Avainero konservoidun ja konsensussekvenssin välillä on se, että konservoitunut sekvenssi viittaa samanlaisiin nukleiinihappo- tai aminohapposekvensseihin, joita esiintyy eri tai samoissa lajeissa sukupolvien aikana, kun taas konsensussekvenssi on yleisesti tavattu nukleotidisekvenssi tai löydetty aminohapposekvenssi DNA:n, RNA:n tai proteiinin erittäin konservoituneella alueella.
Organismeilla on samanlaisia ja erilaisia ominaisuuksia. Organismien välisiä suhteita tutkittaessa ja luokittelussa organismien genomi tai geneettinen rakenne on erittäin tärkeä. On joitain nukleotidi- tai aminohapposekvenssejä, jotka ovat yleisiä eri organismien keskuudessa. Konservoitunut sekvenssi on nukleiinihappo- tai aminohapposekvenssi, joka on yhdenmukainen lajien kesken. Siksi ne ovat fylogeneettisesti tärkeitä fylogeneettisiä puita tuottaessa. Konservoiduissa sekvensseissä on spesifisiä nukleotidisekvenssejä, joita löytyy yleisemmin. Ne tunnetaan konsensussekvensseinä.
Mikä on säilytetty sekvenssi?
Konservoitunut sekvenssi on nukleiinihapposekvenssi tai aminohapposekvenssi, joka on samanlainen lajien välillä. Siksi se on johdonmukainen kaikissa lajeissa koko evoluution ajan. Yleensä näitä sekvenssejä ylläpitää luonnonvalinta. Ne pysyvät muuttumattomina kaukana fylogeneettisessä puussa. Näin ollen konservoituneet sekvenssit ovat tärkeitä fylogeneettisten puiden rakentamisessa. Uskotaan, että erittäin konservoituneilla sekvensseillä on usein tärkeä toiminnallinen arvo. Ne ovat hyödyllisiä myös geneettisten sairauksien tunnistamisessa. Konservoituneet sekvenssit voivat kuitenkin olla koodaavia tai ei-koodaavia nukleiinihapposekvenssejä. Lisäksi konservoituneet sekvenssit osoittavat hitaampaa mutaationopeutta. Siksi niiden koostumuksessa on erittäin vähän muutoksia; joskus ne eivät näytä muutoksia sukupolvien aikana.
Kuva 01: Säilytetty sekvenssi
Ribosomien RNA-komponentit ovat läsnä kaikilla elämänaloilla, homeoboksisekvenssit eukaryooteissa ja tmRNA bakteereissa ovat useita esimerkkejä erittäin konservoituneista sekvensseistä. Konservoituneiden sekvenssien tunnistaminen on helppoa, kun käytetään bioinformatiikan lähestymistapoja, erityisesti sekvenssikohdistustyökalua. Lisäksi useiden sekvenssien kohdistus helpottaa konservoituneiden sekvenssien visualisointia.
Mikä on Consensus Sequence?
Konsensussekvenssi on sekvenssi, joka löytyy yleisesti tietyltä DNA:n tai RNA:n konservoituneelta alueelta. Se on hyvin spesifinen nukleotidisekvenssi. Esimerkkinä on konsensussekvenssi kohdassa -10 TATAAT:na (Pribnow-laatikko) E. coli -promoottoreissa, jotka ovat erittäin konservoituneita sekvenssejä. Samalla tavalla on olemassa toinen konsensussekvenssi: TTGACA E. colin promoottoreissa myös -35:ssä. Konsensussekvenssit tunnetaan myös "laatikoina".
Kuva 02: Konsensussekvenssi
DNA:n ja RNA:n lisäksi proteiineissa on myös aminohappojen konsensussekvenssejä. Proteiinia sitovia kohtia edustavat usein konsensussekvenssit. Restriktioentsyymeillä on myös konsensussekvenssejä. Lisäksi silmukointikohdat ovat myös konsensussekvenssejä. Konsensussekvenssit voidaan laskea ja visualisoida bioinformatiikan työkaluilla samoin kuin konservoituneita sekvenssejä.
Mitä yhtäläisyyksiä konservoidun ja konsensussekvenssin välillä on?
- Konservoituneet ja konsensussekvenssit ovat nukleiinihappo- tai aminohapposekvenssejä, jotka ovat yleisiä lajeilla.
- Sekä konservoituneet että konsensussekvenssit voidaan visualisoida bioinformatiikan työkaluilla.
- Ne ovat laaj alti käytössä molekyylibiologiassa.
Mitä eroa on konservoidulla ja konsensussekvenssillä?
Konservoitunut sekvenssi on nukleiinihappo- tai aminohapposekvenssi, joka on johdonmukainen lajien välillä, kun taas konsensussekvenssit ovat hyvin spesifisiä ja yleisesti löydettyjä emäksiä tai aminohappoja tietyllä konservoituneella alueella. Joten tämä on avainero konservoidun ja konsensussekvenssin välillä. Lisäksi toinen ero konservoituneen ja konsensussekvenssin välillä on, että konservoituneet sekvenssit ovat fylogeneettisesti tärkeitä, kun taas konsensussekvenssit ovat usein proteiinia sitovia kohtia, silmukointikohtia, restriktioentsyymin katkaisukohtia jne.
Yhteenveto – konservoitu vs. konsensussekvenssi
Konservoituneet sekvenssit ovat nukleiinihappojen tai proteiinien sekvenssejä, jotka ovat samank altaisia elävien lajien keskuudessa. Histoniproteiinin promoottori, ribosomin sitoutumiskohta, replikaation aloituskohta ja aminohapposekvenssi ovat useita esimerkkejä konservoituneista sekvensseistä. Sitä vastoin konsensussekvenssit ovat spesifisiä emäksiä tai aminohappoja, joita löytyy yleisemmin tietystä konservoituneesta sekvenssistä. -10 laatikkoa, -35 laatikkoa E. coli -promoottoria, proteiinia sitovat kohdat, silmukointikohdat ja restriktioentsyymien tunnistavat kohdat ovat useita esimerkkejä konsensussekvensseistä. Näin ollen tämä on yhteenveto konservoidun ja konsensussekvenssin välisestä erosta.
