Avainero snRNA:n ja snRNP:n välillä on se, että snRNA:t ovat pieniä tuman RNA-molekyylejä, kun taas snRNP:t tai pienet tuman ribonukleoproteiinit ovat pieniä ydin-RNA-molekyylejä, joissa on proteiineja.
snRNA:t ovat ei-koodaavia, biologisesti aktiivisia pieniä RNA-molekyylejä, joiden keskikoko on 150 nukleotidia. Ne ovat yleensä läsnä proteiinien yhteydessä snRNP:inä luonnollisessa tilassa. Näin ollen snRNP:t ovat pieniä tuma-RNA:ita, joissa on useita snRNP-spesifisiä proteiineja. snRNP:t ovat mukana välittämässä tai säätelemässä translaation jälkeisiä RNA:n prosessointitapahtumia, kuten silmukointia jne. Sekä snRNA:ta että snRNP:tä löytyy eukaryoottisolujen ytimestä.
Mikä on snRNA?
snRNA tarkoittaa pientä tuman RNA:ta. Ne ovat pieniä ydin-RNA-molekyylejä, joita löytyy eukaryoottisolujen solun ytimen silmukointipilkuista ja Cajal-kappaleista. SnRNA-molekyylin keskimääräinen pituus on 150 nukleotidia. Pol II ja pol III transkriptoivat nämä snRNA:t. SnRNA:n päätehtävä on esilähetti-RNA:n (hnRNA) prosessointi ytimessä. Ne ovat pääasiassa mukana välittämässä tai säätelemässä translaation jälkeisiä RNA:n prosessointitapahtumia, kuten silmukointia. SnRNA:iden toiminnan ansiosta intronien tarkka kohdistus ja oikea leikkaus tapahtuvat. Lisäksi snRNA:t osallistuvat transkriptiotekijöiden (7SK RNA) tai RNA-polymeraasi II:n (B2 RNA) säätelyyn ja telomeerien ylläpitämiseen.
Kuva 01: snRNA
snRNA:t ovat ei-koodaavia RNA:ita. Ne kuuluvat erittäin runsaan biologisesti aktiivisen RNA:n luokkaan, joka sijaitsee ytimessä. Ne liittyvät aina proteiinimolekyyleihin ja esiintyvät pieninä tuman ribonukleoproteiineina (snRNP). SnRNA:ita on kaksi päätyyppiä, Sm-luokan snRNA ja Lsm-luokan snRNA. U1, U2, U4, U4atac, U5, U7, U11 ja U12 ovat Sm-luokan snRNA:ta, kun taas U6 ja U6atac ovat Lsm-luokan snRNA:ta.
Mikä on snRNP?
snRNP on pieni tuman RNA-molekyyli yhdistettynä proteiineihin. Yleensä jokainen snRNP sisältää yhden snRNA:n ja monia proteiinimolekyylejä. Siksi snRNP:t ovat pieniä ydin-RNA-molekyylejä ja -proteiineja. snRNP:t muodostavat yhdessä monien muiden lisäproteiinien kanssa spliceosomi-nimisen kompleksin, jossa RNA:n silmukointi tapahtuu. snRNP:t tarvitsevat sekä RNA-osan että proteiiniosan silmukoidakseen intronit. RNA-komponentti on vastuussa endonukleaasileikkauksista, koska sillä on entsymaattista aktiivisuutta. On olemassa erilaisia snRNP-tyyppejä, ja ne leikkaavat eri kohdista.
Kuva 02: snRNP spliceosomissa
Splicauksen lisäksi snRNP:t osallistuvat mRNA:iden primääristen transkriptien tuman kypsymiseen, geeniekspression säätelyyn, silmukoinnin luovuttajaan ei-kanonisissa järjestelmissä ja replikaatiosta riippuvien histoni-mRNA:iden 3'-pään prosessoinnissa. On olemassa kaksi erityistä snRNP-ryhmää: pienet nukleolaariset RNP:t (snoRNP:t) ja pienet Cajal-kehon RNP:t (scaRNP:t).
Mitä yhtäläisyyksiä snRNA:n ja snRNP:n välillä on?
- Sekä snRNA:ssa että snRNP:ssä on pieniä ydin-RNA-molekyylejä.
- snRNA:t yhdistyvät proteiineihin muodostaen snRNP:itä.
- Jokainen snRNP sisältää yhden snRNA:n.
- Sekä snRNA:ta että snRNP:tä löytyy eukaryoottisolujen ytimestä.
Mitä eroa snRNA:lla ja snRNP:llä on?
snRNA on pieni ei-koodaava RNA-molekyyli, joka sijaitsee eukaryoottisolun tumassa, kun taas snRNP on yksittäisen snRNA:n ja snRNP-spesifisten proteiinien kompleksi. snRNPS ovat pieniä ydinribonukleoproteiinipartikkeleita. snRNA on vain pieni RNA-molekyyli, kun taas snRNP on snRNA-molekyylin ja tiukasti sitoutuneiden proteiinien kompleksi. Joten tämä on avainero snRNA:n ja snRNP:n välillä.
Alla infografiikka näyttää erot snRNA:n ja snRNP:n välillä taulukkomuodossa.
Yhteenveto – snRNA vs snRNP
snRNA on luokka ei-koodaavia pieniä tuma-RNA:ita, jotka sijaitsevat eukaryoottiytimessä. Ne suorittavat tärkeitä tehtäviä, jotka liittyvät intronien silmukointiin ja muuhun RNA-käsittelyyn. Luonnollisessa tilassa snRNA liittyy proteiineihin ja esiintyy pieninä tuman ribonukleoproteiinipartikkeleina (snRNP:t).snRNP:t, yhdessä monien muiden proteiinien kanssa, osallistuvat silmukointikompleksin muodostukseen RNA:n silmukoinnin suorittamiseksi. Näin ollen tämä tiivistää eron snRNA:n ja snRNP:n välillä.