Avainero sukkulavektorin ja ekspressiovektorin välillä on se, että sukkulavektori on yleensä plasmidi, jota ei ole suunniteltu geenin ilmentymistutkimuksiin soluissa, kun taas ekspressiovektori on yleensä plasmidi tai virus, joka on suunniteltu geeniekspressiotutkimuksiin solut.
Molekyylibiologiassa vektori on DNA-molekyyli, jota käytetään väliaineena viemään vieraan geneettisen materiaalin toiseen soluun, jossa se voidaan replikoida tai ilmentää. Vieraan geneettisen materiaalin kontaktissa olevaa vektoria kutsutaan yleensä yhdistelmä-DNA-molekyyliksi. Neljä päätyyppiä vektoreita ovat plasmidit, virusvektorit, kosmidit ja keinotekoiset kromosomit. Näistä yleisimmin käytettyjä vektoreita ovat plasmidit. Sukkulavektori ja ekspressiovektori ovat kahden tyyppisiä vektoreita, joita käytetään molekyylibiologiassa.
Mikä on sukkulavektori?
Sukkulavektori on vektori, joka on suunniteltu lisääntymään kahdessa eri isäntälajissa. Siksi sukkulavektoriin lisättyä vierasta DNA:ta voidaan testata tai manipuloida kahdessa eri solutyypissä. Normaalisti sukkulavektorilla on kaksi replikaation aloituskohtaa, joista jokainen on isäntäkohtainen. Kun sukkulavektorit replikoituvat kahdessa eri isännässä, ne tunnetaan myös bifunktionaalisina vektoreina. Yksi suosittu sukkulavektori on hiivasukkulavektori. Lisäksi lähes kaikki yleisesti käytetyt Saccharomyces cerevisiae -vektorit ovat sukkulavektoreita. Esimerkiksi hiivasukkulavektori sisältää komponentteja, jotka mahdollistavat replikaation ja valinnan sekä hiivasoluissa että E. coli -soluissa. Hiivasukkulavektorin E. coli -komponentit ovat replikaation aloituskohta ja valittavissa oleva merkki (esim.antibioottiresistenssi, beetalaktamaasi). Hiivasukkulavektorin hiivakomponentit ovat autonomisesti replikoituva sekvenssi (ARS), hiivan sentromeeri (CEN) ja selektoitava hiivamerkki (esim. URA3 - geeni, joka koodaa entsyymiä urasiilin synteesiä varten)
Mikä on lausekevektori?
Ekspressiovektori on yleensä plasmidi tai virus, joka on rakennettu geenien ilmentämistä varten soluissa. Tätä vektoria käytetään viemään spesifinen geeni kohdesoluun. Tämä vektori voi hallita solun proteiinisynteesin mekanismia tietyn geenin koodaaman proteiinin tuottamiseksi. Kun ekspressiovektori on solun sisällä, vieraan geenin koodaama proteiini tuotetaan käyttämällä solun translaatiokoneiston ribosomikomplekseja.
Kuva 01: Lausekevektori
Ekspressiovektori on suunniteltu sisältämään säätelysekvenssejä, jotka toimivat tehostaja- ja promoottorialueina, jotka johtavat vieraan geenin tehokkaaseen transkriptioon. Näin ollen merkittävä määrä stabiilia lähetti-RNA:ta (mRNA) voidaan myöhemmin transloida spesifisiksi proteiineiksi. Proteiinin ilmentyminen ekspressiovektoria käyttämällä voidaan kontrolloida tiukasti. Proteiinia tuotetaan tarvittaessa merkittäviä määriä indusoijaa käyttämällä. Joissakin systeemeissä proteiini voi kuitenkin ilmentyä konstitutiivisesti. Suosittu esimerkki ekspressiovektorista on pCI-nisäkäsvektori.
Mitä yhtäläisyyksiä sukkulavektorin ja lausekevektorin välillä on?
- Sukkulavektori ja ekspressiovektori ovat kahden tyyppisiä vektoreita, joita käytetään molekyylibiologiassa.
- Molemmat vektorit voivat olla plasmideja.
- Tällaisilla vektoreilla on replikaation aloituskohta.
- Molemmilla vektoreilla on kloonauskohtia.
- Näillä vektoreilla on valittavissa olevia markkereita (antibioottiresistenssi).
Mitä eroa sukkulavektorilla ja lausekevektorilla on?
Sukkulavektori on yleensä plasmidi, jota ei ole suunniteltu geeniekspressiotutkimuksiin soluissa, kun taas ilmentämisvektori on yleensä plasmidi tai virus, joka on suunniteltu geenin ilmentymistutkimuksiin soluissa. Siten tämä on avainero sukkulavektorin ja ekspressiovektorin välillä. Lisäksi sukkulavektori ei tarvitse säätelysekvenssejä, kuten vahvaa promoottoria, tehostajaa, indusoijaa ja kannettavaa translaation aloitussekvenssiä (PTIS) ja vahvaa terminaattoria. Toisa alta ekspressiovektori tarvitsee säätelysekvenssejä, kuten vahvan promoottorin, tehostajan, indusoijan ja kannettavan translaation aloitussekvenssin (PTIS) ja vahvan terminaattorin.
Alla oleva infografiikka esittelee sukkulavektorin ja ekspressiovektorin väliset erot taulukkomuodossa vierekkäin vertailua varten.
Yhteenveto – Shuttle Vector vs Expression Vector
Sukkulavektori ja ekspressiovektori ovat kahden tyyppisiä vektoreita, joita käytetään molekyylibiologisissa kokeissa. Sukkulavektori on yleensä plasmidi, jota ei ole suunniteltu solujen geeniekspressiotutkimuksiin, kun taas ekspressiovektori on yleensä plasmidi tai virus, joka on suunniteltu solujen geeniekspressiotutkimuksiin. Joten tämä on avainero sukkulavektorin ja ekspressiovektorin välillä.
