille. PARP2-geeni koodaa PARP2-proteiinia ihmisillä. PARP2:lla on katalyyttinen domeeni, mutta siitä puuttuu N-terminaalinen DNA:ta sitova domeeni. PARP-estäjän syöpälääkkeet voivat estää PARP2:ta, kuten PARP1.
Kuva 02: PARP2
Kasveissa, erityisesti Arabidopsis thalianassa, PARP2:lla on merkittävä rooli suojaavissa vasteissa DNA-vaurioita ja bakteerien patogeneesiä vastaan kuin PARP1.
Mitä yhtäläisyyksiä PARP1:n ja PARP2:n välillä on?
- PARP1 ja PARP2 ovat kahdenlaisia ydinentsyymejä.
- He käyttävät NAD+:a substraattinaan poly-ADP-ribosylaation katalysoimiseen.
- Molemmat aktivoituvat DNA:n yksijuosteisten katkeamien takia.
- Nisäkkään PARP1 ja PARP2 sijaitsevat ytimessä.
- Sekä PARP1 että PARP2 ovat vuorovaikutuksessa kromatiinin kanssa.
- He korjaavat DNA-vaurioita.
- Jotkut PARP1:een suunnatut PARP-estäjän syöpälääkkeet estävät myös PARP2:ta.
Mitä eroa on PARP1:n ja PARP2:n välillä?
PARP1 on PARP-proteiiniperheen jäsen, jolla on katalyyttinen domeeni ja N-terminaalinen DNA:ta sitova domeeni, kun taas PARP2 on PARP-perheen jäsen, josta puuttuu N-terminaalinen DNA:ta sitova domeeni.avainero PARP1:n ja PARP2:n välillä on, että kasvien ja eläinten PARP1 kantaa Zn-sormen DNA:ta sitovia motiiveja, kun taas kasvin PARP2 kantaa N-terminaalisia SAP DNA:ta sitovia motiiveja.
Seuraava infografiikka esittää yhteenvedon PARP1:n ja PARP2:n eroista.
Yhteenveto – PARP1 vs PARP2
PARP:t ovat ydinentsyymejä, jotka tunnistavat DNA-vaurioita ja korjaavat niitä. PARP1 ja PARP2 ovat kaksi niistä, jotka liittyvät läheisesti toisiinsa. Molemmilla entsyymeillä on katalyyttinen domeeni. Mutta PARP2:lta puuttuu N-terminaalinen DNA:ta sitova domeeni, joka on läsnä PARP1:ssä. Siksi tämä on avainero PARP1:n ja PARP2:n välillä. Molemmat entsyymityypit käyttävät substraattinaan NAD+.