siRNA vs miRNA
RNA:t ovat erittäin tärkeitä molekyylejä, jotka auttavat rakentamaan organismien elämää. Äskettäin tutkijat ovat löytäneet pieniä RNA:ita, joita kutsutaan RNA-häiriöiksi tai RNAi:iksi ja jotka toimivat transkription jälkeen sääteleen geenin ilmentymistä. Kaksi pienten RNA:iden päätyyppiä ovat mikro-RNA tai miRNA ja pieni häiritsevä RNA tai siRNA. Nämä molekyylit säätelevät pohjimmiltaan geenin ilmentymistä suppressoimalla kohdegeeniä. Sekä miRNA:lla että siRNA:lla on hyvin samank altaiset biogeneesireitit, vaikka niiden välillä on joitain eroja. MiRNA:n ja siRNA:n alkuperä ovat peräisin dsRNA-molekyyleistä. Kypsät miRNA:t ovat rakenteellisesti samanlaisia kuin siRNA-molekyylit.
miRNA
Mikro-RNA:t tai miRNA:t ovat pieniä RNA-molekyylejä, jotka välittävät viimeisen tarkastuksen translaatiogeenisäätelyssä. MiRNA:n säätelyn purkaminen voi johtaa syövän ja muiden sairauksien kehittymiseen. Siksi miRNA:n ei-koodaavalla alueella koodatun tiedon asianmukainen säätely on erittäin tärkeää monissa solun perusprosesseissa.
siRNA
siRNA:ita kutsutaan myös lyhyiksi häiritseväksi tai vaimentavaksi RNA:ksi, ja ne koostuvat kaksijuosteisesta RNA:sta, jossa on 20-25 emäsparia. SiRNA:n päärooli on häiritä spesifisten geenien ilmentymistä komplementaarisilla nukleotidisekvensseillä. siRNA koostuu lyhyestä kaksijuosteisesta RNA:sta, jossa on fosforyloidut 5'-päät ja hydroksyloidut 3'-päät, joissa on kaksi ulkonevaa nukleotidia.
Mitä eroa on siRNA:lla ja miRNA:lla?
• miRNA on peräisin spesifisistä genomisista lokuksista, kun taas siRNA on peräisin mRNA:sta, transposoneista, viruksista tai heterokromaattisesta DNA:sta.
• MiRNA:n synteesi prosessoidaan pitkistä prekursorihiusneulatranskripteistä (primaarinen tuman miRNA-sekvenssi RNaasi III -endonukleaasin avulla), kun taas siRNA:n synteesi prosessoidaan pitkistä bimolekulaarisista RNA-duplekseista.
• Jokainen miRNA-hiusneulaprekursorimolekyyli tuottaa yhden miRNA-dupleksin, kun taas jokainen siRNA-prekursorimolekyyli tuottaa useita siRNA-duplekseja.
• siRNA-sekvenssit ovat harvoin konservoituneita, kun taas miRNA-sekvenssit ovat hyvin konservoituneita.
• Kaikki siRNA:n sisältämät emäkset myötävaikuttavat sen kohdespesifisyyteen, kun taas vain 5' puolet miRNA:sta vaikuttaa sen kohdespesifisyyteen.
• miRNA sitoutuu usein kohdetranskriptien 3' transloimattomaan alueeseen, kun taas siRNA:t muodostavat komplementaarisen dupleksin missä tahansa kohde-mRNA:ssa.
• miRNA määrittää "heterohiljennyksen", kun taas siRNA:ta käytetään "automaattiseen hiljentämiseen".
• miRNA toimii signaalina estämään translaation, kun taas siRNA fyysisesti estää translaation.
