Avainero huojunnan ja rappeutumisen välillä on se, että huojunta viittaa hypoteesiin, joka selittää ei-Watsonin ja crickin pariutumisen kodonien ja antikodonien sitoutumisen aikana mRNA:n ja tRNA:n välillä. Samaan aikaan kodonin degeneraatio on kyky tuottaa yksi aminohappo useista kodoneista.
Molekyylibiologian keskeinen dogma selittää prosessin, jossa funktionaalisten proteiinien ilmentyminen tapahtuu. Ja tämä prosessi on eri vaiheiden sekvenssi, mukaan lukien geneettisen materiaalin replikaatio, jota seuraa DNA-sekvenssin transkriptio mRNA-sekvenssiksi ja mRNA-sekvenssin translaatio aminohapposekvenssiksi.
Käännöksessä huojuntahypoteesin ja kodonin rappeutumisen käsitteillä on tärkeä rooli. Wobble viittaa yksittäisen tRNA:n kykyyn tunnistaa useampi kuin yksi kodoni. Se aiheuttaa kodonien rappeutumista. Degeneraatio on ilmiö, jossa yksi aminohappo voidaan määrittää useammalla kuin yhdellä kodonilla. Yksinkertaisesti sanottuna rappeutuminen viittaa useiden koodien olemassaoloon yhdelle aminohapolle.
Mikä on Wobble?
Häipumishypoteesi on tärkeä hypoteesi, joka selittää ei-Watson Crickin emäsparin, joka tapahtuu käännösprosessin aikana. Tässä translaatio on molekyyliprosessi, joka muuntaa mRNA-kodonin aminohapposekvenssiksi. Tämän hypoteesin mukaan tRNA-antikodonin ensimmäinen emäs pystyy pariutumaan kodonin kolmannen emäksen kanssa mRNA-juosteessa ei-Watsonin ja Crickin pariutumiskuviolla. Siten ne eivät noudata tavanomaisia adeniini-urasiili- tai sytosiini-guaniinisitoutumiskuvioita. Se tunnetaan antikodonin emäksen 1 ja kodonin emäksen 3 huojuvana kuviona.
Kuva 01: Heilutusalustan pariliitos
Vappuparit sisältävät adeniinin ja inosiinin parituksen urasiilin sijaan. Urasiili yhdistyy adeniinin, guaniinin ja inosiinin kanssa. Samoin guaniini ja sytosiini pystyvät myös pariutumaan inosiinin kanssa. Siten tRNA:ssa oleva inosiini on yksi epätavallisista emäksistä, jotka läpikäyvät huojuvan emäsparin muodostumisen.
Haippuava perusparisidos on vähemmän vahva, koska se ei välttämättä seuraa Watsonin ja Crickin täydentävää sidontaa. Lisäksi tämä käsite synnyttää periaatteen geneettisen koodin rappeutumisesta.
Mitä on rappeutuminen?
Geneettisen koodin rappeutuminen viittaa geneettisen koodin redundanssiin. Siten voi olla useita emäspariyhdistelmiä, jotka määrittävät yhden aminohapon. Yleensä organismien kodoni koostuu kolmesta nukleotidiemäksestä. Degeneraation käsitteessä nämä kolme emäsyhdistelmää voivat muuttua, vaikka ne aiheuttavatkin saman aminohapon. Lisäksi kodonia on yli 20, vaikka luonnossa on vain 20 aminohappoa. Siten rappeutuminen selittää useiden kodonien olemassaolon tietylle aminohapolle.
Kuva 02: Degeneraatio
Degeneraatiossa kolmas emäs voi muuttua kahden kodonin välillä. Siten glutamiinihappoa spesifioivat sekä kodonit GAA että GAG, kun taas leusiinia spesifioivat kodonit UUA, UUG, CUU, CUC, CUA ja CUG.
Siksi degeneraation käsite on erittäin tärkeä mutaationopeudessa. Tästä johtuen genomissa tapahtuvat pistemutaatiot voidaan sietää ja näyttävät silti hiljentyneiltä. Siten tämäntyyppiset pistemutaatiot eivät johda mutaatioon tai aminohapposekvenssin muutokseen. Jos pistemutaatiot kuitenkin johtavat koodatun aminohapon vaihteluun, se voi aiheuttaa vakavia genotyyppi- ja fenotyyppimuutoksia.
Mitä yhtäläisyyksiä huojunnan ja rappeutumisen välillä on?
- Molemmat ovat tärkeitä hypoteeseja, jotka esitetään selittämään elämän keskeistä dogmaa suhteessa käännösprosessiin.
- Lisäksi molemmilla prosesseilla on tärkeä rooli kolmen emäsparin kodonikielen kääntämisessä 20 aminohapon sekvenssiksi.
- Nämä prosessit auttavat myös organismien evoluutiomalleja.
Mitä eroa heilunnalla ja rappeutumisella on?
Avainero huojunnan ja rappeutumisen välillä on ensisijaisesti se, että heiluminen johtaa geneettisen koodin rappeutumiseen. Heiluminen viittaa ei-Watsonin ja Crickin pariutumisen seuraamiseen kodonin 3rd-kannan ja antikodonin 1st-kannan välillä. Sitä vastoin rappeutuminen on monien triplettikodoniyhdistelmien kykyä koodata yhtä aminohappoa.
Alla oleva infografiikka tiivistää huojunnan ja rappeutumisen eron.
Yhteenveto – heiluminen vs rappeutuminen
Voimaushypoteesi ja geneettisen koodin rappeutuminen ovat kaksi tärkeää käsitettä käännösilmiössä. Tässä translaatio on prosessi, jossa triplettikodonit muunnetaan aminohapoiksi. Kodonin sitoutumisessa antikodoniin ei-Watsonin ja Crickin emäsparin löytäminen viittaa huojuntahypoteesiin. Tämä kuvataan emästen heilumista kodonin ja antikodonin välillä. Sitä vastoin huojuntaprosessiin johtava geneettisen koodin rappeutuminen on ilmiö, jossa yhtä aminohappoa koodaavat monet erilaiset kodonit. Tämä on siis yhteenveto huojunnan ja rappeutumisen välisestä erosta.
