Avainero PFGE- ja CRP-analyysin välillä on se, että PFGE on laboratoriotekniikka, jota käytetään suurten DNA-molekyylien erottamiseen käyttämällä ajoittain muuttuvaa sähkökenttää, kun taas CRP-analyysi (c-reactive protein) on tekniikka, joka havaitsee renkaan muotoisen proteiinin veriplasmasta.
PFGE- ja CRP-analyysi ovat kaksi tekniikkaa, joita tutkijat käyttävät erilaisten patogeenisten organismien havaitsemiseen, jotka aiheuttavat vahinkoa ihmiskeholle. Pulssikenttägeelielektroforeesi (PFGE) on suora laboratoriotekniikka, joka havaitsee patogeenin, erityisesti bakteeri-isolaatin, DNA-sormenjäljen. CRP puolestaan on epäsuora testi, jota käytetään havaitsemaan tietty proteiini verestä, joka johtuu tulehduksesta. Nämä tulehdukset johtuvat yleensä bakteeri- tai muiden patogeenien aiheuttamista infektioista.
Mikä on PFGE?
Pulssikenttägeelielektroforeesi on tekniikka, jota käytetään suurten DNA-molekyylien erottamiseen geelimatriisissa käyttämällä sähkökenttää. Sähkökenttä muuttaa ajoittain suuntaaan. Sitä voidaan käyttää eri organismien geenitekniikkaan tai genotyypitykseen. PFGE:n menetelmä on suhteellisen samanlainen kuin tavallinen geelielektroforeesitekniikka. Ainoa ero on jännite, joka muuttuu ajoittain kolmen suunnan välillä. Yksi suunta kulkee geelin keskiakselin läpi, kun taas kaksi muuta kulkevat 60 asteen kulmassa kummallakin puolella. Koska pulssiaika on sama jokaisessa suunnassa, se johtaa DNA:n nettovaellukseen eteenpäin.
Kuva 01: PFGE-analyysi
Tämä toimenpide kestää kauemmin kuin yleinen geelielektroforeesi erotettavien fragmenttien koon vuoksi. PFGE-tekniikassa sähkökentän suunnan muutoksilla eri pituiset DNA:t reagoivat muutoksiin eri nopeuksilla. Suuret DNA-fragmentit kohdistuvat uudelleen hitaasti verrattuna pienempiin DNA-fragmentteihin, jotka kohdistuvat uudelleen nopeasti. Siksi DNA-fragmenttien parempi erottaminen on mahdollista tällä tekniikalla.
PFGE:tä käytetään yleisesti bakteeripatogeenien, kuten Listeria monocytogenesin, havaitsemiseen. Se on suosittu menetelmä kliinisten infektioiden havaitsemiseen.
Mikä on CRP-analyysi?
C-reaktiivinen proteiini (CRP) on rengasmainen (renkaan muotoinen) pentameerinen proteiini, jota löytyy veriplasmasta. Yleensä CRP:n pitoisuudet kasvavat vasteena tulehdukselle. CRP-analyysi perustuu tämän proteiinin havaitsemiseen veriplasmassa. Maksa syntetisoi CRP-proteiinia vasteena tietyille makrofagien ja rasvasolujen erittämille tekijöille. CRP-proteiini on ensimmäinen tunnistettu kuvion tunnistava reseptori (PRR).
Kuva 02: CRP-analyysi
Kohonnut CRP-proteiinitaso voidaan havaita trauman, sydänkohtauksen, autoimmuunisairauksien ja bakteeri-infektioiden, kuten sepsiksen, jälkeen. Normaali CRP-proteiinitaso veriplasmassa on 0,3-10 milligrammaa litrassa (mg/l). Veri otetaan suonesta, yleensä potilaan käsivarresta. Analyysi suoritetaan käyttämällä biokemiallista mittausmenetelmää. CRP-testin tuloksessa yli 10 mg/l CRP-arvot ovat merkki vakavasta infektiosta (sepsis). CRP-testi ei selitä tulehduksen sijaintia tai syytä. Siksi lääkäreiden on suositeltava lisätutkimuksia tulehduksen syyn selvittämiseksi. Joskus CRP-proteiinitaso nousee myös tupakoinnin, liikalihavuuden ja harjoitusten puutteen vuoksi.
Mitä yhtäläisyyksiä PFGE:n ja CRP-analyysin välillä on?
- PFGE- ja CRP-analyysit ovat laboratorioissa käytettyjä testausmenetelmiä.
- Molemmat testit kohdistuvat biomolekyyleihin.
- Niitä käytetään ihmisten sairauksien havaitsemiseen.
- Näillä testeillä voidaan havaita taudinaiheuttajat.
Mitä eroa on PFGE- ja CRP-analyysillä?
PFGE on laboratoriotekniikka, jota käytetään suurten DNA-molekyylien erottamiseen käyttämällä ajoittain muuttuvaa sähkökenttää. Sitä vastoin CRP-analyysi on tekniikka, joka havaitsee renkaan muotoisia proteiineja veriplasmassa. Näin ollen tämä on avainero PFGE- ja CRP-analyysin välillä. Lisäksi PFGE havaitsee patogeenit suoraan, kun taas CRP-analyysi havaitsee patogeenit epäsuorasti.
Alla on luettelo tärkeistä eroista PFGE- ja CRP-analyysin välillä taulukkomuodossa.
Yhteenveto – PFGE vs CRP-analyysi
PFGE- ja CRP-analyysi ovat kaksi kliinisissä laboratorioissa rutiininomaisesti käytettyä testiä. PFGE on laboratoriotekniikka, jota tutkijat käyttävät tuottamaan DNA-sormenjälkiä, erityisesti bakteeripatogeenejä. C-reaktiivisen proteiinin (CRP) testiä käytetään tulehduksen havaitsemiseen havaitsemalla kohonnut c-reaktiivinen proteiini veriplasmassa. Molemmat testit ovat tärkeitä ihmisten sairauksien havaitsemisessa. Näin ollen tämä tiivistää eron PFGE- ja CRP-analyysin välillä.
