Avainero – geenisekvensointi vs DNA-sormenjälki
DNA:n sekvensointi on tärkeä tekniikka molekyyligenetiikassa, jossa määritetään tietyn DNA-sekvenssin nukleotidisekvenssi tai organismin koko genomi. Näin tutkija tai diagnostikko voi määrittää DNA-sekvenssien mutaatiot ja erottaa organismit toisista niiden geneettisen koostumuksen perusteella. Geenisekvensointi on geenin tai DNA-fragmentin sekvensointimenettely Sanger-sekvensoinnin tai seuraavan sukupolven sekvensoinnin avulla. DNA-sormenjälkien ottaminen sisältää tekniikan, joka tunnetaan nimellä Restriction Fragment length polymorphism (RFLP), jossa kahden tai useamman kohteen DNA-näytteet fragmentoidaan ja analysoidaan henkilön henkilöllisyyden määrittämiseksi. Tämä on avainero geenisekvensoinnin ja DNA-sormenjälkien välillä.
Mikä on geenisekvensointi?
Geenisekvensointi tehdään tietyn geenin nukleotidisekvenssin määrittämiseksi. Jos koko genomi sekvensoidaan, sitä kutsutaan koko genomin sekvensoinniksi. Aluksi geenisekvensointi tehtiin kemiallisilla menetelmillä, joissa käytettiin haitallisia kemikaaleja, kuten pyridiiniä; tämä tekniikka lopetettiin pian kokeen myrkyllisyyden vuoksi. Tällä hetkellä geenin sekvensointi tehdään enimmäkseen Sanger-sekvensointina tunnetulla menetelmällä, jossa hyödynnetään ketjun lopetusvaihetta deoksiribonukleiinihapoilla. Reaktio suoritetaan neljässä erillisessä koeputkessa, joissa jokaisessa koeputkessa aluke leimataan käyttämällä fluoresenssimarkkeria, joka lopulta määrittää tietyn fragmentin sekvenssin. Automaattinen Sanger-sekvensointi käyttää ilmaisinta fluoresenssisignaalien havaitsemiseen ja tulosten antamiseen.
Kuva 01: DNA-sekvensointi
Seuraavan sukupolven sekvensointi on sekvensointimenetelmien viimeisin kehitystyö ja korkean suorituskyvyn tekniikka, joka vastaa 1000 Sanger-sekvensointireaktion suorittamista kerralla. Seuraavan sukupolven sekvensoinnin pääominaisuudet ovat;
- Erittäin rinnakkainen – useita sekvensointireaktioita tapahtuu samanaikaisesti.
- Mikromittakaava – reaktiot ovat pieniä, ja monet voidaan tehdä kerralla sirulla.
- Nopea – koska reaktiot tapahtuvat rinnakkain, tulokset valmistuvat paljon nopeammin.
- Lyhempi pituus – lukemat vaihtelevat tyypillisesti 505050 -700700700 nukleotidin välillä.
Geenisekvensointia käytetään pääasiassa uuden geenin sekvenssin määrittämiseen tai sairaiden tilojen geenin mutaatioiden analysointiin ja sairauksien geneettisen perustan vahvistamiseen. Sitä käytetään myös maatalouden biotekniikan alalla uusien kasvilajikkeiden määrittämiseen ja sellaisten kasvigeenien tunnistamiseen, jotka ovat vastuussa hyödyllisistä agronomisista ominaisuuksista, kuten tuholaisresistenssistä, taudinkestävyydestä ja kuivuudesta.
Mitä DNA-sormenjälki on?
DNA-sormenjälkien otto on tekniikka, jota käytetään pääasiassa oikeuslääketieteellisissä tutkimuksissa oikeuslääketieteelliseen tutkimukseen osallistuvan henkilön henkilöllisyyden vahvistamiseksi. Alkuaikoina DNA-sormenjäljet tehtiin hybridisaatiotekniikalla käyttäen fluoresoivia tai radioleimattuja markkereita. Tällä hetkellä DNA-sormenjäljet tehdään RFLP-tekniikalla. Tämä tekniikka käyttää restriktioentsyymejä, jotka ovat entsyymejä, jotka pystyvät pilkkomaan DNA:ta tietyissä sekvensseissä. Kun kaksi näytettä tuodaan analysoitavaksi, molemmat näytteet pilkotaan samoilla restriktioentsyymeillä fragmenttien saamiseksi. Jos kaksi näytettä ovat samanlaisia, elektroforeesigeelikuvan tulee olla identtinen molemmissa näytteissä. Jos se ei ole samanlainen, geelikuvat eivät ole identtisiä. Siten henkilön henkilöllisyys voidaan varmistaa tällä tekniikalla.
DNA-sormenjälkiä käytetään useimmiten rikospaikan todellisen epäillyn löytämiseen analysoimalla rikospaikalla saatavilla olevia biologisia näytteitä. DNA uutetaan näistä saatavilla olevista näytteistä (hiukset/siemenneste/sylke/veri) ja analysoidaan epäiltyjen DNA-näytteillä todellisen syyllisen määrittämiseksi.
Mitä yhtäläisyyksiä geenisekvensoinnin ja DNA-sormenjälkien välillä on?
- Molemmissa tapauksissa analysoitu näyte on DNA-näyte.
- Elektroforeesia käytetään tulosten määrittämiseen molemmissa tekniikoissa.
Mitä eroa on geenisekvensoinnin ja DNA-sormenjälkien välillä?
Geenisekvensointi vs DNA-sormenjälki |
|
| Geenisekvensointi on prosessi, joka määrittää tietyn geenin tai koko genomin nukleotidisekvenssin. | DNA-sormenjälkien ottaminen sisältää tekniikan, jossa kahden tai useamman kohteen DNA-näytteet fragmentoidaan ja analysoidaan henkilön henkilöllisyyden määrittämiseksi. |
| Teknologian perusta | |
| Geenisekvensoinnissa käytetään sekvensointimenetelmiä, kuten Sanger-sekvensointia tai Next Generation -sekvensointia. | Restriction Fragment Length -polymorfismia käytetään kahden koehenkilön näytteen analysoimiseen DNA-sormenjäljessä. |
| Applications | |
| Geenisekvensointia käytetään pääasiassa geneettisissä tutkimuksissa uusien geenien analysointiin, mutaatioiden tunnistamiseen ja geneettiseen diagnostiikkaan perustuvien johtopäätösten tekemiseen. | DNA-sormenjälkiä käytetään oikeuslääketieteellisissä tutkimuksissa päätelmien tekemiseen epäillyn henkilöllisyydestä. |
Yhteenveto – Geenisekvensointi vs DNA-sormenjälki
Geenisekvensoinnista ja DNA-sormenjäljestä on tullut kaksi suosittua testiä, jotka suoritetaan tietyn geenin karakterisoimiseksi tai tietyn henkilön tunnistamiseksi henkilön geneettisen sormenjäljen avulla. Nämä tekniikat ovat tarkkoja ja nopeita, ja ammattitaitoisen henkilöstön suorittaa ne vahvistettujen tulosten saamiseksi. Ero geenisekvensoinnin ja DNA-sormenjälkien välillä on se, että geenisekvensointi keskittyy geenin tarkan nukleotidijärjestyksen löytämiseen, kun taas DNA-sormenjäljet keskittyvät yksilöiden henkilöllisyyden vahvistamiseen oikeuslääketieteellisissä tutkimuksissa.
Lataa PDF-versio geenisekvensoinnista vs DNA-sormenjäljet
Voit ladata tämän artikkelin PDF-version ja käyttää sitä offline-tarkoituksiin lainaushuomautuksen mukaisesti. Lataa PDF-versio tästä Ero geenisekvensoinnin ja DNA-sormenjälkien välillä
