Avainero – oligonukleotidi vs polynukleotidi
Nukleotidit ovat perusrakenneyksiköitä, jotka syntetisoivat sekä DNA:n (deoksiriboosinukleiinihappo) että RNA:n (riboosinukleiinihappo) monimutkaisia polymeerimuotoja. Nukleotidit ovat orgaanisia molekyylejä. Ne koostuvat kolmesta perusalayksiköstä: typpipitoisesta emäksestä, pentoosisokerista (riboosi/deoksiriboosi) ja fosfaattiryhmästä. Nukleotideista syntetisoitu DNA ja RNA toimivat olennaisina biomolekyyleina elävässä järjestelmässä. Nukleotideja on monenlaisia, mukaan lukien oligonukleotidit ja polynukleotidit. Oligonukleotidit ovat lyhyitä DNA- ja RNA-segmenttejä, joissa on yksi tai useampi nukleotidimonomeeri, kun taas polynukleotidit ovat biopolymeerejä, joissa on 13 tai useampia nukleotidimonomeeriä. Tämä on avainero oligonukleotidien ja polynukleotidien välillä.
Mikä on oligonukleotidi?
DNA- ja RNA-molekyylien lyhyitä segmenttejä kutsutaan oligonukleotideiksi. Niitä käytetään laaj alti oikeuslääketieteen, genetiikan ja tutkimuksen aloilla. Oligonukleotidit voidaan tuottaa prosessilla, joka tunnetaan nimellä kiinteän faasin kemiallinen synteesi, joka tehdään laboratoriossa. Niitä tuotetaan yksijuosteisina molekyyleinä, joiden sekvenssi on määritelty tiettyyn toimintoon ja joka on tärkeä näkökohta PCR:n (polymeraasiketjureaktion), DNA-mikrosirujen, Southern blot -tekniikan, FISH:n (fluoresoiva in situ -hybridisaatio) ja synteesin yhteydessä. keinotekoiset geenit, tuottavat DNA/RNA-kirjastoja ja toimivat molekyylikoettimina.
Kuva 01: Oligonukleotidi
Oligonukleotidit esiintyvät luonnollisesti mikroRNA:na, RNA:n pieninä molekyyleinä, jotka säätelevät geenien ilmentymistä. Oligonukleotideja voi myös esiintyä suurempien nukleiinihappojen katabolismin vuoksi. Koko molekyyli on karakterisoitu ja kehitetty nukleotiditähteiden sekvenssillä. DNA-fragmenteista koostuvia oligonukleotideja hyödynnetään PCR:ssä, prosessissa, jolla pieni määrä DNA:ta voidaan monistaa miljooniksi kopioiksi. Tässä oligonukleotidit toimivat alukkeina, jotka auttavat DNA-polymeraasin toiminnassa. Kemiallisesti tai luonnollisesti muunneltu nukleosidi, joka tunnetaan nimellä fosforamidiitti, toimii pääkomponenttina oligonukleotidien synteesin aikana. Oligonukleotidijuosteen synteesi tapahtuu 3'-päästä 5'-päähän syklisessä reitissä, jota kutsutaan synteettiseksi sykliksi. Yhden synteettisen syklin päätyttyä yksi nukleotidi lisätään kasvavaan ketjuun.
Mikä on polynukleotidi?
Polynukleotidimolekyyli koostuu 13 tai useammasta nukleotidimonomeerista, ja sitä kutsutaan biopolymeeriksi. Monomeerit sitoutuvat nukleotidiketjuun kovalenttisesti. DNA ja RNA ovat esimerkkejä polynukleotideista. Elävän järjestelmän yksinkertaisin polynukleotidi on RNA (ribonukleiinihappo), joka sisältää pentoosisokeririboosin. RNA koostuu yksijuosteisesta polynukleotidista. Molekyyli koostuu neljästä typpipitoisesta emäksestä, adeniinista, guaniinista, sytosiinista ja urasiilista. RNA:ta on monia eri tyyppejä: mRNA (lähetti-RNA), rRNA (ribosomaalinen RNA), tRNA (siirto-RNA).
Deoksiriboosinukleiinihappo (DNA) on toinen polynukleotidi, joka koostuu pentoosisokerin deoksiriboosista. Typpipitoiset emäkset ovat adeniini, guaniini, tymiini ja sytosiini, ja ne koostuvat kahdesta kierteisesti järjestetystä polynukleotidiketjusta. Adeniinipari tymiinin kanssa ja guaniinipari sytosiinin kanssa. Tätä kutsutaan täydentäväksi peruspariksi.
Kuva 02: Polynukleotidi
Polynukleotideja, sekä DNA:ta että RNA:ta, esiintyy luonnossa elävissä organismeissa, ja niitä käytetään sekä biologisissa että biokemiallisissa kokeissa. Polynukleotideja käytetään PCR- ja DNA-sekvensoinnissa. Ne voidaan syntetisoida keinotekoisesti käyttämällä oligonukleotideja. Polynukleotidijuosteen syntetisoimiseksi ja pidentämiseksi lisätään uusia nukleotideja, ja ketjua pidennetään polymeraasientsyymien läsnä ollessa.
Mitä yhtäläisyyksiä oligonukleotidien ja polynukleotidien välillä on?
- Oligonukleotidit ja polynukleotidit ovat DNA:n ja RNA:n monomeerejä
- Molemmat ovat mukana monissa geneettisissä tekniikoissa, mukaan lukien FISH ja PCR.
Mitä eroa oligonukleotideilla ja polynukleotideilla on?
Oligonukleotidi vs polynukleotidi |
|
| Oligonukleotidi on DNA- tai RNA-fragmentti, joka koostuu yhdestä tai useammasta nukleotidimonomeerista. | Polynukleotidi on biopolymeeri, joka koostuu 13 tai useammasta nukleotidimonomeerista. |
| Koko | |
| Oligonukleotidi on lyhyempi kuin polynukleotidi. | Polynukleotidi on pidempi kuin oligonukleotidi. |
| Toiminto | |
| Oligonukleotideja käytetään geneettisissä tekniikoissa, kuten FISHissa. PCR, DNA-mikroryhmä. | Polynukleotideja käytetään FISH:ssa, PCR:ssä, DNA-sekvensoinnissa jne. |
Yhteenveto – Oligonukleotidit vs polynukleotidit
Nukleotidit ovat tärkeitä biomolekyylejä, jotka osallistuvat tärkeimpiin aineenvaihduntatoimintoihin elävissä järjestelmissä. Ne ovat sekä DNA:n että RNA:n monomeerejä. Nukleotidit ovat orgaanisia molekyylejä ja koostuvat kolmesta perusalayksiköstä: typpiemäksestä, pentoosisokerista ja fosfaattiryhmästä. Oligonukleotidit ja polynukleotidit ovat kaksi tärkeää nukleotidityyppiä. Molempia molekyylejä hyödynnetään erilaisissa geneettisissä tekniikoissa, mukaan lukien FISH ja PCR. Oligonukleotidit koostuvat yhdestä tai useammasta nukleotidimonomeerista, kun taas polynukleotidit koostuvat 13 tai useammasta nukleotidimonomeerista. Oligonukleotidit ovat lyhyempiä kuin polynukleotidit. Tämä on ero oligonukleotidien ja polynukleotidien välillä.
Lataa PDF-versio Oligonukleotidit vs polynukleotidit
Voit ladata tämän artikkelin PDF-version ja käyttää sitä offline-tarkoituksiin lainaushuomautuksen mukaisesti. Lataa PDF-versio tästä Ero oligonukleotidin ja polynukleotidin välillä
