Avainero kasvien ja eläinten DNA:n erottamisen välillä on se, että kasvien DNA:n uuttamisessa on tarpeen murtaa soluseinä jauhamalla kudos kuivajäässä tai nestetypessä solusisällön vapauttamiseksi eläin-DNA:n uuttamisen aikana, tätä vaihetta ei tarvitse suorittaa, koska eläinsoluilla ei ole soluseinää.
Genominen DNA on kasvi- ja eläinsolujen geneettistä materiaalia. Genominen DNA on ainutlaatuinen jokaiselle yksittäiselle kasville tai eläimelle. Hyvälaatuisen DNA:n erottaminen on edellytys molekyylitutkimukselle. Organismien DNA:ta uutetaan tunnistamista, sairauksien diagnosointia, tiettyjen geenien ja sekvenssien havaitsemiseen, oikeuslääketieteellisiin tarkoituksiin, isyystestausta, genomin sekvensointia ja lääkekehitystä varten jne. DNA:n erotusmenetelmä vaihtelee solutyypistä riippuen – onko kyseessä eläinsolu vai kasvisolu.
Mitä on kasvi-DNA:n erottaminen?
DNA kasvisoluista uutetaan erilaisia molekyylitutkimuksia varten. Se vaaditaan ehjän, puhtaan genomisen DNA:n erottamiseksi. Tästä syystä on olemassa erilaisia DNA-uuttoprotokollia, jotka eroavat eläinsoluista peräisin olevista DNA-uuttoprotokollista. Tämä johtuu siitä, että kasvisoluissa on soluseinä, joka pitäisi rikkoa solusisällön poistamiseksi.
Uutto tehdään yleensä jauhamalla kasvikudokset kuivajäässä tai nestetypessä huhmareella ja survimella. Sitten solukalvot hajotetaan ja solusisältö viedään uuttopuskuriin. Tämä tehdään yleensä pesuaineella; SDS (natriumdodekyylisulfaatti) tai CTAB (setyylitrimetyyliammoniumbromidi) -puskuri. Vapautunut DNA suojataan endogeenisiltä nukleaaseilta käyttämällä kelatoivaa ainetta, kuten EDTA:ta. Lisäksi proteiinit erotetaan DNA:sta käyttämällä kloroformia tai fenolia.
Kuva 01: Kasvien DNA:n erottaminen
Kasvit syntetisoivat polysakkarideja ja polyfenoleja, mukaan lukien flavonoideja ja muita sekundaarisia metaboliitteja. Nämä yhdisteet häiritsevät puhtaan genomisen DNA:n uuttamista. Siksi useimmat kasvien DNA:n uuttoprotokollat sisältävät toisen vaiheen, kuten cesiumkloridin tiheysgradienttitekniikan näiden yhdisteiden poistamiseksi.
Useimmat DNA-uuttoprotokollat suosittelevat tuoreiden lehtinäytteiden käyttöä DNA:n uuttamiseen. Jotkut menetelmät eivät sisällä vaarallisia kemikaaleja, kuten nestemäistä typpeä ja fenolia. CTAB (Cetyl trimethylammonium bromide) -protokolla on suosittu kasvien DNA:n uuttoprotokolla, joka helpottaa korkealaatuisen kasvin genomisen DNA:n uuttamista. Se on yksinkertainen, turvallinen, luotettava ja kustannustehokas menetelmä kasvien DNA:n erottamiseen. Useimmat muut menetelmät ovat muunneltuja versioita CTAB-menetelmästä.
Mitä on eläinten DNA:n erottaminen?
Eläinten DNA:n erottaminen on genomisen DNA:n uuttamista eläinsoluista molekyylianalyysiä varten. Toisin kuin kasvien DNA:n uuttaminen, soluseinän hajoaminen ei ole välttämätöntä eläinsoluille, koska niiltä puuttuu soluseinä. Verisolut ovat yleisin eläinsolutyyppi, jota käytetään eri tarkoituksiin.
Kuva 02: DNA:n erottaminen
Fenoli-kloroformimenetelmä on yksi parhaista vaihtoehdoista verisoluille. DNA:n saanto ja laatu ovat korkeat, kun DNA uutetaan tästä menetelmästä. Se on neste-neste-DNA-uuttoprotokolla, ja tämä menetelmä erottaa DNA-molekyylit niiden liukoisuuden perusteella sekoittumattomiin liuoksiin. Fenoli, kloroformi ja isoamyylialkoholi ovat tämän menetelmän kolme tärkeintä ainesosaa.
Mitä yhtäläisyyksiä kasvien ja eläinten DNA:n erottamisen välillä on?
- Sekä kasvien että eläinten DNA:n erottamisen aikana solukalvot on rikottava.
- DNA tulee suojata endogeenisiltä nukleaaseilta.
- Lisäksi DNA:n leikkautuminen tulisi estää.
- Kaupallisia sarjoja on saatavilla kasvien ja eläinten DNA:n uuttamiseen.
- Useimmat kasvien ja eläinten DNA:n erotusmenetelmät vaativat jatkuvaa modifiointia ja standardointia.
Mitä eroa on kasvien ja eläinten DNA:n erottamisella?
Avainero kasvien ja eläinten DNA:n erottamisen välillä on, että kasvien DNA:n uuttaminen vaatii kasvikudoksen jauhamista kuivajäässä tai nestetypessä soluseinän rikkomiseksi, kun taas eläinten DNA:n uuttaminen ei vaadi tätä vaihetta, koska ne ovat eläimiä. soluilla ei ole soluseinää. CTAB-menetelmä on yksi parhaista menetelmistä kasvien DNA:n uuttamiseen, kun taas fenoli-kloroformimenetelmä on yksi parhaista menetelmistä eläinten DNA:n uuttamiseen.
Alla infografiikka taulukoi kasvien ja eläinten DNA:n erottamisen erot.
Yhteenveto – Kasvien vs. eläinten DNA:n erottaminen
DNA:n erottamiseen eri solutyypeistä on saatavilla erilaisia menetelmiä. Siksi kasvien DNA:n uuttoprotokollat eroavat eläinsolujen DNA:n uuttoprotokollasta. Kasvien DNA:n uuttaminen edellyttää soluseinän, solukalvon ja tumakalvon rikkomista, kun taas eläin-DNA:n uuttaminen vaatii solukalvon ja tumakalvon hajoamista. Vielä tärkeämpää on, että eläinsolujen DNA:n uuttaminen ei vaadi soluseinien rikkomista jauhamalla kuivajäässä tai nestemäisessä typessä. Siten tämä on avainero kasvien ja eläinten DNA:n erottamisen välillä.
